230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1661 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1661  hypothetical protein  100 
 
 
436 aa  905    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1663  hypothetical protein  50.34 
 
 
429 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2074  Xaa-Pro dipeptidase  46.21 
 
 
433 aa  377  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0983  amidohydrolase  44.16 
 
 
445 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0696  amidohydrolase  46.37 
 
 
444 aa  353  5e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0761  hypothetical protein  43.03 
 
 
461 aa  333  4e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5232  amidohydrolase  43.16 
 
 
434 aa  331  1e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1266  amidohydrolase  42.49 
 
 
447 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0060  amidohydrolase  41.65 
 
 
440 aa  326  4.0000000000000003e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  42.28 
 
 
478 aa  323  4e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  42.49 
 
 
486 aa  317  3e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2295  putative amidohydrolase  42.21 
 
 
490 aa  316  5e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3632  amidohydrolase  41.86 
 
 
447 aa  311  1e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0482  amidohydrolase  42.22 
 
 
426 aa  311  1e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2289  amidohydrolase  41.78 
 
 
456 aa  301  1e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3872  amidohydrolase  40.33 
 
 
419 aa  300  5e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06184  prolidase  40.19 
 
 
420 aa  296  4e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3588  amidohydrolase  40.76 
 
 
482 aa  294  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0268  putative Xaa-Pro dipeptidase  40.37 
 
 
451 aa  281  2e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21530  amidohydrolase, imidazolonepropionase  38.3 
 
 
447 aa  280  3e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  35.93 
 
 
443 aa  247  3e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  35.14 
 
 
416 aa  247  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  36.02 
 
 
425 aa  244  1.9999999999999999e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3014  amidohydrolase  36.14 
 
 
459 aa  244  3e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  36.98 
 
 
412 aa  243  3.9999999999999997e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  37.03 
 
 
412 aa  243  5e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  36.19 
 
 
405 aa  241  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  36.68 
 
 
413 aa  240  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  34.2 
 
 
413 aa  240  4e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  36.32 
 
 
419 aa  239  5e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  36.07 
 
 
419 aa  239  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  36.97 
 
 
391 aa  234  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  33.97 
 
 
413 aa  231  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.939807 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  34.91 
 
 
445 aa  228  1e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  34.2 
 
 
420 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  33.97 
 
 
436 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  32.71 
 
 
414 aa  229  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  32.62 
 
 
411 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  33.73 
 
 
413 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  33.49 
 
 
408 aa  223  4e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  37.68 
 
 
417 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  33.73 
 
 
413 aa  223  7e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  34.36 
 
 
415 aa  223  7e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  34.75 
 
 
411 aa  223  8e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  33.73 
 
 
411 aa  219  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  33.73 
 
 
411 aa  218  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1717  amidohydrolase  34.27 
 
 
407 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  34.99 
 
 
425 aa  216  7e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  33.49 
 
 
412 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  32.37 
 
 
428 aa  199  7.999999999999999e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  31.18 
 
 
418 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3412  amidohydrolase  30.81 
 
 
409 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  33.33 
 
 
405 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  30.75 
 
 
406 aa  188  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  32.64 
 
 
426 aa  182  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  28.77 
 
 
403 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  30.4 
 
 
445 aa  177  5e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  31.51 
 
 
461 aa  176  7e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5218  amidohydrolase  33.92 
 
 
393 aa  176  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.392557  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  32.56 
 
 
430 aa  173  3.9999999999999995e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  32.87 
 
 
440 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  31.67 
 
 
438 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  33.33 
 
 
426 aa  170  5e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  30.66 
 
 
441 aa  169  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  33.49 
 
 
423 aa  168  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  30.8 
 
 
431 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  29.31 
 
 
426 aa  162  9e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  30.21 
 
 
405 aa  159  8e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  28.41 
 
 
430 aa  157  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  30.46 
 
 
428 aa  156  7e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  31.37 
 
 
431 aa  156  9e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  30.88 
 
 
432 aa  153  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  31.25 
 
 
407 aa  152  8e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  29.85 
 
 
444 aa  152  8.999999999999999e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  31.72 
 
 
421 aa  152  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  29.21 
 
 
433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  30.31 
 
 
407 aa  147  5e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  30.07 
 
 
444 aa  145  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  29.52 
 
 
455 aa  145  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  30.77 
 
 
433 aa  143  7e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  30.62 
 
 
409 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  30.62 
 
 
409 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  30.62 
 
 
409 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  30.66 
 
 
413 aa  139  7.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  29.98 
 
 
432 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  27.73 
 
 
459 aa  138  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1966  amidohydrolase  27.95 
 
 
442 aa  137  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  27.21 
 
 
422 aa  136  6.0000000000000005e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  29.5 
 
 
407 aa  136  7.000000000000001e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0293  amidohydrolase  29.4 
 
 
415 aa  135  1.9999999999999998e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.356604 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  30.45 
 
 
426 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  28.24 
 
 
400 aa  134  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  29.41 
 
 
426 aa  134  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  30.02 
 
 
470 aa  134  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  28.71 
 
 
408 aa  133  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  28.71 
 
 
408 aa  133  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  28.71 
 
 
408 aa  133  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  29.05 
 
 
412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1238  amidohydrolase  29.77 
 
 
444 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0871897  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2139  amidohydrolase  29.57 
 
 
408 aa  130  7.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.018924 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>