More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1643 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1643  DNA ligase (ATP)  100 
 
 		 549 aa  1098    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0150  ATP-dependent DNA ligase  39.61 
 
 		 598 aa  417  9.999999999999999e-116  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.132861  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1115  ATP-dependent DNA ligase  42.13 
 
 		 584 aa  414  1e-114  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.41546 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1124  ATP-dependent DNA ligase  39.56 
 
 		 603 aa  408  1.0000000000000001e-112  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000816424  normal  0.578001 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0076  ATP-dependent DNA ligase  41.05 
 
 		 584 aa  404  1e-111  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.101904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0068  ATP-dependent DNA ligase  41.49 
 
 		 584 aa  404  1e-111  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00333872  normal  0.197829 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1170  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  39.38 
 
 		 601 aa  400  9.999999999999999e-111  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.51261  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0814  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  40.99 
 
 		 590 aa  401  9.999999999999999e-111  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.389607  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0750  ATP-dependent DNA ligase  40.76 
 
 		 601 aa  397  1e-109  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0780  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  39.53 
 
 		 582 aa  394  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0039  ATP-dependent DNA ligase  40.91 
 
 		 583 aa  392  1e-107  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1400  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  38.31 
 
 		 583 aa  385  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1037  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  38.48 
 
 		 588 aa  379  1e-103  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56005  predicted protein  33.39 
 
 		 719 aa  298  1e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.410085 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04170  DNA ligase, putative  34.05 
 
 		 803 aa  286  5e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1899  DNA ligase (ATP)  33.04 
 
 		 568 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.812103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_51005  predicted protein  31.6 
 
 		 651 aa  265  1e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2723  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  33.15 
 
 		 553 aa  261  3e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.663376 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0844  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  32.86 
 
 		 552 aa  259  1e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357397  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2156  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  34.95 
 
 		 550 aa  258  2e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.521071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1088  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  30.37 
 
 		 567 aa  254  3e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06069  DNA ligase (Eurofung)  32.52 
 
 		 932 aa  252  1e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1898  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  32.7 
 
 		 592 aa  251  2e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16988  predicted protein  33.03 
 
 		 664 aa  246  8e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.606353  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2781  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  31.89 
 
 		 556 aa  239  9e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0864  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  32.05 
 
 		 562 aa  237  3e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0735643  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2882  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  34.51 
 
 		 547 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.812327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0620  hypothetical protein  32.08 
 
 		 546 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0215  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  31.27 
 
 		 573 aa  232  2e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.21738 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0793  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.85 
 
 		 573 aa  230  5e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.027506  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0608  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.54 
 
 		 610 aa  228  2e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0293  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.21 
 
 		 573 aa  228  3e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.33298  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1685  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.04 
 
 		 573 aa  226  1e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1865  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  33.21 
 
 		 548 aa  225  2e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0427  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  32.71 
 
 		 531 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0878  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.73 
 
 		 594 aa  204  3e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0334376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4160  ATP-dependent DNA ligase  31.51 
 
 		 513 aa  201  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.145262  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4475  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  30 
 
 		 576 aa  200  5e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4312  ATP-dependent DNA ligase  31.39 
 
 		 513 aa  196  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2438  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  31.92 
 
 		 509 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.126191  normal  0.0460021 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05480  DNA ligase, putative  25.63 
 
 		 944 aa  189  9e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7176  ATP-dependent DNA ligase  29.89 
 
 		 508 aa  184  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.207869 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04883  DNA ligase (Eurofung)  27.62 
 
 		 816 aa  183  9.000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.125619 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1780  ATP-dependent DNA ligase  28.15 
 
 		 520 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1799  ATP-dependent DNA ligase  28.15 
 
 		 520 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.07397  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1846  ATP-dependent DNA ligase  28.15 
 
 		 520 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297739  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4290  ATP-dependent DNA ligase  31.63 
 
 		 513 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4321  ATP-dependent DNA ligase  27.5 
 
 		 511 aa  171  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2344  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27.52 
 
 		 510 aa  167  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.873695  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1425  ATP-dependent DNA ligase  29.08 
 
 		 527 aa  163  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.272318 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3148  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27.02 
 
 		 1017 aa  159  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.331414  normal  0.459978 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4301  ATP-dependent DNA ligase  32.43 
 
 		 519 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.659287 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2025  ATP-dependent DNA ligase  27.58 
 
