More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1546 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1546  aspartate aminotransferase  100 
 
 
398 aa  824    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.623747  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1144  aspartate aminotransferase  55.17 
 
 
381 aa  422  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.859107  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4053  aspartate aminotransferase  51.95 
 
 
383 aa  408  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0443  aspartate aminotransferase  50.65 
 
 
384 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1584  aspartate aminotransferase  51.96 
 
 
379 aa  403  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.697592  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0680  aspartate aminotransferase  52.24 
 
 
387 aa  404  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0958  aspartate aminotransferase  52.11 
 
 
381 aa  396  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2192  aspartate aminotransferase  50.66 
 
 
385 aa  390  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3276  aminotransferase  41.28 
 
 
394 aa  301  2e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2674  aminotransferase  43.16 
 
 
393 aa  289  7e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0881  hypothetical protein  39.9 
 
 
385 aa  288  1e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1153  aminotransferase  40 
 
 
398 aa  280  2e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1818  aminotransferase, class I and II  41.38 
 
 
378 aa  279  6e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.11769 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  38.48 
 
 
390 aa  277  3e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_002936  DET1342  aspartate aminotransferase  38.62 
 
 
398 aa  276  4e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1124  aspartate aminotransferase  38.62 
 
 
398 aa  276  4e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0428  aspartate aminotransferase  37.8 
 
 
380 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  37.82 
 
 
397 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0836  hypothetical protein  37.67 
 
 
390 aa  273  3e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149421 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1859  aminotransferase, class I and II  41.87 
 
 
383 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  37.91 
 
 
397 aa  273  5.000000000000001e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  40.47 
 
 
393 aa  272  8.000000000000001e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  39.25 
 
 
387 aa  270  2e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  38.9 
 
 
379 aa  271  2e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2043  hypothetical protein  39.27 
 
 
388 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  38.72 
 
 
389 aa  270  4e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  39.83 
 
 
380 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0931  aminotransferase A  39.55 
 
 
382 aa  268  8.999999999999999e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1626  aminotransferase, class I and II  41.44 
 
 
383 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608674  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  40.45 
 
 
367 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  36.96 
 
 
392 aa  266  4e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  36.71 
 
 
395 aa  266  4e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  38.38 
 
 
370 aa  266  4e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2805  aminotransferase class I and II  37.87 
 
 
393 aa  266  5e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2382  aspartate aminotransferase  37.56 
 
 
388 aa  266  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  36.92 
 
 
392 aa  265  8e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  38.87 
 
 
388 aa  265  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2331  aspartate aminotransferase  37.31 
 
 
388 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  37.37 
 
 
395 aa  265  1e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5438  hypothetical protein  37.5 
 
 
390 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2980  aminotransferase  40.48 
 
 
383 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2696  aminotransferase  37.92 
 
 
393 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.192367  normal  0.916147 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0768  aminotransferase  37.4 
 
 
389 aa  263  3e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00291764  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  36.79 
 
 
387 aa  263  4e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0739  aminotransferase class I and II  37.14 
 
 
400 aa  263  4.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207853  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2183  aminotransferase, class I and II  37.89 
 
 
395 aa  263  4.999999999999999e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.328944  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  36.18 
 
 
401 aa  262  6.999999999999999e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1134  aspartate aminotransferase  37.87 
 
 
387 aa  262  8e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  36.83 
 
 
388 aa  262  8.999999999999999e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0970  aminotransferase, classes I and II  37.4 
 
 
390 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103563  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3104  aminotransferase  37.98 
 
 
398 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  36.46 
 
 
395 aa  260  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  35.99 
 
 
389 aa  261  2e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2582  aminotransferase class I and II  37.33 
 
 
393 aa  261  2e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2243  aminotransferase  35.95 
 
 
399 aa  261  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  36.46 
 
 
395 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  36.71 
 
 
395 aa  261  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  36.46 
 
 
395 aa  260  3e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  36.46 
 
 
395 aa  260  3e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  36.46 
 
 
395 aa  260  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  36.46 
 
 
395 aa  260  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  36.46 
 
 
395 aa  260  3e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  36.46 
 
 
395 aa  259  4e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0890  aminotransferase  37.89 
 
 
398 aa  260  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3750  aminotransferase A  40.22 
 
 
387 aa  259  7e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0664  hypothetical protein  35.6 
 
 
386 aa  259  7e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0616  aminotransferase  37.4 
 
 
397 aa  259  8e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.736327  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  36.46 
 
 
395 aa  258  1e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04129  hypothetical protein  36.65 
 
 
394 aa  257  2e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.926001  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3766  aminotransferase A  39.94 
 
 
387 aa  257  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0767  aminotransferase  37.4 
 
 
393 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1089  hypothetical protein  35.58 
 
 
400 aa  258  2e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.806795  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  39.83 
 
 
387 aa  257  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4027  aminotransferase A  39.94 
 
 
387 aa  257  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4133  aminotransferase A  39.94 
 
 
385 aa  257  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.562408  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  36.91 
 
 
404 aa  257  3e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0945  aminotransferase class I and II  37.82 
 
 
392 aa  256  3e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.090244  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4903  aminotransferase class I and II  38.17 
 
 
392 aa  256  4e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234248  hitchhiker  0.00232672 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2610  aminotransferase class I and II  38.48 
 
 
393 aa  256  5e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208035  normal  0.436935 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1589  aminotransferase class I and II  38.3 
 
 
388 aa  256  7e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.570274  normal  0.997375 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3658  aminotransferase class I and II  36.15 
 
 
387 aa  256  7e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1124  aminotransferase A  39.94 
 
 
387 aa  255  8e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  37.79 
 
 
407 aa  255  8e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  36.62 
 
 
397 aa  255  8e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3480  hypothetical protein  36.65 
 
 
394 aa  255  1.0000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.470485 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1677  aminotransferase class I and II  37.7 
 
 
392 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.206654  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1189  aminotransferase class I and II  35.58 
 
 
376 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00616768  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4060  aminotransferase A  39.66 
 
 
387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3918  aminotransferase A  39.66 
 
 
387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3474  aminotransferase class I and II  37.64 
 
 
393 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.151006 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0742  hypothetical protein  37.5 
 
 
390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107858  hitchhiker  0.00000000116369 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3951  aminotransferase class I and II  35.9 
 
 
387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  0.350416 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4803  hypothetical protein  36.17 
 
 
390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0396768  hitchhiker  0.00689521 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4225  aminotransferase A  39.66 
 
 
387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  39.44 
 
 
390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2938  aminotransferase  33.67 
 
 
396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0401  aminotransferase class I and II  38.65 
 
 
395 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0552062  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1844  L-aspartate aminotransferase  35.1 
 
 
399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716649  normal  0.149603 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3584  hypothetical protein  36.7 
 
 
393 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2710  aminotransferase A  38.94 
 
 
387 aa  253  3e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>