More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1296 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1296  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0615608  normal  0.430138 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1703  hypothetical protein  72.65 
 
 
234 aa  352  2.9999999999999997e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3603  hypothetical protein  65.69 
 
 
246 aa  335  2.9999999999999997e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.879922  normal  0.0916284 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0276  methyltransferase type 11  37.72 
 
 
223 aa  65.9  0.0000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.320552  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  30 
 
 
257 aa  60.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0204  Methyltransferase type 12  30.25 
 
 
203 aa  57.8  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0772  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 
209 aa  57  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0768  methyltransferase type 12  25.89 
 
 
222 aa  57  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.215432 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3207  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.36 
 
 
390 aa  56.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3185  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.51 
 
 
390 aa  56.2  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3426  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.51 
 
 
390 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3460  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.36 
 
 
390 aa  56.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0757  Methyltransferase type 11  29.75 
 
 
209 aa  56.2  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000851252  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0977  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.93 
 
 
243 aa  54.7  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.270473 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3438  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.51 
 
 
390 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  27.93 
 
 
258 aa  53.9  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3113  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.51 
 
 
390 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.638061  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0301  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.51 
 
 
392 aa  53.1  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.65 
 
 
291 aa  53.1  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  27.03 
 
 
259 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0790  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.95 
 
 
398 aa  53.1  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000257674  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2593  Methyltransferase type 11  32.71 
 
 
250 aa  52.8  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2978  hypothetical protein  32.71 
 
 
230 aa  52.8  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4690  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  29.25 
 
 
206 aa  52.8  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.179715 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0397  cyclopropane fatty acid synthase family protein  30.51 
 
 
389 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0295  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.51 
 
 
389 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3804  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.98 
 
 
456 aa  52.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.119292  normal  0.179835 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3841  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 
243 aa  52  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3735  Methyltransferase type 11  26.09 
 
 
245 aa  52  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286886  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1121  methyltransferase type 11  27.83 
 
 
195 aa  52  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05419  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.7 
 
 
232 aa  52  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5117  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  33.96 
 
 
217 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.013812  hitchhiker  0.00397391 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1307  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.35 
 
 
394 aa  51.2  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.69512  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  27.27 
 
 
259 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3471  methyltransferase type 11  25.89 
 
 
207 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  28.07 
 
 
254 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3339  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.9 
 
 
428 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169518  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5294  Methyltransferase type 11  23.08 
 
 
259 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.570437 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2339  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.28 
 
 
261 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260847 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0867  methyltransferase type 11  25.93 
 
 
250 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3760  Methyltransferase type 11  32.74 
 
 
279 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0162  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.23 
 
 
277 aa  50.4  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.466565  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001478  SAM-dependent methyltransferase  29.05 
 
 
191 aa  50.1  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.544466  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3809  Methyltransferase type 11  32.74 
 
 
279 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0629  hypothetical protein  34.23 
 
 
239 aa  50.4  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.41007  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1238  methyltransferase type 11  30.48 
 
 
219 aa  50.4  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  29.81 
 
 
253 aa  49.7  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1123  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.5 
 
 
394 aa  49.7  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0181843  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2247  Methyltransferase type 11  26.22 
 
 
246 aa  49.7  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2590  methyltransferase type 11  26.76 
 
 
260 aa  49.3  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205764  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0050  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.57 
 
 
471 aa  49.3  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0716  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.81 
 
 
406 aa  49.3  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.719598  normal  0.139789 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0817  TPR repeat-containing protein  33.94 
 
 
661 aa  48.9  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.975986  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0403  putative methyltransferase  28.08 
 
 
210 aa  48.9  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00297063  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7150  cyclopropane fatty-acyl-phospholipid synthase  28.95 
 
 
419 aa  48.9  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133822  normal  0.013333 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0044  Methyltransferase type 12  26.72 
 
 
152 aa  47.8  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0924465  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1682  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  30.17 
 
 
383 aa  48.1  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3080  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.23 
 
 
429 aa  48.5  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.107319  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2643  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.88 
 
 
413 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0034  ArsR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
328 aa  48.1  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0798  cyclopropane fatty acid synthase-like protein  27.52 
 
 
374 aa  48.1  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000275065  hitchhiker  2.13005e-17 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
349 aa  48.5  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3404  methyltransferase type 11  28.18 
 
 
226 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.236605  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1473  methyltransferase type 12  33.73 
 
 
270 aa  48.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0977  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.08 
 
 
245 aa  47.8  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.610826 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  26.17 
 
 
250 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3723  Methyltransferase type 12  28.35 
 
 
238 aa  47.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0601738  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2676  Methyltransferase type 11  26.8 
 
 
231 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.71 
 
 
259 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  26.53 
 
 
244 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3572  Methyltransferase type 11  25.93 
 
 
270 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4135  methyltransferase type 11  27.36 
 
 
243 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.399461  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  32.69 
 
 
265 aa  47.4  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  26.17 
 
 
250 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4011  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
317 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.550687  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2867  Methyltransferase type 11  25.66 
 
 
355 aa  47.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  26.17 
 
 
250 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1008  hypothetical protein  33.82 
 
 
270 aa  47.4  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.823192 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2544  methyltransferase type 12  28.47 
 
 
200 aa  47.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 
255 aa  47.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  27.2 
 
 
256 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4055  putative methyltransferase  31.82 
 
 
194 aa  47  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0786  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.85 
 
 
406 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0668711  normal  0.244469 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0150  methyltransferase  29.47 
 
 
269 aa  47  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.520005  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3981  methyltransferase type 12  27.33 
 
 
235 aa  46.6  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.457714  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.17 
 
 
250 aa  47  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1951  RNA methyltransferase  29.89 
 
 
453 aa  47  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.602794  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3324  methyltransferase type 11  22.97 
 
 
244 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  28.57 
 
 
250 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  30.1 
 
 
251 aa  47  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  27.78 
 
 
250 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  27.43 
 
 
256 aa  47  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  28.3 
 
 
337 aa  47  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0843  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  27.88 
 
 
217 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  27.2 
 
 
256 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0403  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30.77 
 
 
214 aa  47  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306332  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1985  RNA methyltransferase  29.89 
 
 
453 aa  47  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2343  methyltransferase type 11  28.21 
 
 
367 aa  47  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  30.48 
 
 
341 aa  46.6  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  27.62 
 
 
250 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>