147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1777 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1777  replicative DNA polymerase I  100 
 
 		 932 aa  1894    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.227569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1688  replicative DNA polymerase I  61.62 
 
 		 910 aa  1119    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1397  DNA polymerase Pol2  48.32 
 
 		 941 aa  811    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.61356  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00560  delta DNA polymerase, putative  31.24 
 
 		 1058 aa  362  1e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63206  DNA polymerase delta catalytic subunit (DNA polymerase III)  30.46 
 
 		 1070 aa  354  4e-96  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.442314 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44713  predicted protein  30.76 
 
 		 982 aa  340  5.9999999999999996e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54677  DNA polymerase delta  29.98 
 
 		 1087 aa  337  5.999999999999999e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07325  catalytic subunit of DNA polymerase delta (Eurofung)  31.25 
 
 		 1044 aa  327  4.0000000000000003e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0530  DNA polymerase Pol2  29.07 
 
 		 781 aa  302  2e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0653  DNA polymerase Pol2  28.33 
 
 		 811 aa  294  5e-78  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1378  DNA polymerase Pol2  28.77 
 
 		 780 aa  294  5e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00266736 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1258  replicative DNA polymerase I  28.52 
 
 		 780 aa  285  3.0000000000000004e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1367  DNA polymerase Pol2  30.1 
 
 		 810 aa  284  5.000000000000001e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.815142  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1316  DNA-directed DNA polymerase  30.36 
 
 		 784 aa  283  9e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2154  DNA polymerase II  29.52 
 
 		 783 aa  283  1e-74  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000768017  hitchhiker  0.000641936 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1049  DNA polymerase II  28.76 
 
 		 783 aa  269  1e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0144376 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0961  DNA polymerase II  28.6 
 
 		 785 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0393  DNA polymerase II  28.4 
 
 		 794 aa  267  5e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1884  DNA polymerase II  29.59 
 
 		 786 aa  267  7e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.115615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1342  DNA polymerase Pol2  28.79 
 
 		 781 aa  261  3e-68  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000227387  normal  0.522725 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1320  DNA polymerase II  27.42 
 
 		 784 aa  239  2e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.4978 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1499  DNA-directed DNA polymerase  26.49 
 
 		 912 aa  228  6e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0798  DNA polymerase B region  27.2 
 
 		 812 aa  219  2e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.189737  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0616  hypothetical protein  25.66 
 
 		 796 aa  201  7e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_297  predicted protein  25.49 
 
 		 990 aa  197  8.000000000000001e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400359  normal  0.313206 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1156  DNA polymerase B region  25.19 
 
 		 818 aa  196  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.809491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1108  DNA polymerase B region  25.22 
 
 		 821 aa  191  4e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.42537  normal  0.497226 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1740  DNA polymerase B region  25.3 
 
 		 795 aa  191  4e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.883106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0177  DNA polymerase B region  25.64 
 
 		 929 aa  187  9e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04130  DNA polymerase alpha catalytic subunit, putative  26.32 
 
 		 1485 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42338  DNA polymerase zeta  25.62 
 
 		 1489 aa  185  3e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04789  DNA polymerase (EC 2.7.7.7) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X142]  24.51 
 
 		 1681 aa  180  9e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.411659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1511  DNA polymerase II  26.29 
 
 		 794 aa  179  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196312 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10755  catalytic subunit of the DNA polymerase alpha-primase complex (Eurofung)  24.42 
 
 		 1459 aa  176  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01452  DNA polymerase II  25.74 
 
 		 790 aa  173  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02749  DNA polymerase II  26.42 
 
 		 816 aa  168  5.9999999999999996e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2142  DNA polymerase II  26.7 
 
 		 789 aa  167  9e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.249301  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2210  DNA polymerase II  26.2 
 
 		 782 aa  166  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.40989 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86981  DNA-directed DNA polymerase alpha Required for mitotic DNA synthesis, premeiotic DNA synthesis, recombination, and full sporulation  25.67 
 
 		 1463 aa  166  3e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03700  zeta DNA polymerase, putative  24.59 
 
 		 1940 aa  164  5.0000000000000005e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.634072  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3546  DNA polymerase II  25.39 
 
 		 789 aa  164  6e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003097  DNA polymerase II  25.68 
 
 		 787 aa  164  7e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122511  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0731  DNA polymerase II  24.79 
 
 		 787 aa  164  7e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.13833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0831  DNA polymerase II  24.51 
 
 		 787 aa  163  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0134615  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3418  DNA polymerase II  25.27 
 
 		 789 aa  163  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2947  DNA polymerase II  25.27 
 
 		 789 aa  163  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.670904 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0607  DNA polymerase II  24.88 
 
