More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1228 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  322  1e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  54.67 
 
 
225 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  47.31 
 
 
286 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  45.21 
 
 
381 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  52.59 
 
 
234 aa  123  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3090  hypothetical protein  49.69 
 
 
362 aa  114  7.999999999999999e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0391882  normal  0.0374194 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  46.03 
 
 
517 aa  101  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  46.62 
 
 
493 aa  95.1  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  41.78 
 
 
351 aa  94.4  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  49.15 
 
 
489 aa  94  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  43.1 
 
 
900 aa  93.2  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  44.36 
 
 
340 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  44.88 
 
 
336 aa  92.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  42.33 
 
 
525 aa  92.4  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  44.88 
 
 
336 aa  92.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2291  hypothetical protein  38 
 
 
365 aa  90.1  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0775084 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  44.44 
 
 
213 aa  90.1  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  46.4 
 
 
389 aa  90.1  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  45.8 
 
 
309 aa  89.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  46.67 
 
 
576 aa  88.6  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  46.9 
 
 
267 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  47.62 
 
 
449 aa  88.6  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  46.46 
 
 
386 aa  87.8  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  46.34 
 
 
567 aa  87.8  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  50 
 
 
493 aa  87.4  9e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  45.45 
 
 
263 aa  87  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  45.8 
 
 
256 aa  86.7  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  44.6 
 
 
214 aa  86.3  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  39.05 
 
 
182 aa  85.9  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  44.17 
 
 
745 aa  85.9  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  39.24 
 
 
180 aa  85.9  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  52.83 
 
 
175 aa  85.5  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  49.53 
 
 
277 aa  84.3  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  46.92 
 
 
267 aa  84.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3130  pentapeptide repeat protein  45.24 
 
 
356 aa  83.6  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  45.22 
 
 
521 aa  83.6  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4964  pentapeptide repeat-containing protein  48.7 
 
 
250 aa  83.6  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  41.06 
 
 
245 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  47.01 
 
 
182 aa  82.8  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2990  pentapeptide repeat protein  46.56 
 
 
356 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  49.07 
 
 
973 aa  82.8  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  37.88 
 
 
734 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  44.83 
 
 
174 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  47.37 
 
 
225 aa  82.8  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  50.44 
 
 
260 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  45 
 
 
215 aa  82  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  45 
 
 
216 aa  82.4  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  46.43 
 
 
184 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0192  pentapeptide repeat-containing protein  44.95 
 
 
181 aa  82  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.493873  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  44.07 
 
 
332 aa  81.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  45.24 
 
 
184 aa  81.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  50.98 
 
 
1033 aa  81.3  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0686  pentapeptide repeat-containing protein  53.85 
 
 
152 aa  80.9  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0322373  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  40.65 
 
 
320 aa  80.9  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  42.03 
 
 
448 aa  80.9  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  40.83 
 
 
776 aa  80.9  0.000000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  52.88 
 
 
241 aa  80.5  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0580  pentapeptide repeat-containing protein  47.37 
 
 
194 aa  80.1  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0019  pentapeptide repeat-containing protein  51.55 
 
 
292 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400102  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  46.09 
 
 
343 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  47.41 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  47.41 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0521  pentapeptide repeat-containing protein  43.14 
 
 
418 aa  79.7  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38880  hypothetical protein  43.44 
 
 
215 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  46.96 
 
 
309 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  43.1 
 
 
384 aa  79.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  46.09 
 
 
343 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  43.64 
 
 
412 aa  78.6  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  45.54 
 
 
408 aa  79.3  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  40.74 
 
 
441 aa  78.6  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  46.22 
 
 
264 aa  78.6  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0475  pentapeptide repeat-containing protein  46.46 
 
 
204 aa  78.2  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.019443 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4786  pentapeptide repeat protein  50.55 
 
 
824 aa  78.2  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  45.67 
 
 
446 aa  78.2  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  43.62 
 
 
295 aa  78.2  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3095  pentapeptide repeat protein  44.54 
 
 
210 aa  78.2  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5010  pentapeptide repeat protein  40.65 
 
 
204 aa  77.8  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3313  hypothetical protein  42.62 
 
 
217 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  37.69 
 
 
1831 aa  77.4  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  31.89 
 
 
299 aa  77  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  38.04 
 
 
440 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  43.27 
 
 
872 aa  76.6  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  43.24 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2608  pentapeptide repeat-containing protein  39.13 
 
 
259 aa  77  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4336  pentapeptide repeat-containing protein  39.86 
 
 
187 aa  77.4  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.789922  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  36.94 
 
 
294 aa  77  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  44.72 
 
 
483 aa  77  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2409  pentapeptide repeat-containing protein  42.34 
 
 
885 aa  76.6  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  46.23 
 
 
266 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1544  RDD domain-containing protein  42.48 
 
 
706 aa  76.6  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1728  pentapeptide repeat-containing protein  52.81 
 
 
389 aa  76.3  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.952308  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1082  pentapeptide protein  34.07 
 
 
614 aa  76.3  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0577925 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  34.78 
 
 
319 aa  76.3  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3735  pentapeptide repeat-containing protein  51.65 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0893  pentapeptide repeat-containing protein  45.95 
 
 
357 aa  76.3  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.417756  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  40.43 
 
 
331 aa  75.9  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3786  pentapeptide repeat-containing protein  51.65 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2972  pentapeptide repeat protein  44.34 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2302  pentapeptide repeat protein  48.21 
 
 
294 aa  75.5  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000172848 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  43.75 
 
 
333 aa  75.5  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>