64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1565 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1565  3-isopropylmalate dehydratase  100 
 
 		 256 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1398  hypothetical protein  55.94 
 
 		 261 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139952  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0414  hypothetical protein  61.33 
 
 		 255 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.270771  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2882  protein of unknown function DUF75  52.05 
 
 		 251 aa  248  7e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.728218 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1007  protein of unknown function DUF75  48.97 
 
 		 250 aa  238  5.999999999999999e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2792  protein of unknown function DUF75  48.18 
 
 		 250 aa  225  6e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.147305  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2052  hypothetical protein  48.72 
 
 		 248 aa  210  2e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1950  hypothetical protein  48.15 
 
 		 252 aa  205  4e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.622804 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0959  protein of unknown function DUF75  47.48 
 
 		 256 aa  204  1e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.405373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0868  protein of unknown function DUF75  50.2 
 
 		 258 aa  203  3e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0921  hypothetical protein  39.84 
 
 		 251 aa  199  5e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1126  hypothetical protein  44.02 
 
 		 251 aa  195  6e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1797  hypothetical protein  40.5 
 
 		 250 aa  195  7e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1058  hypothetical protein  40.62 
 
 		 250 aa  194  2e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0226  hypothetical protein  44.67 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0859  hypothetical protein  40.5 
 
 		 250 aa  192  3e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.776803  hitchhiker  0.00442614 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2504  protein of unknown function DUF75  47.97 
 
 		 255 aa  191  8e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1150  protein of unknown function DUF75  45.92 
 
 		 251 aa  188  7e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.13291  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1297  hypothetical protein  41.56 
 
 		 252 aa  184  8e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.607867 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_466  hypothetical protein  33.04 
 
 		 276 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.841701  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0501  hypothetical protein  33.48 
 
 		 276 aa  108  6e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.686369  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0525  hypothetical protein  32.61 
 
 		 276 aa  106  4e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.902286  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0800  hypothetical protein  30.08 
 
 		 302 aa  94.7  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_787  hypothetical protein  28.57 
 
 		 302 aa  89.4  5e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0926  hypothetical protein  28.9 
 
 		 248 aa  89.4  5e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0916  hypothetical protein  28.93 
 
 		 302 aa  89  7e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.470991  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1086  3-isopropylmalate dehydratase  28.18 
 
 		 248 aa  89  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0198  hypothetical protein  31.12 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2010  hypothetical protein  26.97 
 
 		 237 aa  86.7  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0465  hypothetical protein  29.05 
 
 		 245 aa  86.3  5e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0485311  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0058  hypothetical protein  28.19 
 
 		 244 aa  85.1  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0354366 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0692  protein of unknown function DUF75  30 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.343449 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0720  hypothetical protein  27.9 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1927  hypothetical protein  27.68 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.655814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0007  hypothetical protein  26.42 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.121063  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0721  hypothetical protein  25.3 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.538394  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1741  hypothetical protein  25.2 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0790  protein of unknown function DUF75  29 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1402  hypothetical protein  27.67 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0076  hypothetical protein  25.54 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.656256  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2829  protein of unknown function DUF75  28.76 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.626247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0161  hypothetical protein  23.58 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.110174 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2034  protein of unknown function DUF75  26.07 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1902  protein of unknown function DUF75  27 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.180772  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0583  hypothetical protein  22.42 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0342  protein of unknown function DUF75  24.9 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5826  protein of unknown function DUF75  28.57 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22756  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0667  protein of unknown function DUF75  27.27 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0725  hypothetical protein  23.89 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0888  protein of unknown function DUF75  25.42 
 
 		 311 aa  54.3  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1661  hypothetical protein  22.41 
 
 		 253 aa  52  0.000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.32781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3816  protein of unknown function DUF75  25 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0659933  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0357  hypothetical protein  23.08 
 
 		 247 aa  50.1  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2223  hypothetical protein  25.1 
 
 		 273 aa  49.7  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.37331  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1486  protein of unknown function DUF75  24.58 
 
 		 246 aa  48.9  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.243377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1480  protein of unknown function DUF75  23.78 
 
 		 283 aa  46.6  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2444  protein of unknown function DUF75  22.71 
 
 		 288 aa  46.2  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0765  hypothetical protein  25.53 
 
 		 276 aa  45.8  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.174527  normal  0.0509855 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0774  hypothetical protein  22.73 
 
 		 253 aa  46.2  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.179453  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0906  hypothetical protein  25.43 
 
 		 274 aa  45.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.992976  normal  0.453754 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1998  hypothetical protein  24.28 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20950  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  22.18 
 
 		 306 aa  43.9  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.344012  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1826  hypothetical protein  22 
 
 		 281 aa  42.4  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0638514  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2009  protein of unknown function DUF75  24.45 
 
 		 285 aa  42  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.547664  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>