More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1279 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1279  UbiE/COQ5 methyltransferase  100 
 
 
253 aa  525  1e-148  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  52.57 
 
 
253 aa  286  2e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  49.4 
 
 
262 aa  276  2e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  48.62 
 
 
250 aa  269  4e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  44.31 
 
 
253 aa  224  9e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0166  DNA topoisomerase VI subunit A-like protein  47.04 
 
 
257 aa  224  1e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  42.63 
 
 
255 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.93 
 
 
259 aa  158  7e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  41.09 
 
 
210 aa  155  6e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 
226 aa  142  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  38.6 
 
 
248 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0198  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.02 
 
 
252 aa  139  6e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.537911  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  33.48 
 
 
226 aa  135  6.0000000000000005e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2026  Methyltransferase type 11  38.49 
 
 
261 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508606  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.98 
 
 
250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  29.91 
 
 
226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0720  hypothetical protein  34.91 
 
 
234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4078  methyltransferase type 11  36.29 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2248  Methyltransferase type 11  36.17 
 
 
261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.586689  normal  0.376735 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1222  methyltransferase  32.56 
 
 
272 aa  125  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.328239  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  31.2 
 
 
244 aa  118  7e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4417  methyltransferase type 11  33.74 
 
 
269 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.587336 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  38.31 
 
 
155 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  51.28 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1358  methyltransferase type 11  30.36 
 
 
271 aa  112  8.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3676  UbiE/COQ5 methyltransferase  44.44 
 
 
230 aa  105  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0791082 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2984  methyltransferase type 11  32.84 
 
 
227 aa  97.4  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452511  normal  0.396011 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04480  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.13 
 
 
263 aa  95.9  5e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.110079  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0352  Methyltransferase type 11  35.53 
 
 
249 aa  95.5  8e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0474  hypothetical protein  26.05 
 
 
252 aa  94.7  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0342  Methyltransferase type 11  33.55 
 
 
252 aa  89.4  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0543  Methyltransferase type 11  29.33 
 
 
247 aa  88.6  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0334  Methyltransferase type 11  31.76 
 
 
257 aa  88.6  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000194414  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2762  Methyltransferase type 11  29.84 
 
 
265 aa  86.7  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0468  hypothetical protein  31.54 
 
 
249 aa  86.3  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  31.64 
 
 
258 aa  85.9  6e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.88 
 
 
250 aa  79.3  0.00000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0957  methyltransferase type 11  41 
 
 
290 aa  74.3  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  36.75 
 
 
327 aa  72.4  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  41.09 
 
 
225 aa  72  0.000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  39 
 
 
354 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  39 
 
 
349 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  34.35 
 
 
280 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  39 
 
 
342 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
328 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  35.54 
 
 
240 aa  69.7  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  37.62 
 
 
339 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3419  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.14 
 
 
299 aa  67.8  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2627  methyltransferase type 11  39.6 
 
 
286 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.8455  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  33.8 
 
 
281 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  31.37 
 
 
265 aa  66.6  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3216  methyltransferase type 11  28.06 
 
 
275 aa  67  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  29.94 
 
 
202 aa  67  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  36.79 
 
 
275 aa  66.6  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  32.28 
 
 
261 aa  65.9  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  29.45 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  37.86 
 
 
199 aa  65.5  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  28.05 
 
 
258 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  37.76 
 
 
206 aa  64.7  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  36.19 
 
 
263 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1988  Methyltransferase type 11  28.77 
 
 
269 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19700  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.89 
 
 
200 aa  65.1  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0754126  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1554  hypothetical protein  29.08 
 
 
315 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000923024  normal  0.0128521 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3341  methyltransferase type 11  28.37 
 
 
315 aa  64.7  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000506511  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  34 
 
 
337 aa  64.7  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4949  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
256 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  30.81 
 
 
283 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.57 
 
 
230 aa  64.3  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1670  methyltransferase type 11  28.77 
 
 
269 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2447  methyltransferase type 11  37.62 
 
 
284 aa  63.5  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.204404  normal  0.251404 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1066  putative methyltransferase  27.54 
 
 
273 aa  63.5  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000495873  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0552  Methyltransferase type 11  28.12 
 
 
247 aa  63.5  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2782  methyltransferase type 11  28.72 
 
 
234 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320592  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  38.24 
 
 
266 aa  63.2  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0696  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.49 
 
 
229 aa  62.8  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7055  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.68 
 
 
252 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2360  Methyltransferase type 11  31.37 
 
 
201 aa  62.8  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.175254  hitchhiker  0.000000000902529 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2739  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, putative  31.37 
 
 
201 aa  62.8  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0089  SmtA protein  31.73 
 
 
199 aa  62.4  0.000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  36.79 
 
 
211 aa  62.8  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2259  methyltransferase type 11  35.64 
 
 
196 aa  62.4  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  26.42 
 
 
233 aa  62.4  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0258  hypothetical protein  31.97 
 
 
253 aa  62.4  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0252  hypothetical protein  31.97 
 
 
253 aa  62.4  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3444  hypothetical protein  28.37 
 
 
322 aa  62.4  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000102357  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3407  ubiquinone/menaquinone methyltransferase  28.37 
 
 
322 aa  62  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000119678  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3714  hypothetical protein  28.37 
 
 
315 aa  62  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000001291  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  33.57 
 
 
225 aa  62  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2195  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  30.13 
 
 
213 aa  62  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3682  hypothetical protein  29.79 
 
 
315 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000635868  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  35.85 
 
 
283 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4638  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.21 
 
 
258 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0233383 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3346  Methyltransferase type 11  36.04 
 
 
207 aa  61.6  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0721  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  32.52 
 
 
204 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.635481  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  30.06 
 
 
253 aa  61.6  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2831  Methyltransferase type 11  28.12 
 
 
235 aa  61.2  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2376  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.52 
 
 
204 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6644  methyltransferase type 11  27.66 
 
 
272 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  31.48 
 
 
276 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5049  methyltransferase type 11  29.09 
 
 
273 aa  61.2  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300212  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>