224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1663 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1663  hypothetical protein  100 
 
 
429 aa  892    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0983  amidohydrolase  56.97 
 
 
445 aa  476  1e-133  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2074  Xaa-Pro dipeptidase  54.97 
 
 
433 aa  474  1e-132  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1661  hypothetical protein  50.34 
 
 
436 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5232  amidohydrolase  50.12 
 
 
434 aa  399  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0761  hypothetical protein  50.83 
 
 
461 aa  393  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3632  amidohydrolase  46.71 
 
 
447 aa  378  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  46.23 
 
 
486 aa  376  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3588  amidohydrolase  44.68 
 
 
482 aa  363  2e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  43.6 
 
 
478 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0696  amidohydrolase  47.79 
 
 
444 aa  347  2e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1266  amidohydrolase  44.96 
 
 
447 aa  334  2e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2295  putative amidohydrolase  39.79 
 
 
490 aa  311  1e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21530  amidohydrolase, imidazolonepropionase  38.17 
 
 
447 aa  306  3e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0482  amidohydrolase  40.57 
 
 
426 aa  304  2.0000000000000002e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2289  amidohydrolase  42.07 
 
 
456 aa  292  1e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3872  amidohydrolase  41.43 
 
 
419 aa  290  3e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06184  prolidase  38.86 
 
 
420 aa  278  9e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0268  putative Xaa-Pro dipeptidase  38 
 
 
451 aa  275  1.0000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0060  amidohydrolase  37.3 
 
 
440 aa  271  2e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  39.06 
 
 
412 aa  243  3.9999999999999997e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  38.86 
 
 
412 aa  241  2e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3014  amidohydrolase  37.56 
 
 
459 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  37.26 
 
 
416 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  37.79 
 
 
414 aa  227  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  36.81 
 
 
419 aa  216  4e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  37.16 
 
 
391 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1717  amidohydrolase  34.84 
 
 
407 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  34.69 
 
 
413 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  36.57 
 
 
419 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  37.28 
 
 
417 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  34.69 
 
 
413 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  34.19 
 
 
413 aa  211  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  34.16 
 
 
413 aa  210  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  35.31 
 
 
413 aa  209  8e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  34.65 
 
 
420 aa  209  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  33.1 
 
 
411 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  33.49 
 
 
405 aa  208  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  34.92 
 
 
412 aa  206  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  35.55 
 
 
411 aa  206  8e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  34.2 
 
 
425 aa  205  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  35.53 
 
 
411 aa  202  7e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  34.36 
 
 
436 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  31.19 
 
 
408 aa  200  3e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  34.83 
 
 
415 aa  201  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  34.44 
 
 
411 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  34.35 
 
 
425 aa  196  7e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  31.33 
 
 
428 aa  187  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  30.64 
 
 
445 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  34.21 
 
 
405 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  30.95 
 
 
406 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  29.62 
 
 
418 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  30.05 
 
 
403 aa  179  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  32.96 
 
 
443 aa  177  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  31.29 
 
 
445 aa  174  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5218  amidohydrolase  32.77 
 
 
393 aa  172  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.392557  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3412  amidohydrolase  32.32 
 
 
409 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  30.79 
 
 
407 aa  157  3e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  31.87 
 
 
431 aa  157  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  30.77 
 
 
441 aa  156  7e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  31.38 
 
 
461 aa  156  7e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  31.75 
 
 
438 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  29.47 
 
 
426 aa  150  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  31.01 
 
 
426 aa  149  8e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  29.52 
 
 
413 aa  149  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  30.64 
 
 
459 aa  146  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  31 
 
 
430 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  30 
 
 
428 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  31.28 
 
 
409 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  31.28 
 
 
409 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  31.28 
 
 
409 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  29.86 
 
 
407 aa  142  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  28.26 
 
 
433 aa  141  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  29.36 
 
 
405 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  29.82 
 
 
430 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  28.61 
 
 
431 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  30.05 
 
 
414 aa  137  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  29.13 
 
 
440 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  30.63 
 
 
421 aa  135  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  28.09 
 
 
444 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  29.37 
 
 
423 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  30.05 
 
 
417 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  30.05 
 
 
417 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  30.05 
 
 
417 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  30.05 
 
 
421 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  30.29 
 
 
424 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  29.17 
 
 
426 aa  128  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  28.95 
 
 
429 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  29.33 
 
 
402 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  27.02 
 
 
401 aa  127  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  28.75 
 
 
444 aa  126  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2139  amidohydrolase  27.38 
 
 
408 aa  126  9e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  29.08 
 
 
407 aa  126  9e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  27.13 
 
 
422 aa  124  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  27.34 
 
 
409 aa  124  5e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  29.34 
 
 
408 aa  123  8e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  29.34 
 
 
408 aa  123  8e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  29.34 
 
 
408 aa  123  8e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  29.5 
 
 
432 aa  122  9e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  26.94 
 
 
403 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>