 		 820 aa  162  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.427603  normal  0.519282 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3630  DNA polymerase II  25.34 
 
 		 786 aa  160  9e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2894  DNA polymerase B exonuclease  29.2 
 
 		 1345 aa  160  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.182169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3302  DNA polymerase II  25.25 
 
 		 786 aa  160  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2393  DNA polymerase II  25.25 
 
 		 786 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4655  DNA polymerase II  25 
 
 		 791 aa  159  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.230041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0064  DNA polymerase II  25.58 
 
 		 783 aa  159  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.406876  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00062  DNA polymerase II  25.21 
 
 		 783 aa  158  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0104  DNA polymerase II  25.06 
 
 		 783 aa  158  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00061  hypothetical protein  25.21 
 
 		 783 aa  158  4e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2621  DNA polymerase II  25.12 
 
 		 787 aa  158  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00407821  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0062  DNA polymerase II  25.7 
 
 		 783 aa  158  6e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00931565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3539  DNA-directed DNA polymerase  25.46 
 
 		 783 aa  157  7e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3597  DNA polymerase II  25.46 
 
 		 783 aa  157  7e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000326268 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0052  DNA polymerase II  25.46 
 
 		 783 aa  157  8e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2361  DNA polymerase II  26.44 
 
 		 787 aa  157  9e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.168731  normal  0.46504 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0109  DNA polymerase II  25.06 
 
 		 783 aa  157  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.455197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0102  DNA polymerase II  24.85 
 
 		 783 aa  157  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0103  DNA polymerase II  25.06 
 
 		 783 aa  157  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.249231 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0062  DNA polymerase II  25.46 
 
 		 783 aa  156  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0283986  normal  0.967142 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0065  DNA polymerase II  25.09 
 
 		 783 aa  156  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3734  DNA polymerase II  24.51 
 
 		 787 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0929  DNA polymerase II  25.09 
 
 		 816 aa  155  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193818  normal  0.499363 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1999  DNA polymerase II  23.82 
 
 		 786 aa  154  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.449398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2655  DNA polymerase II  26.18 
 
 		 799 aa  153  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.697172  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1060  DNA-directed DNA polymerase  25.08 
 
 		 764 aa  152  3e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.474491  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1619  DNA polymerase II  25.57 
 
 		 809 aa  152  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000233393  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0375  DNA polymerase B region  26.61 
 
 		 1353 aa  151  4e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0570  DNA polymerase II  24.61 
 
 		 790 aa  151  6e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2724  DNA polymerase II  25.83 
 
 		 809 aa  150  9e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000453184  hitchhiker  0.0000581945 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1630  DNA polymerase II  25.37 
 
 		 809 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00018706  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1653  DNA polymerase II  25.83 
 
 		 809 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.112928  normal  0.0896662 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1820  DNA polymerase II  24.63 
 
 		 808 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3819  DNA polymerase II  24.97 
 
 		 788 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2273  DNA polymerase II  25.14 
 
 		 818 aa  147  9e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1514  DNA polymerase II  25.36 
 
 		 797 aa  147  9e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000185404  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1903  DNA polymerase II  24.49 
 
 		 786 aa  145  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.856945 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2629  DNA polymerase II  24.32 
 
 		 810 aa  144  6e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0639534  hitchhiker  0.0000529366 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1567  DNA polymerase II  25.9 
 
 		 793 aa  144  6e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253112  hitchhiker  0.0000162261 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3628  DNA polymerase II  24.35 
 
 		 788 aa  144  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4584  DNA polymerase II  24.55 
 
 		 788 aa  143  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657494  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2629  DNA polymerase II  23.99 
 
 		 792 aa  142  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.085046  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2537  DNA polymerase II  23.11 
 
 		 810 aa  142  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.132688  unclonable  0.0000408112 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3572  DNA polymerase II  24.69 
 
 		 786 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.252391 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0922  DNA-directed DNA polymerase  25 
 
 		 607 aa  141  6e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.434202  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2469  DNA polymerase II  23.46 
 
 		 810 aa  141  7e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00196726  hitchhiker  0.000569309 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40120  DNA polymerase II  26.09 
 
 		 787 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1857  DNA polymerase II  25.09 
 
 		 809 aa  140  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.885669  normal  0.10624 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3658  DNA polymerase II  25.04 
 
 		 792 aa  140  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0583295  normal  0.426144 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3400  DNA polymerase II  25.06 
 
 		 788 aa  138  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2482  DNA polymerase II  25.31 
 
 		 795 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.205655  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3234  DNA polymerase II  25.29 
 
 		 788 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.642975 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1620  DNA-directed DNA polymerase  24.29 
 
 		 882 aa  134  6.999999999999999e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0874595  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5084  DNA polymerase II  25.53 
 
 		 788 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>