236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1690 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1690  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  343  5e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.296344  normal  0.209957 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1450  hypothetical protein  53.8 
 
 		 198 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0533  hypothetical protein  50.58 
 
 		 205 aa  187  5.999999999999999e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.00814053  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0314  hypothetical protein  51.16 
 
 		 205 aa  186  2e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.55405 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1598  hypothetical protein  50.58 
 
 		 205 aa  176  2e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00000000468439  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0383  hypothetical protein  47.09 
 
 		 208 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.46169  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1375  hypothetical protein  46.82 
 
 		 197 aa  141  4e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000270637  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12020  conserved hypothetical protein TIGR00257  40.8 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  37.58 
 
 		 207 aa  118  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  43.31 
 
 		 213 aa  117  6e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  44.78 
 
 		 214 aa  114  6e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1558  protein of unknown function UPF0029  38.41 
 
 		 203 aa  112  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.17892  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  37.06 
 
 		 213 aa  112  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  34.68 
 
 		 212 aa  110  6e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1725  protein of unknown function UPF0029  38.46 
 
 		 204 aa  109  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1554  protein of unknown function UPF0029  41.84 
 
 		 211 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  36.05 
 
 		 211 aa  109  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2078  hypothetical protein  38.99 
 
 		 219 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  37.65 
 
 		 211 aa  108  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3669  protein of unknown function UPF0029  40 
 
 		 192 aa  108  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253627  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0876  protein of unknown function UPF0029  36.75 
 
 		 203 aa  108  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.196068 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  37.58 
 
 		 211 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  36.69 
 
 		 212 aa  108  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  38.24 
 
 		 210 aa  107  7.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  37.87 
 
 		 211 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0111  protein of unknown function UPF0029  35.83 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5363  conserved hypothetical protein TIGR00257  37.28 
 
 		 211 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5046  hypothetical protein  37.28 
 
 		 211 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4876  hypothetical protein  37.28 
 
 		 211 aa  105  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4891  hypothetical protein  37.28 
 
 		 211 aa  105  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5431  hypothetical protein  37.28 
 
 		 211 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5287  conserved hypothetical protein TIGR00257  37.28 
 
 		 211 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000948336 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  42.19 
 
 		 208 aa  105  4e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5641  hypothetical protein TIGR00257  37.87 
 
 		 211 aa  105  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.989891  hitchhiker  0.000000000000266179 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5305  hypothetical protein  37.28 
 
 		 211 aa  104  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0813  protein of unknown function UPF0029  33.14 
 
 		 206 aa  105  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0467204  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  30.41 
 
 		 211 aa  104  8e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0248  hypothetical protein  35.06 
 
 		 196 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.895952  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1413  hypothetical protein  35.98 
 
 		 205 aa  101  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.533633  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2225  protein of unknown function UPF0029  33.91 
 
 		 195 aa  101  6e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0899  protein of unknown function UPF0029  31.21 
 
 		 211 aa  101  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000186376  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1076  protein of unknown function UPF0029  36.62 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0004  protein of unknown function UPF0029  31.07 
 
 		 210 aa  99.4  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.528127 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  35.85 
 
 		 206 aa  99.8  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2757  hypothetical protein  32.16 
 
 		 213 aa  98.6  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0268  protein of unknown function UPF0029  32.91 
 
 		 225 aa  97.8  6e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3177  protein of unknown function UPF0029  31.18 
 
 		 274 aa  97.4  8e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  38.41 
 
 		 205 aa  96.7  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  33.54 
 
 		 205 aa  95.9  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  32.93 
 
 		 195 aa  96.3  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4071  hypothetical protein  32.5 
 
 		 195 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0233425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3596  hypothetical protein  31.87 
 
 		 195 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0789  hypothetical protein  42.68 
 
 		 213 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0502356  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0772  hypothetical protein  42.68 
 
 		 213 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.540579  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  33.54 
 
 		 239 aa  95.5  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl056  putative proline dipeptidase  50 
 
 		 232 aa  95.1  4e-19  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  33.55 
 
 		 198 aa  95.1  4e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1335  hypothetical protein  33.93 
 
 		 221 aa  95.1  4e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000275512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  34.38 
 
 		 198 aa  94.7  6e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  34.67 
 
 		 204 aa  94.7  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001987  hypothetical protein  32.74 
 
 		 207 aa  94.4  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  32.91 
 
 		 194 aa  94.4  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4174  hypothetical protein  32.18 
 
 		 195 aa  94.4  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3325  hypothetical protein  32.18 
 
 		 195 aa  94.4  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0536454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02100  hypothetical protein  31.79 
 
 		 196 aa  94  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.482389 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4192  hypothetical protein  32.18 
 
 		 195 aa  94.4  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1989  protein of unknown function UPF0029  32.5 
 
 		 212 aa  94.4  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0770  hypothetical protein  31.21 
 
 		 197 aa  94  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.634391  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1632  protein of unknown function UPF0029  33.54 
 
 		 201 aa  94  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00461  hypothetical protein  32.74 
 
 		 207 aa  93.6  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  33.33 
 
 		 212 aa  93.6  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0196  elongation factor  32.18 
 
 		 207 aa  93.2  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3126  hypothetical protein  33.33 
 
 		 209 aa  92.4  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1667  hypothetical protein  35.11 
 
 		 186 aa  92  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.494886  normal  0.674111 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  31.97 
 
 		 198 aa  91.7  4e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4048  hypothetical protein  34.9 
 
 		 209 aa  91.7  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1121  hypothetical protein  36.13 
 
 		 192 aa  92  4e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.490437  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  34.65 
 
 		 198 aa  91.7  5e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1820  hypothetical protein  29.65 
 
 		 198 aa  91.7  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0596118  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4412  hypothetical protein  29.24 
 
 		 195 aa  91.3  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  31.21 
 
 		 290 aa  91.7  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  31.98 
 
 		 209 aa  91.3  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1009  hypothetical protein  35.48 
 
 		 191 aa  91.3  6e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0286427  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1849  protein of unknown function UPF0029  32.14 
 
 		 206 aa  90.5  9e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  29.27 
 
 		 213 aa  90.1  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0180  protein of unknown function UPF0029  31.82 
 
 		 216 aa  90.1  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.190284  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  31.71 
 
 		 245 aa  89.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0251  hypothetical protein  34.44 
 
 		 193 aa  89.7  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  30.81 
 
 		 194 aa  89  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  32.65 
 
 		 201 aa  89  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0682  hypothetical protein  30.64 
 
 		 193 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000348018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06100  conserved hypothetical protein TIGR00257  35.77 
 
 		 210 aa  88.6  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1241  hypothetical protein  34.72 
 
 		 197 aa  88.6  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0674  hypothetical protein  30.23 
 
 		 197 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1183  hypothetical protein  44.44 
 
 		 200 aa  87.4  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0258  proline dipeptidase  40.38 
 
 		 195 aa  87  1e-16  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.217199  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  30.23 
 
 		 194 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0944  hypothetical protein  34.13 
 
 		 242 aa  86.3  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5286  protein of unknown function UPF0029  30.13 
 
 		 196 aa  86.3  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2729  hypothetical protein  34.86 
 
 		 206 aa  86.3  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>