65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1251 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1251  archease family protein  100 
 
 
146 aa  296  5e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2208  archease family protein  51.72 
 
 
146 aa  144  3e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000144175  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1373  hypothetical protein  46.15 
 
 
141 aa  123  9e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1264  protein of unknown function DUF101  47.52 
 
 
138 aa  121  4e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1747  protein of unknown function DUF101  39.72 
 
 
139 aa  108  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1078  protein of unknown function DUF101  41.84 
 
 
139 aa  100  7e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1831  hypothetical protein  39.29 
 
 
150 aa  99.4  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000057693  normal  0.0919322 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0707  hypothetical protein  40.71 
 
 
147 aa  97.8  4e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1685  hypothetical protein  40.71 
 
 
147 aa  95.5  2e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0257186 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0242  hypothetical protein  37.14 
 
 
138 aa  94.7  4e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1671  hypothetical protein  37.86 
 
 
138 aa  94.4  5e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.532408  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3853  hypothetical protein  35.46 
 
 
138 aa  93.6  8e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0688  hypothetical protein  33.79 
 
 
150 aa  92.8  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0414002  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0957  archease family protein  37.14 
 
 
138 aa  92.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.395937  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0121  hypothetical protein  36.17 
 
 
135 aa  91.7  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000001565  hitchhiker  0.0000415863 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0569  hypothetical protein  38.73 
 
 
147 aa  91.3  4e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1793  hypothetical protein  38.03 
 
 
135 aa  90.1  9e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.694231 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1580  hypothetical protein  35.71 
 
 
143 aa  89.4  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.986242  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0655  protein of unknown function DUF101  33.33 
 
 
143 aa  89.7  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1546  hypothetical protein  35 
 
 
140 aa  89.7  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0196  hypothetical protein  37.76 
 
 
143 aa  89.7  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.30479  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1949  protein of unknown function DUF101  34.51 
 
 
141 aa  86.3  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000093626  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0741  hypothetical protein  34.53 
 
 
138 aa  86.3  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2152  hypothetical protein  33.8 
 
 
147 aa  85.5  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_726  hypothetical protein  33.09 
 
 
138 aa  83.6  8e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0822  hypothetical protein  33.09 
 
 
138 aa  82.8  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.303013  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2728  hypothetical protein  34.48 
 
 
143 aa  80.9  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.21951  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1392  hypothetical protein  35.92 
 
 
143 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1652  hypothetical protein  35 
 
 
135 aa  79  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1313  hypothetical protein  32.86 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.223315  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0271  hypothetical protein  30.82 
 
 
165 aa  76.3  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2360  metal dependent phosphohydrolase  35.25 
 
 
542 aa  76.6  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.461963 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1729  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0129  hypothetical protein  30.77 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.011827  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0332  protein of unknown function DUF101  29.25 
 
 
140 aa  70.5  0.000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1680  hypothetical protein  35.42 
 
 
143 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46270  hypothetical protein  35 
 
 
137 aa  70.1  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2126  hypothetical protein  34.21 
 
 
110 aa  68.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0479  hypothetical protein  31.43 
 
 
138 aa  68.6  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.541748  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0902  hypothetical protein  32.85 
 
 
163 aa  67  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0373  protein of unknown function DUF101  30.22 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0018  hypothetical protein  31.21 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000044858  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0232  hypothetical protein  30.47 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1019  protein of unknown function DUF101  27.21 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2756  protein of unknown function DUF101  32.39 
 
 
136 aa  63.5  0.0000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.905523  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0988  protein of unknown function DUF101  33.58 
 
 
143 aa  63.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1267  hypothetical cytosolic protein  30.28 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2562  protein of unknown function DUF101  30.06 
 
 
158 aa  61.2  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2143  hypothetical protein  30.99 
 
 
143 aa  60.1  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.706789  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40293  predicted protein  33.83 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4796  protein of unknown function DUF101  31.91 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1615  hypothetical protein  34.51 
 
 
143 aa  58.2  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.307554  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3272  protein of unknown function DUF101  29.32 
 
 
143 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0128  hypothetical protein  25.71 
 
 
136 aa  55.1  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0987  hypothetical protein  26.06 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2028  protein of unknown function DUF101  32.17 
 
 
152 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00595059  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3180  hypothetical protein  31.94 
 
 
135 aa  47.4  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0412  protein of unknown function DUF101  27.71 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00074949  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1005  protein of unknown function DUF101  27.27 
 
 
145 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2022  protein of unknown function DUF101  26.85 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.367905 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12649  hypothetical protein  25.52 
 
 
179 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0834  hypothetical protein  26.53 
 
 
153 aa  45.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.727995  normal  0.702383 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2547  hypothetical protein  25.52 
 
 
142 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0775927  decreased coverage  0.00000269458 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0947  hypothetical protein  27.27 
 
 
145 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2398  hypothetical protein  25.93 
 
 
177 aa  40.4  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.796069  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>