More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1603 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1603  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 374 aa  772    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1604  geranylgeranyl reductase  53.35 
 
 		 391 aa  385  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  40.44 
 
 		 368 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  32.55 
 
 		 378 aa  164  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  30.59 
 
 		 382 aa  157  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  30.75 
 
 		 375 aa  156  6e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  31.73 
 
 		 389 aa  149  9e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  29.24 
 
 		 387 aa  146  6e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  29.92 
 
 		 385 aa  144  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  27.35 
 
 		 370 aa  133  6.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  29.09 
 
 		 362 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  31.31 
 
 		 379 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1330  geranylgeranyl reductase  29.71 
 
 		 376 aa  127  3e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  27.11 
 
 		 376 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  29.87 
 
 		 384 aa  126  7e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0982  geranylgeranyl reductase  30.1 
 
 		 384 aa  124  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0176875  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2299  geranylgeranyl reductase  27.88 
 
 		 374 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.650791  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  28.9 
 
 		 368 aa  121  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0630  geranylgeranyl reductase  27.91 
 
 		 373 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.685888 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0064  geranylgeranyl reductase  29.94 
 
 		 373 aa  119  9e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.535363  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05841  NAD binding site  26.2 
 
 		 377 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  28.86 
 
 		 384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  30.72 
 
 		 400 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  27.42 
 
 		 398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  28.41 
 
 		 403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2189  geranylgeranyl reductase  29.87 
 
 		 383 aa  110  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0508  geranylgeranyl reductase  26.61 
 
 		 376 aa  110  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  28.93 
 
 		 446 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  29.13 
 
 		 384 aa  108  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  28.26 
 
 		 446 aa  107  5e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  27.45 
 
 		 452 aa  106  7e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1602  geranylgeranyl reductase  32.05 
 
 		 405 aa  105  9e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.157827  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0162  geranylgeranyl reductase  29.01 
 
 		 392 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.555099  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16731  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  28.97 
 
 		 468 aa  104  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  31.4 
 
 		 362 aa  103  3e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2702  geranylgeranyl reductase  28.53 
 
 		 401 aa  103  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0768  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  27.84 
 
 		 446 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  26.37 
 
 		 455 aa  103  6e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  31 
 
 		 394 aa  102  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  25.87 
 
 		 382 aa  102  9e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05461  NAD binding site  22.99 
 
 		 377 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  29.09 
 
 		 394 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  29.09 
 
 		 394 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  31.05 
 
 		 400 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  29.58 
 
 		 398 aa  100  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  27.78 
 
 		 393 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  30 
 
 		 380 aa  100  4e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  27.85 
 
 		 406 aa  100  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  28.53 
 
 		 365 aa  100  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  27.3 
 
 		 393 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10031  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  28.53 
 
 		 449 aa  99.8  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.245076  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  26.79 
 
 		 408 aa  99.4  8e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3528  geranylgeranyl reductase  30.06 
 
 		 394 aa  99.4  8e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.673829 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  27.5 
 
 		 445 aa  99  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0164  geranylgeranyl reductase  28.09 
 
 		 443 aa  98.2  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.620405  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  29.38 
 
 		 418 aa  98.2  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07961  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  28.09 
 
 		 443 aa  98.2  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.253418  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1199  geranylgeranyl reductase  28.57 
 
 		 423 aa  98.2  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1119  geranylgeranyl reductase  30.21 
 
 		 367 aa  98.2  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05761  NAD binding site  23.06 
 
 		 377 aa  98.6  2e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.680324  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  27.66 
 
 		 421 aa  97.8  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1355  geranylgeranyl reductase  29.27 
 
 		 358 aa  97.4  3e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0520333 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  28.88 
 
 		 380 aa  97.4  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  26.72 
 
 		 457 aa  97.1  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1852  NAD binding site  23.72 
 
 		 376 aa  96.3  7e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0520  NAD binding site  23.12 
 
 		 377 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0167  geranylgeranyl reductase  29.79 
 
 		 393 aa  95.9  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05771  NAD binding site  23.72 
 
 		 376 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.161819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3712  geranylgeranyl reductase  30.25 
 
 		 402 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407055  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3481  geranylgeranyl reductase  29.74 
 
 		 374 aa  94.7  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0709  geranylgeranyl reductase  23.58 
 
 		 377 aa  94.4  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  26.36 
 
 		 431 aa  94.4  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  26.56 
 
 		 376 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  30.19 
 
 		 380 aa  92.8  8e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  28.26 
 
 		 380 aa  92  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  25.48 
 
 		 396 aa  91.7  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  27.59 
 
 		 379 aa  91.3  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119498  geranylgeranyl reductase  28.57 
 
 		 462 aa  91.3  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1721  geranylgeranyl reductase  29 
 
 		 401 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889725  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  27.13 
 
 		 403 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  28.61 
 
 		 379 aa  90.5  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  28.26 
 
 		 407 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  26.54 
 
 		 390 aa  90.5  4e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  28.03 
 
 		 423 aa  90.5  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  26.91 
 
 		 405 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  27.61 
 
 		 396 aa  90.1  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  27.9 
 
 		 380 aa  89.4  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0173  geranylgeranyl reductase  26.06 
 
 		 405 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000608264  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1739  geranylgeranyl reductase  29.15 
 
 		 358 aa  88.2  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.539865  normal  0.0147858 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2063  geranylgeranyl reductase  28.76 
 
 		 399 aa  88.6  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.104109 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0178  geranylgeranyl reductase  26.06 
 
 		 405 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  25.87 
 
 		 406 aa  88.6  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  24.46 
 
 		 406 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1304  geranylgeranyl reductase  29.64 
 
 		 400 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0830  geranylgeranyl reductase  27.13 
 
 		 415 aa  87.8  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2391  geranylgeranyl reductase  26.83 
 
 		 375 aa  87  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  27.47 
 
 		 382 aa  86.7  6e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5289  geranylgeranyl reductase  28.47 
 
 		 397 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.683475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  27.81 
 
 		 418 aa  86.7  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  26.01 
 
 		 413 aa  86.7  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>