More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1649 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  356  9e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  48.03 
 
 		 170 aa  122  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  50.81 
 
 		 142 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 129 aa  89  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  38.94 
 
 		 123 aa  87.4  8e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  38.69 
 
 		 141 aa  87.4  8e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  38.26 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  37.6 
 
 		 121 aa  87  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  37.39 
 
 		 129 aa  86.7  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  38.93 
 
 		 123 aa  86.3  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  37.96 
 
 		 145 aa  84.3  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  37.96 
 
 		 269 aa  84  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  34.11 
 
 		 125 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  36.52 
 
 		 148 aa  83.6  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  34.55 
 
 		 103 aa  83.6  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  38.6 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  36.07 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  40.74 
 
 		 220 aa  80.9  0.000000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  35.34 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  32.28 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  33.97 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  36.09 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  33.86 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  33.61 
 
 		 480 aa  77.8  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  37.17 
 
 		 113 aa  78.2  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1955  rhodanese-like protein  37.41 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000116942  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  37.01 
 
 		 392 aa  77.8  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  32.65 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0428  Rhodanese domain protein  42.11 
 
 		 116 aa  77  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514418  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  34.48 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  38.26 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  33.93 
 
 		 177 aa  75.5  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2634  NADH oxidase/rhodanese-related sulfurtransferase  38.89 
 
 		 105 aa  74.7  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  34.82 
 
 		 113 aa  75.1  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  35.83 
 
 		 229 aa  74.7  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  33.05 
 
 		 480 aa  74.3  0.0000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  39.81 
 
 		 471 aa  73.9  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  30.23 
 
 		 141 aa  73.6  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  30.23 
 
 		 141 aa  73.6  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  35.9 
 
 		 133 aa  73.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  38.6 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  40.59 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4022  rhodanese-like protein  30.91 
 
 		 102 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.203152  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  36.97 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0296  Rhodanese domain protein  38.61 
 
 		 97 aa  73.2  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  34.65 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  31.06 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0984  rhodanese domain-containing protein  41.49 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  39.81 
 
 		 278 aa  70.9  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  34.23 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  31.21 
 
 		 151 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  34.07 
 
 		 141 aa  70.5  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1785  Rhodanese domain protein  39.62 
 
 		 277 aa  70.1  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  34.13 
 
 		 121 aa  70.5  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2850  Rhodanese domain-containing protein  34.55 
 
 		 102 aa  70.5  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 		 137 aa  70.5  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4138  Rhodanese domain protein  30.28 
 
 		 102 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  39.6 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  38.38 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  32.81 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4164  Rhodanese domain protein  30.56 
 
 		 102 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.741744  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  36 
 
 		 277 aa  69.7  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  31.82 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05030  hypothetical protein  35.2 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  29.55 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0505  rhodanese-like domain-containing protein  32.14 
 
 		 169 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2500  rhodanese-like protein  38.98 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  37.62 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  40.91 
 
 		 284 aa  68.9  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  31.97 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3018  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00360973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  37.86 
 
 		 288 aa  68.6  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  36.28 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0533  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.3 
 
 		 568 aa  68.2  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.913571  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  34.82 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2923  Rhodanese domain protein  36.79 
 
 		 99 aa  68.2  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.669081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  36.78 
 
 		 271 aa  68.2  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2803  hypothetical protein  29.85 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002142  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  35.09 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000271125  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3760  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.58 
 
 		 393 aa  68.2  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.62685  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5692  rhodanese domain-containing protein  33.06 
 
 		 221 aa  67.8  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5313  rhodanese-like protein  33.06 
 
 		 221 aa  67.8  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5402  rhodanese domain-containing protein  33.06 
 
 		 221 aa  67.8  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.172427 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  40.2 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  31.72 
 
 		 170 aa  67.4  0.00000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  33.07 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  35.4 
 
 		 460 aa  67.4  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  32.14 
 
 		 185 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1059  Rhodanese domain protein  30.6 
 
 		 141 aa  67  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  34.62 
 
 		 150 aa  67  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  32.71 
 
 		 279 aa  67  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  36.36 
 
 		 117 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  30.22 
 
 		 130 aa  67  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1829  rhodanese domain-containing protein  39.36 
 
 		 225 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835748  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4024  rhodanese domain-containing protein  39.36 
 
 		 225 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125541  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3105  phage shock protein E  34.68 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0576  Rhodanese domain protein  33.63 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00003083  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  34.51 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.9 
 
 		 387 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  36.94 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>