226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1223 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1223  phosphoglyceromutase  100 
 
 		 517 aa  1073    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2222  phosphoglyceromutase  77.86 
 
 		 525 aa  860    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.169882 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1914  phosphoglyceromutase  66.6 
 
 		 518 aa  712    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1309  phosphoglyceromutase  60.86 
 
 		 514 aa  625  1e-178  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1404  phosphoglyceromutase  60.55 
 
 		 512 aa  620  1e-176  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00187376  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15800  phosphoglyceromutase  58.71 
 
 		 512 aa  613  9.999999999999999e-175  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0071307  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2988  phosphoglyceromutase  57.34 
 
 		 516 aa  601  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00782111  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0167  phosphoglyceromutase  58.04 
 
 		 505 aa  593  1e-168  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.414873  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0140  phosphoglyceromutase  59.1 
 
 		 511 aa  594  1e-168  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0265  phosphoglyceromutase  57.81 
 
 		 513 aa  588  1e-167  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2959  phosphoglyceromutase  56.81 
 
 		 512 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000558659  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2259  phosphoglyceromutase  58.2 
 
 		 511 aa  582  1.0000000000000001e-165  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3134  phosphoglyceromutase  56.87 
 
 		 511 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1508  phosphoglyceromutase  57.78 
 
 		 512 aa  584  1.0000000000000001e-165  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1298  phosphoglyceromutase  57.59 
 
 		 512 aa  582  1.0000000000000001e-165  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00238199  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3949  phosphoglyceromutase  53.02 
 
 		 514 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.549374 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4116  phosphoglyceromutase  53.02 
 
 		 514 aa  581  1e-164  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03470  phosphoglyceromutase  53.02 
 
 		 514 aa  581  1e-164  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0093  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  53.02 
 
 		 514 aa  580  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4985  phosphoglyceromutase  53.02 
 
 		 514 aa  581  1e-164  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.676695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4040  phosphoglyceromutase  53.02 
 
 		 514 aa  581  1e-164  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03421  hypothetical protein  53.02 
 
 		 514 aa  581  1e-164  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4877  phosphoglyceromutase  54.19 
 
 		 514 aa  578  1e-164  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3824  phosphoglyceromutase  53.02 
 
 		 514 aa  581  1e-164  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0096  phosphoglyceromutase  53.02 
 
 		 514 aa  581  1e-164  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4929  phosphoglyceromutase  54.47 
 
 		 511 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5107  phosphoglyceromutase  54.37 
 
 		 511 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0075  phosphoglyceromutase  53.31 
 
 		 515 aa  575  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3934  phosphoglyceromutase  56.25 
 
 		 513 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000777024  normal  0.797845 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0246  phosphoglyceromutase  52.92 
 
 		 516 aa  575  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.605789  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4141  phosphoglyceromutase  53.5 
 
 		 515 aa  577  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.793791  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0069  phosphoglyceromutase  53.31 
 
 		 515 aa  575  1.0000000000000001e-163  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5056  phosphoglyceromutase  54.56 
 
 		 511 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0723  phosphoglyceromutase  54.79 
 
 		 509 aa  575  1.0000000000000001e-162  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4885  phosphoglyceromutase  53.22 
 
 		 529 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0333  phosphoglyceromutase  54 
 
 		 508 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0676803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0043  phosphoglyceromutase  53.91 
 
 		 514 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0047  phosphoglyceromutase  53.91 
 
 		 514 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000662777 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5865  phosphoglyceromutase  53.31 
 
 		 515 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3166  phosphoglyceromutase  54.97 
 
 		 519 aa  573  1.0000000000000001e-162  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0047  phosphoglyceromutase  54.1 
 
 		 514 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000166466 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4819  phosphoglyceromutase  54.17 
 
 		 514 aa  572  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.799171  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4332  phosphoglyceromutase  53.91 
 
 		 514 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0257  phosphoglyceromutase  52.72 
 
 		 516 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0123  phosphoglyceromutase  52.24 
 
 		 514 aa  573  1.0000000000000001e-162  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3984  phosphoglyceromutase  51.66 
 
 		 514 aa  568  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.669307 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5327  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  53.11 
 
 		 510 aa  571  1e-161  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3774  phosphoglyceromutase  56.42 
 
 		 512 aa  571  1e-161  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000507492  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1123  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  53.7 
 
 		 513 aa  568  1e-161  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000726536  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3922  phosphoglyceromutase  51.66 
 
 		 514 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.935714  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4029  phosphoglyceromutase  51.66 
 
