More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1736 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1736  NifU protein  100 
 
 		 211 aa  432  1e-120  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.495331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0288  nitrogen-fixing NifU-like protein  73.93 
 
 		 211 aa  340  8e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0720  nitrogen-fixing NifU domain protein  52.4 
 
 		 207 aa  205  5e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.985893  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2146  NifU domain-containing protein  59.02 
 
 		 129 aa  156  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.480493  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  50.72 
 
 		 139 aa  145  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26628  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1639  FeS cluster assembly scaffold IscU  50.76 
 
 		 133 aa  144  8.000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  50.76 
 
 		 133 aa  144  8.000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760622 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  50 
 
 		 144 aa  143  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1298  nitrogen-fixing NifU domain protein  51.16 
 
 		 153 aa  142  3e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.114268  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2261  (Fe-S) cluster formation/repair protein  53.12 
 
 		 138 aa  142  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.516044 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  54.03 
 
 		 145 aa  142  4e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  52.46 
 
 		 124 aa  141  6e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  52.76 
 
 		 149 aa  141  7e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4611  scaffold protein  54.62 
 
 		 128 aa  141  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0619086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1673  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  53.72 
 
 		 131 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.439756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4335  scaffold protein  54.62 
 
 		 128 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.258722  hitchhiker  0.00000000135167 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0843  scaffold protein  53.85 
 
 		 128 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0886  scaffold protein  53.85 
 
 		 128 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272267  hitchhiker  0.000151152 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0873  scaffold protein  53.85 
 
 		 128 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.207282 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2179  scaffold protein  51.18 
 
 		 128 aa  139  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000106692  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3510  scaffold protein  53.08 
 
 		 128 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.7882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1238  scaffold protein  53.08 
 
 		 128 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0741  NifU domain-containing protein  53.72 
 
 		 129 aa  138  4.999999999999999e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0206  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  53.39 
 
 		 150 aa  138  6e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00147996  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0436  Fe-S cluster assembly protein NifU  43.9 
 
 		 284 aa  138  6e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2289  scaffold protein  49.61 
 
 		 133 aa  138  6e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0320081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2444  FeS cluster assembly scaffold IscU  47.33 
 
 		 132 aa  137  7.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.463921  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1424  iron-binding protein IscU  53.08 
 
 		 128 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0406  nitrogen-fixing NifU domain protein  48.06 
 
 		 154 aa  137  1e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.54432  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  49.28 
 
 		 277 aa  137  1e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1020  scaffold protein  50.38 
 
 		 133 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.154036  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3998  FeS cluster assembly scaffold IscU  49.61 
 
 		 132 aa  136  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455021  hitchhiker  0.00958668 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  50.81 
 
 		 123 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  50 
 
 		 142 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  50 
 
 		 144 aa  136  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0755  NifU domain-containing protein  53.72 
 
 		 173 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000803052  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  51.64 
 
 		 125 aa  136  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0831  FeS cluster assembly scaffold IscU  51.56 
 
 		 133 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.728943  normal  0.471167 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1488  FeS cluster assembly scaffold IscU  50.75 
 
 		 134 aa  135  5e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000147326  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14740  scaffold protein  50.77 
 
 		 128 aa  134  9e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1300  scaffold protein  50.77 
 
 		 128 aa  134  9e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.129436  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40390  scaffold protein  51.54 
 
 		 128 aa  133  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960049  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0950  scaffold protein  48.87 
 
 		 133 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.850633  normal  0.0311736 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  50.38 
 
 		 129 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2374  FeS cluster assembly scaffold IscU  48.03 
 
 		 133 aa  133  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.161574  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2750  FeS cluster assembly scaffold IscU  50.39 
 
 		 128 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101913  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2178  scaffold protein  48.03 
 
 		 132 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00857387  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0885  scaffold protein  48.87 
 
 		 133 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.541754  normal  0.110729 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  52.31 
 