 		 534 aa  157  7e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189008  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0933  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27.31 
 
 		 522 aa  155  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.399541  normal  0.755434 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2592  ATP-dependent DNA ligase  28.21 
 
 		 507 aa  154  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000184866 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13079  ATP-dependent DNA ligase  28.85 
 
 		 507 aa  152  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4586  ATP-dependent DNA ligase  26.83 
 
 		 517 aa  150  5e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0272  ATP-dependent DNA ligase  28.99 
 
 		 512 aa  149  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.000560558  hitchhiker  0.000258657 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2642  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27.77 
 
 		 592 aa  145  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.750554  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2845  ATP-dependent DNA ligase  29.16 
 
 		 509 aa  145  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0719  ATP-dependent DNA ligase  29.5 
 
 		 537 aa  144  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3810  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  26.53 
 
 		 539 aa  139  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.749991  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26493  predicted protein  24.86 
 
 		 994 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.164071 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4316  ATP-dependent DNA ligase  26.2 
 
 		 503 aa  131  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375111  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0290  ATP-dependent DNA ligase  28.15 
 
 		 550 aa  131  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0096  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  24.77 
 
 		 506 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0228406  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4933  ATP dependent DNA ligase  31.36 
 
 		 442 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00097  DNA ligase 4 (EC 6.5.1.1)(DNA ligase IV)(Polydeoxyribonucleotide synthase [ATP] 4) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BH83]  26.34 
 
 		 1009 aa  128  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0295925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6857  ATP dependent DNA ligase  31.38 
 
 		 530 aa  128  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.924337  normal  0.118478 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3979  ATP-dependent DNA ligase  27.73 
 
 		 532 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.379965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81859  DNA ligase IV  26.02 
 
 		 939 aa  125  3e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0412  ATP dependent DNA ligase  26.86 
 
 		 514 aa  123  7e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.900501  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10585  predicted protein  31.76 
 
 		 337 aa  122  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0068  ATP-dependent DNA ligase  26.1 
 
 		 531 aa  122  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02270  DNA ligase  28.95 
 
 		 530 aa  117  5e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3135  ATP dependent DNA ligase  29.62 
 
 		 584 aa  117  6.9999999999999995e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.519108  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3524  ATP-dependent DNA ligase  26.65 
 
 		 538 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.755693 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0032  ATP-dependent DNA ligase  26.91 
 
 		 536 aa  115  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1583  ATP dependent DNA ligase  29.59 
 
 		 552 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3449  ATP dependent DNA ligase  27.51 
 
 		 544 aa  114  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.422145 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2338  DNA polymerase LigD ligase domain-containing subunit  29.31 
 
 		 321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.738121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2667  ATP-dependent DNA ligase  24.6 
 
 		 532 aa  111  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.256758 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00930  DNA ligase (ATP), putative  24.54 
 
 		 1065 aa  108  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1315  ATP-dependent DNA ligase  24.51 
 
 		 558 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693977  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5292  ATP-dependent DNA ligase  25.55 
 
 		 558 aa  107  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4352  ATP-dependent DNA ligase  29.4 
 
 		 758 aa  107  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07110  ATP-dependent DNA ligase  32.22 
 
 		 847 aa  107  7e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4438  ATP-dependent DNA ligase  29.4 
 
 		 758 aa  107  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0862477 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0803  ATP-dependent DNA ligase  24.81 
 
 		 541 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.117454 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4732  ATP-dependent DNA ligase  29.12 
 
 		 758 aa  106  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1211  ATP-dependent DNA ligase  25.77 
 
 		 562 aa  106  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837533 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1755  ATP dependent DNA ligase  29.11 
 
 		 533 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4915  ATP-dependent DNA ligase  29.04 
 
 		 763 aa  106  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735483  normal  0.531274 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2413  ATP-dependent DNA ligase  26.01 
 
 		 533 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4532  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  30.16 
 
 		 797 aa  105  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.684574  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4898  ATP-dependent DNA ligase  27.81 
 
 		 539 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2562  ATP dependent DNA ligase  26.8 
 
 		 535 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3334  ATP dependent DNA ligase  26.38 
 
 		 532 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6007  ATP-dependent DNA ligase  26.67 
 
 		 539 aa  104  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5248  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  31.8 
 
 		 495 aa  104  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.19885  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>