More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1423 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1423  30S ribosomal protein S2  100 
 
 
247 aa  508  1e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.017125 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2393  30S ribosomal protein S2  71.77 
 
 
214 aa  320  9.999999999999999e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000018478  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0478  30S ribosomal protein S2  64.68 
 
 
206 aa  286  2e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2599  30S ribosomal protein S2  60 
 
 
259 aa  268  5e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.11317 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1810  30S ribosomal protein S2  62.5 
 
 
205 aa  268  8e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2514  30S ribosomal protein S2  52.05 
 
 
267 aa  266  2e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0430  ribosomal protein S2  56.41 
 
 
263 aa  265  5.999999999999999e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.748529  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2544  ribosomal protein S2  58.62 
 
 
269 aa  260  2e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1826  30S ribosomal protein S2  59.79 
 
 
268 aa  255  4e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2215  30S ribosomal protein S2  59.79 
 
 
203 aa  254  1.0000000000000001e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2378  30S ribosomal protein S2  58.2 
 
 
202 aa  249  3e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00361654  normal  0.260163 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1237  30S ribosomal protein S2  60.43 
 
 
202 aa  247  1e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.161578  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1302  ribosomal protein S2  57.44 
 
 
199 aa  243  1.9999999999999999e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.29354  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2892  30S ribosomal protein S2  61.26 
 
 
202 aa  231  7.000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00129354  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0759  30S ribosomal protein S2  54.84 
 
 
220 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.817066  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0274  30S ribosomal protein S2  53.4 
 
 
214 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0907  30S ribosomal protein S2  51.61 
 
 
220 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1524  30S ribosomal protein S2  52.63 
 
 
221 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.524219  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0219  30S ribosomal protein S2  51.58 
 
 
221 aa  218  5e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.664063  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1693  30S ribosomal protein S2  51.58 
 
 
221 aa  218  6e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1047  ribosomal protein S2  51.74 
 
 
226 aa  206  4e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.269348  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2140  30S ribosomal protein S2  51.74 
 
 
225 aa  204  1e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000050996  hitchhiker  0.0000667505 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0027  30S ribosomal protein S2  47.13 
 
 
208 aa  184  9e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1104  30S ribosomal protein S2  47.13 
 
 
207 aa  182  6e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0061  30S ribosomal protein S2  45.4 
 
 
208 aa  177  1e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.924609  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0058  30S ribosomal protein S2  43.33 
 
 
206 aa  177  1e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0190126 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0316  30S ribosomal protein S2  40.54 
 
 
207 aa  170  2e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_2002  30S ribosomal protein S2  41.11 
 
 
215 aa  163  3e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03172  40S ribosomal protein S0 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B8F8]  43.33 
 
 
293 aa  162  4.0000000000000004e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.51633 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13682  predicted protein  38.51 
 
 
220 aa  149  4e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76999  ribosomal protein S0A  41.32 
 
 
261 aa  143  2e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.937942  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04340  40S ribosomal protein S0, putative  38.24 
 
 
292 aa  142  7e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.220661  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12355  Ribosomal protein Sa, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  35.88 
 
 
290 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.30496  normal  0.113443 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0957  ribosomal protein S2  24.05 
 
 
280 aa  72.4  0.000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1427  SSU ribosomal protein S2P  23.47 
 
 
232 aa  67.4  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000006523  normal  0.078034 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1316  30S ribosomal protein S2  23 
 
 
255 aa  67  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000315088  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1341  30S ribosomal protein S2  23 
 
 
255 aa  67  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000466794  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0648  ribosomal protein S2  24.06 
 
 
324 aa  67  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.154128  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1238  30S ribosomal protein S2  25.47 
 
 
259 aa  66.6  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000341164  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0563  30S ribosomal protein S2  25 
 
 
301 aa  66.2  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000123477  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3709  30S ribosomal protein S2  23 
 
 
244 aa  65.9  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000237071  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0371  30S ribosomal protein S2  23.72 
 
 
291 aa  65.9  0.0000000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1510  30S ribosomal protein S2  23.95 
 
 
274 aa  65.5  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.0221668 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1006  30S ribosomal protein S2  23.47 
 
 
252 aa  64.7  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000128012  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0823  30S ribosomal protein S2  21.56 
 
 
262 aa  65.1  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2860  30S ribosomal protein S2  24.88 
 
 
253 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1433  30S ribosomal protein S2  24.88 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0086997 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0442  30S ribosomal protein S2  23.5 
 
 
252 aa  63.9  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000051714  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0684  30S ribosomal protein S2  24.31 
 
