128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1752 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1752  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  100 
 
 		 466 aa  961    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000000395998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1505  phosphoesterase, RecJ-like protein  69.41 
 
 		 461 aa  684    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.393895  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1441  phosphoesterase domain-containing protein  59 
 
 		 469 aa  569  1e-161  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0931  phosphoesterase RecJ domain protein  51.28 
 
 		 469 aa  462  1e-129  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2552  phosphoesterase DHHA1  48.38 
 
 		 473 aa  432  1e-120  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.131524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1059  phosphoesterase RecJ domain protein  46.09 
 
 		 492 aa  434  1e-120  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.228608  normal  0.214918 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1116  phosphoesterase RecJ domain protein  47.39 
 
 		 477 aa  429  1e-119  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000172525  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3679  phosphoesterase RecJ domain protein  47.48 
 
 		 500 aa  429  1e-119  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2008  phosphoesterase RecJ domain protein  45.24 
 
 		 515 aa  409  1e-113  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.389083  n/a   
 
 
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NC_011832  Mpal_2532  phosphoesterase RecJ domain protein  37.5 
 
 		 468 aa  292  9e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2276  phosphoesterase, RecJ-like  34.05 
 
 		 468 aa  261  2e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1828  phosphoesterase domain-containing protein  35.47 
 
 		 466 aa  261  2e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.901941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1684  phosphoesterase, DHHA1  36.29 
 
 		 465 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0121  phosphoesterase domain-containing protein  34.35 
 
 		 427 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.21571  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1347  hypothetical protein  35.65 
 
 		 465 aa  243  7e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.207653  hitchhiker  0.000859058 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0955  phosphoesterase domain-containing protein  36.14 
 
 		 467 aa  233  8.000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.652747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1725  exonuclease RecJ  35.91 
 
 		 467 aa  229  8e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0990  phosphoesterase domain-containing protein  35.45 
 
 		 467 aa  226  9e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.267504  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2111  hypothetical protein  33.55 
 
 		 452 aa  225  1e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2340  phosphoesterase, RecJ-like protein  32.25 
 
 		 437 aa  225  1e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0165031  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0345  phosphoesterase domain-containing protein  34.62 
 
 		 431 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1060  phosphoesterase domain-containing protein  34.13 
 
 		 431 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1566  phosphoesterase domain-containing protein  35.29 
 
 		 431 aa  219  1e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.49427 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0982  phosphoesterase domain-containing protein  34.89 
 
 		 467 aa  217  5e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.257055  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1701  phosphoesterase domain-containing protein  33.33 
 
 		 432 aa  203  4e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00562883  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1509  phosphoesterase DHHA1  31.65 
 
 		 473 aa  203  6e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0271209 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0139  phosphoesterase domain-containing protein  32.15 
 
 		 459 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0769359  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1375  phosphoesterase RecJ domain protein  31.03 
 
 		 420 aa  193  7e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1344  phosphoesterase domain-containing protein  32.6 
 
 		 468 aa  188  1e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.929702  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0514  phosphoesterase domain-containing protein  32.02 
 
 		 465 aa  177  4e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0289  hypothetical protein  25.45 
 
 		 399 aa  155  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0429  phosphoesterase domain-containing protein  26.79 
 
 		 405 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2510  phosphoesterase, RecJ-like  26.33 
 
 		 408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2236  phosphoesterase domain-containing protein  27.75 
 
 		 405 aa  127  3e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2660  phosphoesterase RecJ domain protein  37.09 
 
 		 402 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000971768  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0900  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.24 
 
 		 857 aa  60.5  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000643224  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0860  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.46 
 
 		 644 aa  60.5  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0338  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.59 
 
 		 1035 aa  60.5  0.00000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.191067  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1465  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.09 
 
 		 811 aa  57.4  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0172153  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1308  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.09 
 
 		 655 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_837  single-stranded-DNA-specific exonuclease  27.78 
 
 		 566 aa  56.2  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0560286  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1279  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.09 
 
 		 655 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0964  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  28.32 
 
 		 566 aa  55.5  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.010732  n/a   
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_0855  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  28 
 