 		 143 aa  132  3e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41017  Iron sulfur cluster assembly protein 1, mitochondrial precursor (Iron sulfur cluster scaffold protein 1)  46.27 
 
 		 182 aa  132  3.9999999999999996e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.27253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2578  scaffold protein  50 
 
 		 138 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115419  hitchhiker  0.00110358 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1554  scaffold protein  50 
 
 		 137 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.115759  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1457  FeS cluster assembly scaffold IscU  50 
 
 		 135 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  51.64 
 
 		 127 aa  132  5e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2058  FeS cluster assembly scaffold IscU  50.78 
 
 		 135 aa  132  5e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.110723  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1361  FeS cluster assembly scaffold IscU  51.2 
 
 		 142 aa  132  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3626  scaffold protein  50.39 
 
 		 128 aa  131  6e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.284747  normal  0.811196 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1492  FeS cluster assembly scaffold IscU  50.39 
 
 		 128 aa  131  6e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0470  FeS cluster assembly scaffold IscU  51.2 
 
 		 128 aa  131  7.999999999999999e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0220387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0282  scaffold protein  52.38 
 
 		 127 aa  131  7.999999999999999e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  49.59 
 
 		 138 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  48.51 
 
 		 143 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0807  scaffold protein  50 
 
 		 133 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00121678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0718  scaffold protein  51.2 
 
 		 125 aa  130  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2035  scaffold protein  49.61 
 
 		 135 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1059  scaffold protein  49.61 
 
 		 133 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446364  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1277  scaffold protein  49.61 
 
 		 128 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0307655  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1169  scaffold protein  49.61 
 
 		 128 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.310149  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5431  scaffold protein  49.61 
 
 		 135 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0434  scaffold protein  49.61 
 
 		 128 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163571 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5952  scaffold protein  49.61 
 
 		 135 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2142  scaffold protein  49.61 
 
 		 135 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2162  scaffold protein  49.61 
 
 		 135 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.789596  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2125  scaffold protein  49.61 
 
 		 135 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  49.59 
 
 		 124 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02421  scaffold protein  50.39 
 
 		 128 aa  129  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1139  FeS cluster assembly scaffold IscU  50.39 
 
 		 128 aa  129  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2814  scaffold protein  50.39 
 
 		 128 aa  129  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0170927  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2680  scaffold protein  50.39 
 
 		 128 aa  129  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.955816  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1145  scaffold protein  49.61 
 
 		 135 aa  129  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108874  normal  0.133708 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1707  scaffold protein  49.61 
 
 		 135 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1148  scaffold protein  50.39 
 
 		 128 aa  129  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0205414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2732  scaffold protein  49.61 
 
 		 135 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2654  scaffold protein  49.61 
 
 		 135 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.978602  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1488  scaffold protein  49.61 
 
 		 135 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.719074  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2216  scaffold protein  49.61 
 
 		 135 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2682  scaffold protein  50.39 
 
 		 128 aa  129  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.490649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1026  scaffold protein  49.61 
 
 		 133 aa  129  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00834233  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2598  scaffold protein  49.61 
 
 		 135 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0662204  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02385  hypothetical protein  50.39 
 
 		 128 aa  129  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0303  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  50.85 
 
 		 137 aa  129  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.11332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3104  scaffold protein  49.61 
 
 		 135 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.653609  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3761  scaffold protein  50.39 
 
 		 128 aa  129  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000663009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  49.59 
 
 		 122 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01056  scaffold protein  49.6 
 
 		 127 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1105  FeS cluster assembly scaffold IscU  49.22 
 
 		 128 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0168211  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004359  iron-sulfur cluster assembly scaffold protein IscU  49.6 
 
 		 127 aa  129  5.0000000000000004e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.901074  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2916  scaffold protein  49.61 
 
 		 128 aa  128  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.592762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1165  scaffold protein  49.61 
 
 		 128 aa  128  6e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0089491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0278  scaffold protein  49.6 
 
 		 127 aa  128  6e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00334373  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>