 		 514 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4090  phosphoglyceromutase  51.85 
 
 		 514 aa  571  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3594  phosphoglyceromutase  55.36 
 
 		 512 aa  569  1e-161  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901518  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3806  phosphoglyceromutase  54.28 
 
 		 514 aa  570  1e-161  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.823885 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0135  phosphoglyceromutase  56.56 
 
 		 516 aa  568  1e-161  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3903  phosphoglyceromutase  51.46 
 
 		 514 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0409  phosphoglyceromutase  54.95 
 
 		 511 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.518325 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0045  phosphoglyceromutase  53.91 
 
 		 514 aa  565  1e-160  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150167 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0043  phosphoglyceromutase  53.91 
 
 		 514 aa  566  1e-160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316902 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002247  2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase  53.92 
 
 		 510 aa  565  1e-160  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0136338  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4217  phosphoglyceromutase  53.22 
 
 		 514 aa  565  1e-160  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0040  phosphoglyceromutase  53.71 
 
 		 514 aa  567  1e-160  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4986  phosphoglyceromutase  55.97 
 
 		 509 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4815  phosphoglyceromutase  55.97 
 
 		 509 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4825  phosphoglyceromutase  55.97 
 
 		 509 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5250  phosphoglyceromutase  55.97 
 
 		 509 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5221  phosphoglyceromutase  55.97 
 
 		 509 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5285  phosphoglyceromutase  55.97 
 
 		 509 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000133351  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0451  phosphoglyceromutase  55.13 
 
 		 519 aa  562  1.0000000000000001e-159  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.688516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5365  phosphoglyceromutase  55.97 
 
 		 509 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00214518  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67770  phosphoglyceromutase  53.61 
 
 		 515 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.842673 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0051  phosphoglyceromutase  53.71 
 
 		 514 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185111 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0257  phosphoglyceromutase  51.95 
 
 		 516 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.359629  normal  0.907394 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3858  phosphoglyceromutase  56.23 
 
 		 512 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0805243 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5239  phosphoglyceromutase  55.77 
 
 		 509 aa  560  1e-158  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.372289  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0049  phosphoglyceromutase  52.93 
 
 		 514 aa  560  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1720  phosphoglyceromutase  54.93 
 
 		 519 aa  558  1e-158  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3203  phosphoglyceromutase  56.14 
 
 		 512 aa  560  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000345113  unclonable  3.7174500000000003e-23 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4716  phosphoglyceromutase  54.4 
 
 		 511 aa  558  1e-158  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000025941  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0235  phosphoglyceromutase  52.53 
 
 		 516 aa  561  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5702  phosphoglyceromutase  55.38 
 
 		 509 aa  558  1e-158  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000339151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4127  phosphoglyceromutase  54.39 
 
 		 512 aa  560  1e-158  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341854  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0060  phosphoglyceromutase  53.44 
 
 		 513 aa  561  1e-158  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2016  phosphoglyceromutase  55.01 
 
 		 515 aa  555  1e-157  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0100245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0275  phosphoglyceromutase  53.73 
 
 		 515 aa  558  1e-157  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.206526  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3611  phosphoglyceromutase  54.19 
 
 		 510 aa  558  1e-157  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.055696  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00121  phosphoglyceromutase  53.05 
 
 		 510 aa  556  1e-157  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3679  phosphoglyceromutase  55.19 
 
 		 509 aa  552  1e-156  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000585088  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4470  phosphoglyceromutase  52.44 
 
 		 514 aa  552  1e-156  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000756408 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4928  phosphoglyceromutase  55.19 
 
 		 509 aa  553  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.237588  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0093  phosphoglyceromutase  54.95 
 
 		 511 aa  554  1e-156  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.784712  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3211  phosphoglyceromutase  53.52 
 
 		 509 aa  554  1e-156  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4246  phosphoglyceromutase  53.91 
 
 		 510 aa  552  1e-156  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0255535 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0743  phosphoglyceromutase  54.47 
 
 		 521 aa  551  1e-155  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1956  phosphoglyceromutase  54.02 
 
 		 521 aa  551  1e-155  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.029965  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0494  phosphoglyceromutase  51.07 
 
 		 516 aa  549  1e-155  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2394  phosphoglyceromutase  52.27 
 
 		 513 aa  548  1e-154  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0031  phosphoglyceromutase  51.46 
 
 		 517 aa  547  1e-154  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3698  phosphoglyceromutase  51.27 
 
 		 514 aa  548  1e-154  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3611  phosphoglyceromutase  51.07 
 
 		 511 aa  545  1e-154  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>