More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1485 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  100 
 
 		 184 aa  370  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  77.47 
 
 		 1120 aa  278  3e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  78.02 
 
 		 575 aa  278  4e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  80.23 
 
 		 978 aa  277  5e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  80.23 
 
 		 1842 aa  276  1e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  78.57 
 
 		 2036 aa  275  3e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  75 
 
 		 713 aa  273  9e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  78.02 
 
 		 2122 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  82.93 
 
 		 1882 aa  272  2.0000000000000002e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  76.92 
 
 		 1300 aa  271  4.0000000000000004e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  79.07 
 
 		 1682 aa  271  4.0000000000000004e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  83.54 
 
 		 1969 aa  270  1e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  79.89 
 
 		 547 aa  269  1e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  74.05 
 
 		 675 aa  268  2e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  77.47 
 
 		 1241 aa  268  2e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  76.37 
 
 		 2272 aa  266  1e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  77.91 
 
 		 2000 aa  266  1e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  73.6 
 
 		 679 aa  260  6e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  72.93 
 
 		 669 aa  259  1e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  77.25 
 
 		 791 aa  258  3e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  73.45 
 
 		 685 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  71.58 
 
 		 581 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  76.54 
 
 		 561 aa  244  4.9999999999999997e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  73.22 
 
 		 658 aa  243  8e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  68.51 
 
 		 560 aa  243  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  74.39 
 
 		 551 aa  239  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  72.39 
 
 		 735 aa  229  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  71.95 
 
 		 752 aa  228  3e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  66.46 
 
 		 615 aa  218  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  65.75 
 
 		 859 aa  218  3.9999999999999997e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  64.6 
 
 		 644 aa  209  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  67.08 
 
 		 1094 aa  203  9e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  54.86 
 
 		 3295 aa  189  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  53.41 
 
 		 2554 aa  186  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  55.69 
 
 		 1667 aa  185  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  54.86 
 
 		 1732 aa  185  4e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  55.69 
 
 		 519 aa  181  4.0000000000000006e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  54.17 
 
 		 528 aa  179  2e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  51.38 
 
 		 1361 aa  179  2e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  57.58 
 
 		 910 aa  178  4.999999999999999e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  55.76 
 
 		 530 aa  176  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  54.71 
 
 		 1236 aa  175  3e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  49.72 
 
 		 1356 aa  174  5e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  53.29 
 
 		 1282 aa  173  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  48.09 
 
 		 1862 aa  167  8e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  53.8 
 
 		 930 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  51.76 
 
 		 963 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  53.09 
 
 		 460 aa  160  9e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  46.47 
 
 		 1931 aa  158  5e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  41.55 
 
 		 848 aa  157  8e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  52 
 
 		 838 aa  157  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  49.67 
 
 		 500 aa  151  5e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  50.87 
 
 		 1328 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  46.01 
 
 		 958 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  49.72 
 
 		 971 aa  150  7e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  50.91 
 
 		 861 aa  150  8e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  41.18 
 
 		 1380 aa  149  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  44.38 
 
 		 1528 aa  149  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  49.16 
 
 		 941 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  45.41 
 
 		 1231 aa  144  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  48.77 
 
 		 719 aa  143  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  41.94 
 
 		 869 aa  142  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  48.77 
 
 		 840 aa  142  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  48.39 
 
 		 996 aa  142  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  45 
 
 		 786 aa  142  4e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  50.67 
 
 		 816 aa  142  4e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  47.2 
 
 		 845 aa  141  6e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  50.94 
 
 		 1531 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  48.48 
 
 		 1311 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  45.51 
 
 		 823 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  45.68 
 
 		 802 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  51.28 
 
 		 1667 aa  139  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  44.71 
 
 		 870 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  46.11 
 
 		 930 aa  137  7e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  46.24 
 
 		 938 aa  136  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  42.61 
 
 		 439 aa  135  4e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0945  PKD  44.58 
 
 		 400 aa  134  7.000000000000001e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0321652  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0639  PKD domain-containing protein  46.06 
 
 		 769 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.292646  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  46.47 
 
 		 819 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  47.24 
 
 		 2552 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  41.62 
 
 		 1387 aa  130  7.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  46.31 
 
 		 819 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2419  PKD domain-containing protein  43.02 
 
 		 684 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  42.29 
 
 		 1783 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1915  cell surface protein  46.11 
 
 		 408 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.586608  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  46.88 
 
 		 777 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  46.58 
 
 		 940 aa  124  7e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  43.45 
 
 		 1189 aa  124  8.000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  46.79 
 
 		 1095 aa  124  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  45.06 
 
 		 443 aa  122  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  40.61 
 
 		 1292 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  44.81 
 
 		 929 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3706  hypothetical protein  41.24 
 
 		 771 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  44.37 
 
 		 1620 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  42.95 
 
 		 1011 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  40.25 
 
 		 1814 aa  108  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0698  cell surface protein  43.14 
 
 		 586 aa  107  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  45.45 
 
 		 918 aa  105  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  40.24 
 
 		 1602 aa  105  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  41.88 
 
 		 2176 aa  104  8e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>