18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1758 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1758  hypothetical protein  100 
 
 
668 aa  1324    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314797  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2011  hypothetical protein  60.86 
 
 
681 aa  803    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3145  hypothetical protein  54.41 
 
 
1096 aa  593  1e-168  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.404826  normal  0.106206 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1690  S-layer-related protein  44.59 
 
 
677 aa  476  1e-133  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.351956  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2016  hypothetical protein  33.21 
 
 
868 aa  278  3e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0853096  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1815  hypothetical protein  37.53 
 
 
617 aa  275  3e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0149  S-layer-like domain-containing protein  32.48 
 
 
1113 aa  267  4e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00285183  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0677  S-layer-like domain-containing protein  31.62 
 
 
720 aa  266  7e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0713079  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1816  hypothetical protein  35.09 
 
 
505 aa  265  2e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0271443  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1034  hypothetical protein  30.68 
 
 
1161 aa  263  6e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2129  S-layer-like domain-containing protein  32.38 
 
 
1304 aa  262  1e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00431402  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1577  hypothetical protein  30.74 
 
 
744 aa  257  4e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0268  S-layer-related protein  30.2 
 
 
867 aa  254  3e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1177  S-layer-like domain-containing protein  25.79 
 
 
874 aa  193  8e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1089  cell surface protein  26.53 
 
 
396 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.415755  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1775  hypothetical protein  22.18 
 
 
586 aa  82.8  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664356  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0611  hypothetical protein  28.83 
 
 
160 aa  65.5  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.896365  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1643  cell surface protein  46 
 
 
1200 aa  53.9  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>