More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1495 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02583  DNA mismatch repair protein  41.44 
 
 		 853 aa  636    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.858461  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0955  DNA mismatch repair protein MutS  41.44 
 
 		 853 aa  636    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  42.05 
 
 		 859 aa  673    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  43.58 
 
 		 858 aa  726    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  47.17 
 
 		 871 aa  797    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1626  DNA mismatch repair protein MutS  40.89 
 
 		 857 aa  655    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.25405 
 
 
-
 
NC_002950  PG0095  DNA mismatch repair protein MutS  40.59 
 
 		 891 aa  662    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0480084 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  40.45 
 
 		 862 aa  661    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  42.67 
 
 		 873 aa  725    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  42.23 
 
 		 854 aa  664    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1169  DNA mismatch repair protein MutS  49.5 
 
 		 864 aa  819    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.29255 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  40.97 
 
 		 856 aa  638    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  42.5 
 
 		 892 aa  688    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4137  DNA mismatch repair protein MutS  41.46 
 
 		 872 aa  642    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757749  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3292  DNA mismatch repair protein MutS  41.25 
 
 		 851 aa  638    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1723  DNA mismatch repair protein MutS  40.78 
 
 		 855 aa  662    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  40.4 
 
 		 853 aa  657    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4058  DNA mismatch repair protein MutS  40.78 
 
 		 855 aa  660    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  42.38 
 
 		 892 aa  689    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  42.58 
 
 		 890 aa  691    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  42.29 
 
 		 894 aa  688    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  42.5 
 
 		 890 aa  688    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  40.93 
 
 		 883 aa  642    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  0.000000000582755 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  41.99 
 
 		 872 aa  718    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1376  DNA mismatch repair protein MutS  41.01 
 
 		 859 aa  664    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  45.2 
 
 		 870 aa  746    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1179  DNA mismatch repair protein MutS  40.78 
 
 		 880 aa  652    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809456 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  41.99 
 
 		 872 aa  718    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  46.01 
 
 		 882 aa  731    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  41.72 
 
 		 855 aa  675    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 900 aa  1853    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  41.75 
 
 		 928 aa  724    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  53.5 
 
 		 872 aa  927    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  44.36 
 
 		 854 aa  700    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3424  DNA mismatch repair protein MutS  41.36 
 
 		 851 aa  639    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  42 
 
 		 863 aa  673    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1134  DNA mismatch repair protein MutS  40.78 
 
 		 860 aa  648    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  40.96 
 
 		 861 aa  638    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  46.53 
 
 		 870 aa  803    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  40.97 
 
 		 856 aa  639    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  45.97 
 
 		 867 aa  784    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  41.86 
 
 		 873 aa  665    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  40.97 
 
 		 856 aa  638    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  48.39 
 
 		 872 aa  808    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  40.41 
 
 		 904 aa  661    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  40.6 
 
 		 871 aa  650    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  42.38 
 
 		 892 aa  689    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  45.91 
 
 		 872 aa  794    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2247  DNA mismatch repair protein MutS  44.47 
 
 		 882 aa  693    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0873729  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  43.68 
 
 		 881 aa  731    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  39.69 
 
 		 856 aa  646    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  48.55 
 
 		 863 aa  746    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  40.4 
 
 		 859 aa  646    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1698  DNA mismatch repair protein MutS  43.22 
 
 		 882 aa  637    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  42.3 
 
 		 881 aa  717    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  49.94 
 
 		 892 aa  870    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  41.61 
 
 		 854 aa  645    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  45.95 
 
 		 868 aa  786    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0956  DNA mismatch repair protein MutS  41.36 
 
 		 851 aa  637    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  45.11 
 
 		 932 aa  794    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  40.5 
 
 		 887 aa  658    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  42.16 
 
 		 871 aa  674    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  41.69 
 
 		 884 aa  639    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  41.69 
 
 		 884 aa  639    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  43.41 
 
 		 858 aa  713    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  41.31 
 
 		 856 aa  643    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  40.09 
 
 		 862 aa  636    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  66.22 
 
 		 887 aa  1243    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1519  DNA mismatch repair protein MutS  43.42 
 
 		 854 aa  667    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00861946  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  42.44 
 
 		 859 aa  668    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4152  DNA mismatch repair protein MutS  40.89 
 
 		 857 aa  655    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.121513 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  40.77 
 
 		 874 aa  666    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1299  DNA mismatch repair protein MutS  41.01 
 
 		 859 aa  641    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.537227  hitchhiker  0.00000000408163 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0979  DNA mismatch repair protein MutS  41.44 
 
 		 853 aa  636    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.462533 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  43.88 
 
 		 882 aa  733    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  40.44 
 
 		 872 aa  667    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  46.59 
 
 		 870 aa  826    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  40.18 
 
 		 851 aa  645    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1437  DNA mismatch repair protein MutS  40.7 
 
 		 905 aa  644    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.402439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3263  DNA mismatch repair protein MutS  39.62 
 
 		 889 aa  641    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3211  DNA mismatch repair protein MutS  40.94 
 
 		 853 aa  641    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.864311  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0147  DNA mismatch repair protein MutS  44.16 
 
 		 856 aa  700    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.692226  normal  0.372979 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  43.86 
 
 		 910 aa  749    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  46.4 
 
 		 910 aa  747    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0005  DNA mismatch repair protein MutS  40.29 
 
 		 856 aa  639    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3645  DNA mismatch repair protein MutS  42.47 
 
 		 901 aa  669    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.473403 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  41.07 
 
 		 861 aa  637    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  40.85 
 
 		 861 aa  635    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  41.27 
 
 		 878 aa  650    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  42.33 
 
 		 861 aa  661    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  45.44 
 
 		 859 aa  764    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  41.96 
 
 		 868 aa  657    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2871  DNA mismatch repair protein MutS  41.44 
 
 		 853 aa  636    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  41.61 
 
 		 855 aa  674    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1216  DNA mismatch repair protein MutS  48.56 
 
 		 903 aa  808    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0405457 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  44.28 
 
 		 857 aa  696    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1576  DNA mismatch repair protein MutS  43.54 
 
 		 854 aa  678    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0068  DNA mismatch repair protein MutS  39.73 
 
 		 852 aa  639    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  43.14 
 
 		 895 aa  707    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  48.17 
 
 		 857 aa  820    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>