48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1413 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1413  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  629  1e-179  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00553932  normal  0.0166848 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1403  hypothetical protein  97.48 
 
 		 318 aa  617  1e-175  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209526  normal  0.367043 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3529  hypothetical protein  32.57 
 
 		 327 aa  190  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0153  hypothetical protein  28.75 
 
 		 326 aa  155  8e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0481  hypothetical protein  29.26 
 
 		 325 aa  153  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2791  hypothetical protein  29.73 
 
 		 309 aa  151  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1965  hypothetical protein  28.03 
 
 		 320 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1791  hypothetical protein  29.97 
 
 		 346 aa  144  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0782  hypothetical protein  29.86 
 
 		 339 aa  136  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6876  hypothetical protein  25.79 
 
 		 344 aa  121  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1947  hypothetical protein  28.03 
 
 		 315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.789852  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2300  hypothetical protein  25.1 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0170913  hitchhiker  0.00842153 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1012  hypothetical protein  25.5 
 
 		 323 aa  102  7e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.58279 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1703  hypothetical protein  27.17 
 
 		 335 aa  83.2  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  23.57 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4436  hypothetical protein  25.18 
 
 		 386 aa  79  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  22.49 
 
 		 316 aa  76.6  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  22.46 
 
 		 586 aa  76.3  0.0000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  22.56 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3582  hypothetical protein  23.99 
 
 		 378 aa  65.9  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4270  hypothetical protein  22.71 
 
 		 370 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2495  hypothetical protein  25.96 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000133938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0140  hypothetical protein  21.56 
 
 		 351 aa  60.1  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167342 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1082  hypothetical protein  22.35 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.789813  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1599  hypothetical protein  24.64 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1657  hypothetical protein  24.12 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0057  integral membrane protein  22.89 
 
 		 328 aa  57  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  23.79 
 
 		 340 aa  54.7  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1200  hypothetical protein  25.19 
 
 		 337 aa  52.8  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.160085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3499  hypothetical protein  20.95 
 
 		 319 aa  52.4  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140229  normal  0.790833 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1230  hypothetical protein  24.65 
 
 		 337 aa  50.4  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000527304 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2596  hypothetical protein  29.36 
 
 		 247 aa  49.7  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0723  hypothetical protein  19.3 
 
 		 326 aa  47.8  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275507  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2685  hypothetical protein  21.58 
 
 		 342 aa  47  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1494  hypothetical protein  20 
 
 		 333 aa  46.6  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.060435 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5211  hypothetical protein  23.96 
 
 		 333 aa  46.6  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.719757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0770  hypothetical protein  22.36 
 
 		 340 aa  45.8  0.0009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3548  hypothetical protein  21.18 
 
 		 321 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00235957 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3500  hypothetical protein  28.07 
 
 		 346 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1732  hypothetical protein  20.97 
 
 		 281 aa  44.3  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0163  hypothetical protein  23.57 
 
 		 320 aa  43.9  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1628  hypothetical protein  24.35 
 
 		 340 aa  42.7  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0706  hypothetical protein  24.48 
 
 		 811 aa  42.7  0.007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.778922 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0053  hypothetical protein  21.37 
 
 		 340 aa  42.7  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0521  hypothetical protein  20.82 
 
 		 325 aa  42.7  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1650  hypothetical protein  20.35 
 
 		 339 aa  42.7  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1148  hypothetical protein  20.88 
 
 		 340 aa  42.7  0.009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2793  hypothetical protein  20.54 
 
 		 360 aa  42.4  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>