128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1216 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1216  cobalt transport protein CbiM  100 
 
 		 231 aa  458  9.999999999999999e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1700  cobalt transport protein CbiM  67.84 
 
 		 231 aa  320  9.999999999999999e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000112913  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2145  cobalt transport protein CbiM  62.34 
 
 		 235 aa  297  8e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0808457  normal  0.37009 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0531  cobalt transport protein CbiM  58.44 
 
 		 230 aa  271  9e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0580  cobalt transport protein CbiM  61.67 
 
 		 229 aa  270  1e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0647937  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1293  cobalamin biosynthesis protein CbiM  56.77 
 
 		 232 aa  263  2e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034572  normal  0.0275766 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1702  cobalamin biosynthesis protein CbiM  56.58 
 
 		 231 aa  263  2e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.254913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2333  cobalt transport protein CbiM  52.42 
 
 		 235 aa  259  3e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3205  cobalt transport protein CbiM  49.78 
 
 		 229 aa  250  1e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1073  hypothetical protein  52.81 
 
 		 599 aa  238  5e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1085  hypothetical protein  50 
 
 		 231 aa  230  2e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0790  cobalt transport protein CbiM  52.44 
 
 		 225 aa  228  4e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0725  cobalt transport protein CbiM  51.97 
 
 		 225 aa  227  9e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.145999 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1193  cobalt transport protein CbiM  51.53 
 
 		 225 aa  224  7e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0097  cobalt transport protein CbiM  50.22 
 
 		 225 aa  221  6e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1709  cobalamin biosynthesis protein CbiM  53.62 
 
 		 248 aa  218  7e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2199  cobalt transport protein CbiM  51.44 
 
 		 245 aa  218  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2245  cobalt transport protein CbiM  51.44 
 
 		 245 aa  218  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.112187 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2145  cobalt transport protein CbiM  51.44 
 
 		 245 aa  218  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2358  cobalt transport protein CbiM  51.44 
 
 		 245 aa  218  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.372857 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2192  cobalt transport protein CbiM  51.44 
 
 		 245 aa  218  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1060  cobalt transport protein CbiM  51.66 
 
 		 254 aa  217  1e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.127032  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0185  cobalt transport protein CbiM  50.23 
 
 		 247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.878644  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0182  cobalt transport protein CbiM  50.23 
 
 		 247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2620  cobalt transport protein CbiM  53.92 
 
 		 247 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1222  cobalt transport protein CbiM  48.62 
 
 		 234 aa  211  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.955789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0146  cobalt transport protein CbiM  48.65 
 
 		 221 aa  209  3e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0185688  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1241  cobalt transport protein CbiM  48.65 
 
 		 226 aa  209  4e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.335474  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0712  cobalamin biosynthesis protein CbiM  53.62 
 
 		 235 aa  208  5e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0323  cobalt transport protein CbiM  48.48 
 
 		 249 aa  208  7e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00019504  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0560  cobalamin biosynthesis protein CbiM  51.12 
 
 		 249 aa  207  8e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1226  cobalt transport protein CbiM  48.2 
 
 		 226 aa  207  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00004415  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1385  cobalamin biosynthesis protein CbiM  53.57 
 
 		 250 aa  206  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3660  cobalt transport protein CbiM  48.66 
 
 		 225 aa  206  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2601  cobalt transport protein CbiM  49.32 
 
 		 246 aa  207  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.184682  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1276  cobalamin biosynthesis protein CbiM  50.89 
 
 		 246 aa  206  3e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2731  cobalamin biosynthesis protein CbiM  50.24 
 
 		 250 aa  205  5e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.480074  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1545  cobalt transport protein CbiM  50 
 
 		 246 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221341  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1697  cobalt transport protein CbiM  48.21 
 
 		 225 aa  202  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.30926 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3736  cobalamin biosynthesis protein CbiM  47.19 
 
 		 251 aa  202  4e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.203857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1003  cobalamin biosynthesis protein CbiM  50.48 
 