 		 566 aa  53.5  0.000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000731526  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0805  single-stranded DNA-specific exonuclease-like protein  26.19 
 
 		 932 aa  52.8  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00139649  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3931  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  23.98 
 
 		 572 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.420242  normal  0.0571898 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0519  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.32 
 
 		 1120 aa  53.1  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.388344  hitchhiker  0.00158278 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12210  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  24.87 
 
 		 814 aa  52  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000495428  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2838  RecJ exonuclease  31.79 
 
 		 566 aa  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.934115  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2554  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  23.96 
 
 		 723 aa  52.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2008  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25 
 
 		 572 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00291083  decreased coverage  0.00122076 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.05 
 
 		 569 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.810057 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0687  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25 
 
 		 574 aa  50.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0449163  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1488  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.21 
 
 		 569 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1082  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.93 
 
 		 569 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0618  exonuclease RecJ  26.54 
 
 		 810 aa  50.1  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.195781  decreased coverage  0.00316903 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2871  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  24.24 
 
 		 654 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0378  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25.4 
 
 		 865 aa  49.3  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4190  exonuclease RecJ  23.76 
 
 		 701 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1032  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25.64 
 
 		 564 aa  48.9  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4244  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.37 
 
 		 569 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3125  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25.27 
 
 		 779 aa  48.9  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1602  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  22.82 
 
 		 823 aa  48.9  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0450793  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0212  hypothetical protein  28.8 
 
 		 335 aa  48.5  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.719126 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1693  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25 
 
 		 757 aa  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1726  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25 
 
 		 757 aa  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.364642  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0897  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  28.29 
 
 		 574 aa  48.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1191  single strand DNA-specific exonuclease  25.94 
 
 		 736 aa  47.8  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1327  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  23.53 
 
 		 599 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.168372 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0881  ssDNA exonuclease RecJ  27.07 
 
 		 577 aa  47.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.796775  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3849  ssDNA exonuclease RecJ  27.07 
 
 		 577 aa  47.8  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.333614 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2206  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  21.78 
 
 		 573 aa  47.8  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.133994  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4073  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  23.71 
 
 		 864 aa  47.4  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00138727  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3611  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.8 
 
 		 801 aa  47.4  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000975309  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0797  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.97 
 
 		 574 aa  47.4  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0080  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  24.37 
 
 		 883 aa  47.4  0.0006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2314  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  24.37 
 
 		 560 aa  47.4  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.843202  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0674  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25.6 
 
 		 583 aa  47.4  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0292  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25 
 
 		 577 aa  47.4  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3226  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.97 
 
 		 574 aa  47  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0922  ssDNA exonuclease RecJ  27.07 
 
 		 577 aa  47  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1477  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.82 
 
 		 569 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.221142  normal  0.152861 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4493  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  24.73 
 
 		 779 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4304  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  24.73 
 
 		 779 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease  24.73 
 
 		 779 aa  46.2  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4153  single-stranded-DNA-specific exonuclease  24.73 
 
 		 779 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1298  RecJ exonuclease  28.57 
 
 		 571 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.882929  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1035  exonuclease RecJ  27.37 
 
 		 569 aa  46.2  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4639  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  24.73 
 
 		 779 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4538  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  24.61 
 
 		 813 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.954569 
 
 
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NC_013205  Aaci_2099  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  22.71 
 
 		 669 aa  46.2  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.339725  n/a   
 
 
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NC_009718  Fnod_0336  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  24.85 
 
 		 989 aa  46.6  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004439  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.75 
 
 		 579 aa  46.6  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_4256  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25.81 
 
 		 773 aa  46.2  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A4528  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  24.73 
 
 		 779 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0707  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  24.73 
 
 		 779 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003910  CPS_4094  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.17 
 
 		 584 aa  45.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004347  SO_0952  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.97 
 
 		 574 aa  45.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008340  Mlg_1819  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.76 
 
 		 577 aa  45.8  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0649366  normal  1 
 
 
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NC_009438  Sputcn32_0892  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.97 
 
 		 584 aa  45.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.488933  n/a   
 
 
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