More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1769 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1769  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
630 aa  1287    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0143868  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  36.59 
 
 
568 aa  384  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  36.59 
 
 
605 aa  373  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  36 
 
 
568 aa  370  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  36.41 
 
 
571 aa  372  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  35.94 
 
 
574 aa  372  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  35.92 
 
 
557 aa  355  1e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  34.96 
 
 
593 aa  348  2e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0613  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  32.41 
 
 
627 aa  333  5e-90  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  33.39 
 
 
553 aa  326  9e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1895  ABC transporter related  32.51 
 
 
574 aa  316  7e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0190897  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0681  ABC transporter related  31.06 
 
 
641 aa  315  9.999999999999999e-85  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000207792  normal  0.178275 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1787  ABC transporter related  33.56 
 
 
569 aa  314  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1759  ABC transporter related  33.56 
 
 
569 aa  313  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0131  ABC transporter related  30.27 
 
 
585 aa  311  2.9999999999999997e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  31.91 
 
 
576 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  30.16 
 
 
564 aa  307  5.0000000000000004e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  31.86 
 
 
531 aa  297  3e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0563  ABC transporter related  32.84 
 
 
581 aa  296  6e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000790645  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5235  ABC transporter related  31.97 
 
 
581 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2110  ABC transporter related protein  32.61 
 
 
571 aa  291  2e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.147486  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2676  ABC transporter related  31.62 
 
 
587 aa  288  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0827069  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2658  ABC transporter, ATP-binding protein  31.14 
 
 
566 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.558604  hitchhiker  0.000000784356 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1555  ABC transporter  31.46 
 
 
568 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100882  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  30.72 
 
 
568 aa  284  3.0000000000000004e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2666  ABC transporter, ATP-binding protein  31.09 
 
 
566 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  29.49 
 
 
593 aa  281  3e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2499  ABC transporter related  32.32 
 
 
566 aa  281  4e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3450  ABC transporter related  32.75 
 
 
582 aa  279  9e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0164337 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1989  ABC transporter ATP-binding protein  30.36 
 
 
569 aa  277  4e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0915836  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0943  ABC transporter related  31.45 
 
 
547 aa  277  4e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.742397  normal  0.41118 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3111  ABC transporter related protein  31.36 
 
 
540 aa  276  9e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0317761  normal  0.310337 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4409  ABC transporter related  31.03 
 
 
568 aa  275  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466878  normal  0.0210144 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2385  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  30.54 
 
 
566 aa  273  6e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2668  ABC transporter, ATP-binding protein  30.35 
 
 
566 aa  272  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0711129  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3799  ABC transporter related protein  30.33 
 
 
581 aa  272  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0782729  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2641  ABC transporter ATP-binding protein  30.54 
 
 
566 aa  272  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1500  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.34 
 
 
573 aa  270  5.9999999999999995e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2461  ABC transporter ATP-binding protein  30.37 
 
 
566 aa  268  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000483746  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2424  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  30.37 
 
 
566 aa  268  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000216919  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  31.99 
 
 
530 aa  264  4e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1033  ABC transporter related  30.88 
 
 
512 aa  261  3e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.264472  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2709  ABC transporter, ATP-binding protein  30.2 
 
 
566 aa  261  3e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2658  ABC transporter, ATP-binding protein  29.98 
 
 
566 aa  259  7e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828131 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  29.82 
 
 
526 aa  259  7e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1633  ABC transporter, ATP-binding protein  30.24 
 
 
558 aa  259  8e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.104044  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28820  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  29.78 
 
 
641 aa  256  1.0000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2708  ABC transporter related  30.59 
 
 
570 aa  249  9e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2765  ABC transporter related  30.59 
 
 
570 aa  249  9e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  29.14 
 
 
551 aa  244  5e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3041  ABC transporter related  30.27 
 
 
553 aa  243  5e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0282297  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3317  ABC transporter, ATP-binding protein  29.47 
 
 
551 aa  239  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3105  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  29.8 
 
 
551 aa  239  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17470  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  31.98 
 
 
580 aa  238  3e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00927794  normal  0.238843 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3118  ABC transporter ATP-binding protein  29.64 
 
 
553 aa  237  4e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209268  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3364  ABC transporter ATP-binding protein  29.64 
 
 
551 aa  237  4e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.499953  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  29.64 
 
 
551 aa  236  9e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1914  ABC transporter, ATP-binding protein  29.8 
 
 
551 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1973  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.58 
 
 
558 aa  235  1.0000000000000001e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0353  ABC transporter related  29.46 
 
 
628 aa  235  2.0000000000000002e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3008  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  29.14 
 
 
553 aa  233  5e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0368  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.98 
 
 
541 aa  225  2e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3323  ABC transporter, ATP-binding protein  29.35 
 
 
553 aa  224  3e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3430  ABC transporter related  28.24 
 
 
530 aa  219  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.618683  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04650  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.03 
 
 
540 aa  218  2e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2114  ABC transporter-related protein  28.32 
 
 
549 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15960  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  29.6 
 
 
547 aa  207  3e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.221964  normal  0.345832 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0897  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.09 
 
 
277 aa  204  6e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000015399  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0789  ABC transporter related  39.72 
 
 
281 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0847492  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2683  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.47 
 
 
281 aa  201  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.904555  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12820  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  39.45 
 
 
279 aa  199  1.0000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3637  ABC transporter related  40 
 
 
303 aa  199  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000771297  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0713  ABC transporter related  40.73 
 
 
282 aa  197  6e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  40.47 
 
 
541 aa  196  9e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0090  ABC transporter related  26.19 
 
 
574 aa  196  1e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0101014  normal  0.484977 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01480  ABC transporter related  38.37 
 
 
283 aa  195  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000123426  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02430  ABC transporter related  38.37 
 
 
283 aa  195  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.296301  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0793  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.53 
 
 
278 aa  193  8e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1688  ABC transporter related  40.47 
 
 
278 aa  192  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2934  ABC transporter related protein  42.08 
 
 
299 aa  190  5.999999999999999e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.786781  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24060  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  38.93 
 
 
278 aa  189  2e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.569983  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2429  ABC transporter related  40.38 
 
 
276 aa  189  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928129  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3636  ABC transporter related  38.13 
 
 
286 aa  187  4e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375654  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02420  ABC transporter related  40.23 
 
 
273 aa  187  5e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01470  ABC transporter related  40.23 
 
 
273 aa  187  5e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000364129  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  37.99 
 
 
518 aa  187  5e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  46.15 
 
 
548 aa  187  6e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0316  ABC transporter related  37.08 
 
 
277 aa  187  7e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0293906  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  38.78 
 
 
534 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12560  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  39.39 
 
 
283 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1687  ABC transporter related  37.02 
 
 
288 aa  184  3e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0714  ABC transporter related  39.64 
 
 
284 aa  184  3e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0335  ABC transporter related  42.47 
 
 
228 aa  184  4.0000000000000006e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0378349 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1419  ABC transporter related  38.61 
 
 
273 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1391  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.66 
 
 
310 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0500494  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1454  ABC transporter related  37.35 
 
 
288 aa  183  8.000000000000001e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000218483  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2472  ABC transporter related  40.15 
 
 
284 aa  183  8.000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324345  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.34 
 
 
277 aa  183  8.000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1478  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.97 
 
 
277 aa  183  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0140  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.4 
 
 
280 aa  182  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000287993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>