 		 236 aa  201  9.999999999999999e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0927  cobalamin biosynthesis protein CbiM  46.4 
 
 		 250 aa  198  7e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.326506  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2793  cobalt transport protein CbiM  46.67 
 
 		 226 aa  195  6e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132935  decreased coverage  0.000152397 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0543  cobalamin biosynthesis protein CbiM  45.7 
 
 		 226 aa  188  5.999999999999999e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2595  cobalt transport protein CbiM  46.22 
 
 		 226 aa  187  9e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0918235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1759  cobalt transport protein CbiM  53.43 
 
 		 228 aa  187  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3820  cobalt transport protein CbiM  46.09 
 
 		 249 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4719  cobalamin biosynthesis protein CbiM  46.85 
 
 		 225 aa  186  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1861  cobalamin biosynthesis protein CbiM  51.15 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1266  cobalamin biosynthesis protein CbiM  44.55 
 
 		 248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3589  cobalamin biosynthesis protein CbiM  47.52 
 
 		 232 aa  179  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0380  hypothetical protein  41.95 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4182  cobalt transport protein CbiM  38.7 
 
 		 251 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3808  cobalt transport protein CbiM  39.32 
 
 		 245 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3004  cobalt transport protein CbiM  37.78 
 
 		 321 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3892  cobalt transport protein CbiM  37.83 
 
 		 256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.885543 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0472  cobalt transport protein CbiM  37.89 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1480  cobalt transport protein CbiM  34.68 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2621  cobalt transport protein CbiM  32.11 
 
 		 214 aa  94.7  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.78373  normal  0.0472515 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0031  cobalt transport protein CbiM  30.23 
 
 		 212 aa  92.8  4e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0137  cobalt transport protein CbiM  29.95 
 
 		 212 aa  92  6e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0440058 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2565  cobalt transport protein CbiM  31.56 
 
 		 239 aa  90.1  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.779557  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0090  cobalt transport protein CbiM  30.04 
 
 		 210 aa  90.1  3e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1766  cobalt transport protein CbiM  28.19 
 
 		 212 aa  89.4  4e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1767  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.57 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.113369  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2184  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  27.04 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00256059 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1793  cobalt transport protein CbiM  30.81 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000128429  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0772  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.55 
 
 		 241 aa  78.6  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0519153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0743  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.55 
 
 		 241 aa  78.6  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1739  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  34.76 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.749284  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1057  cobalt transport protein CbiM  27.27 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1637  cobalt transport protein CbiM  33.59 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000771093 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0192  cobalt transport protein CbiM  30.25 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0108763  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1370  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.58 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.711039  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1959  cobalt transport protein CbiM  30.77 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1044  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  26.64 
 
 		 246 aa  75.1  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.116161 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0298  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  26.17 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.306858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1402  cobalt transport protein CbiM  33.33 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0882  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  34.38 
 
 		 421 aa  72.4  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5179  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.08 
 
 		 229 aa  71.6  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1927  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.83 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2567  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.31 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.29234  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4360  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  26.46 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2134  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.58 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1863  cobalt transport protein CbiM  33.59 
 
 		 352 aa  69.7  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.292788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0330  cobalt transport protein CbiM  27.46 
 
 		 325 aa  68.2  0.00000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1450  cobalt transport protein CbiM  31.25 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.208192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2063  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.65 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0721765  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11090  cobalt transport protein CbiM  34.62 
 
 		 339 aa  67  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000340042  normal  0.0123253 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2109  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.65 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.494306  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2046  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.65 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2291  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.08 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.372139 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1148  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.01 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00870535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0163  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  26.7 
 
 		 310 aa  65.9  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118647  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2305  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.85 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.707195 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1569  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.53 
 
 		 233 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4293  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  36.97 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4058  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.23 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.815174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1803  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.48 
 
 		 352 aa  61.2  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1558  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  34.31 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>