 
262 aa  64.3  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000550841  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2044  30S ribosomal protein S2  23.94 
 
 
257 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000116198  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1816  30S ribosomal protein S2  23.11 
 
 
257 aa  63.5  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000541904  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  22.54 
 
 
235 aa  63.5  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1419  ribosomal protein S2  23.47 
 
 
233 aa  63.5  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000375862  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1032  SSU ribosomal protein S2P  23 
 
 
238 aa  62.8  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000205725  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2455  30S ribosomal protein S2  22.54 
 
 
255 aa  63.2  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1921  30S ribosomal protein S2  23.81 
 
 
267 aa  62.8  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.7747799999999994e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0105  30S ribosomal protein S2  23.36 
 
 
255 aa  62.8  0.000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000131996  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1966  ribosomal protein S2  24.17 
 
 
251 aa  62.4  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2306  30S ribosomal protein S2  25 
 
 
276 aa  62.4  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0164  30S ribosomal protein S2  23.39 
 
 
262 aa  62  0.000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000119331  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1049  30S ribosomal protein S2  21.6 
 
 
264 aa  62  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0905437  normal  0.331293 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2347  30S ribosomal protein S2  22.62 
 
 
291 aa  62  0.000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000118359  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1780  30S ribosomal protein S2  23.7 
 
 
243 aa  62  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000158872  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1848  ribosomal protein S2  23.94 
 
 
288 aa  62  0.000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0363359  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1548  30S ribosomal protein S2  24.88 
 
 
259 aa  62  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.403357 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0166  30S ribosomal protein S2  23.39 
 
 
260 aa  62  0.000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000940316  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0377  30S ribosomal protein S2  21.62 
 
 
281 aa  61.6  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07650  ribosomal protein S2  23.29 
 
 
262 aa  61.6  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1398  SSU ribosomal protein S2P  25 
 
 
306 aa  61.6  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000184086  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0882  ribosomal protein S2  23.47 
 
 
236 aa  61.2  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2680  30S ribosomal protein S2  22.13 
 
 
246 aa  60.5  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000034456  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3868  30S ribosomal protein S2  23.47 
 
 
233 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000560898  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1832  30S ribosomal protein S2  23.08 
 
 
256 aa  60.8  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000152831  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0026  30S ribosomal protein S2  33.33 
 
 
351 aa  60.8  0.00000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3678  30S ribosomal protein S2  23.47 
 
 
233 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000860084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3568  30S ribosomal protein S2  23.47 
 
 
233 aa  60.5  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.7831e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3586  30S ribosomal protein S2  23.47 
 
 
233 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3965  30S ribosomal protein S2  23.47 
 
 
233 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2708  30S ribosomal protein S2  23.47 
 
 
257 aa  60.8  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52443  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3839  30S ribosomal protein S2  23.47 
 
 
233 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.22661e-62 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1141  30S ribosomal protein S2  22.54 
 
 
235 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000168885  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0801  30S ribosomal protein S2  23.35 
 
 
271 aa  61.2  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000778728  hitchhiker  8.51058e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3874  30S ribosomal protein S2  23.47 
 
 
233 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000491144  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_321  ribosomal protein S2  23.39 
 
 
245 aa  60.1  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000206427  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1978  30S ribosomal protein S2  23 
 
 
232 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000338661  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0926  30S ribosomal protein S2  22.07 
 
 
257 aa  59.3  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148572  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1199  30S ribosomal protein S2  23 
 
 
258 aa  58.9  0.00000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0195465  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3925  30S ribosomal protein S2  23 
 
 
233 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000230027  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1318  30S ribosomal protein S2  23 
 
 
233 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000762012  hitchhiker  4.07369e-17 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0359  30S ribosomal protein S2  22.94 
 
 
245 aa  58.5  0.00000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000354346  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0377  30S ribosomal protein S2  22.94 
 
 
245 aa  58.2  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000247942  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2376  ribosomal protein S2  22.48 
 
 
261 aa  58.2  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3650  30S ribosomal protein S2  22.54 
 
 
233 aa  58.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2733  ribosomal protein S2  22.62 
 
 
271 aa  58.5  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36757e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0975  SSU ribosomal protein S2P  22.69 
 
 
260 aa  58.2  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2479  30S ribosomal protein S2  22.54 
 
 
233 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000168536  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0474  30S ribosomal protein S2  22.54 
 
 
304 aa  57.8  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000536253  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1661  30S ribosomal protein S2  23 
 
 
235 aa  57  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151826  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0606  ribosomal protein S2  23 
 
 
244 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185332  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1941  ribosomal protein S2  22.18 
 
 
262 aa  57.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>