More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1285 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  100 
 
 
262 aa  543  1e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1279  UbiE/COQ5 methyltransferase  49.4 
 
 
253 aa  276  3e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  49 
 
 
253 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  43.25 
 
 
250 aa  239  4e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0166  DNA topoisomerase VI subunit A-like protein  40.4 
 
 
257 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  40.32 
 
 
253 aa  211  1e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  40.16 
 
 
255 aa  208  6e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  38.54 
 
 
210 aa  159  4e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  33.59 
 
 
226 aa  146  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.17 
 
 
259 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  31.89 
 
 
226 aa  144  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0198  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.78 
 
 
252 aa  142  4e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.537911  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  38.99 
 
 
226 aa  135  6.0000000000000005e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0720  hypothetical protein  33.61 
 
 
234 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  31.05 
 
 
248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2026  Methyltransferase type 11  34.08 
 
 
261 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508606  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.95 
 
 
250 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2248  Methyltransferase type 11  31.6 
 
 
261 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.586689  normal  0.376735 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4078  methyltransferase type 11  30.95 
 
 
259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1222  methyltransferase  32.46 
 
 
272 aa  122  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.328239  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1358  methyltransferase type 11  30.96 
 
 
271 aa  120  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4417  methyltransferase type 11  32.56 
 
 
269 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.587336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  33.53 
 
 
244 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.75 
 
 
155 aa  108  7.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2984  methyltransferase type 11  30.52 
 
 
227 aa  103  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452511  normal  0.396011 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3676  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.84 
 
 
230 aa  100  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0791082 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  41.23 
 
 
225 aa  97.8  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0342  Methyltransferase type 11  37.23 
 
 
252 aa  93.6  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0468  hypothetical protein  35.25 
 
 
249 aa  90.5  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0543  Methyltransferase type 11  31.94 
 
 
247 aa  90.1  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0352  Methyltransferase type 11  30.07 
 
 
249 aa  87.8  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0474  hypothetical protein  27.23 
 
 
252 aa  88.6  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2762  Methyltransferase type 11  29.3 
 
 
265 aa  85.5  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04480  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.01 
 
 
263 aa  82.8  0.000000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.110079  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0334  Methyltransferase type 11  28.28 
 
 
257 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000194414  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 
258 aa  82  0.000000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  40.98 
 
 
250 aa  81.6  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  34.59 
 
 
225 aa  80.1  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0957  methyltransferase type 11  37.61 
 
 
290 aa  79.7  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  37.4 
 
 
265 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  35.17 
 
 
268 aa  77  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  36.08 
 
 
268 aa  76.6  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  31.79 
 
 
256 aa  74.3  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1066  putative methyltransferase  29.94 
 
 
273 aa  73.6  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000495873  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  30.63 
 
 
312 aa  72.4  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  34.51 
 
 
211 aa  72  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1876  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.61 
 
 
282 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183068  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  41.38 
 
 
230 aa  71.6  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  30 
 
 
258 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  29.65 
 
 
281 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1670  methyltransferase type 11  32.17 
 
 
269 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  36.97 
 
 
337 aa  70.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  35.46 
 
 
341 aa  70.1  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1988  Methyltransferase type 11  32.17 
 
 
269 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.36 
 
 
256 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.36 
 
 
256 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1378  Methyltransferase type 11  36.27 
 
 
207 aa  70.5  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  36.19 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  32.41 
 
 
257 aa  70.1  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3346  Methyltransferase type 11  37 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  35.25 
 
 
220 aa  70.1  0.00000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2013  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.61 
 
 
241 aa  69.3  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  31.29 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  29.36 
 
 
233 aa  68.9  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3216  methyltransferase type 11  28.67 
 
 
275 aa  68.9  0.00000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  34.75 
 
 
263 aa  68.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  31.28 
 
 
252 aa  68.9  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.45 
 
 
256 aa  68.9  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1305  Methyltransferase type 11  32.62 
 
 
235 aa  68.6  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  35.24 
 
 
283 aa  68.9  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 
335 aa  68.6  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  32.47 
 
 
206 aa  68.2  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  35.45 
 
 
256 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  34 
 
 
327 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  33.66 
 
 
256 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  31.86 
 
 
342 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  33.83 
 
 
280 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  35.78 
 
 
283 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  33.63 
 
 
328 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1190  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.61 
 
 
272 aa  67  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
339 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1317  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.07 
 
 
229 aa  67  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124117  hitchhiker  3.42912e-24 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1966  methyltransferase type 11  30.58 
 
 
215 aa  67  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000755977  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2831  Methyltransferase type 11  30.5 
 
 
235 aa  66.6  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  38.61 
 
 
341 aa  66.6  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  38.61 
 
 
341 aa  66.6  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  34.15 
 
 
286 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  35.35 
 
 
266 aa  66.6  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0492  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  33.59 
 
 
232 aa  66.6  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.578084 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 
317 aa  66.6  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2627  methyltransferase type 11  30.59 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.8455  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  32 
 
 
349 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  36.63 
 
 
254 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  32 
 
 
354 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  35.24 
 
 
263 aa  66.2  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  31.71 
 
 
273 aa  66.2  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  32.86 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.63 
 
 
254 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0006  hypothetical protein  35.9 
 
 
271 aa  65.9  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.868865  normal  0.0557095 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3362  methyltransferase type 11  28.16 
 
 
282 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0826191  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>