228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1177 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1177  ribosomal RNA adenine dimethylase  100 
 
 		 274 aa  567  1e-161  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2016  methyltransferase  44 
 
 		 283 aa  233  3e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2033  methyltransferase  42.55 
 
 		 302 aa  218  7.999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.931745  normal  0.810156 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1469  methyltransferase type 11  40.96 
 
 		 280 aa  216  2e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000470965  normal  0.0590447 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1090  methyltransferase  37.55 
 
 		 283 aa  202  3e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000294134  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1924  methyltransferase type 12  37.55 
 
 		 291 aa  198  7e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.302412  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1471  methyltransferase type 11  37.82 
 
 		 279 aa  195  8.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0487894  normal  0.185117 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0058  methyltransferase type 11  37.36 
 
 		 287 aa  188  7e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1317  ribosomal RNA adenine dimethylase  35.16 
 
 		 279 aa  181  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222413  normal  0.0120668 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2737  methyltransferase  37.05 
 
 		 278 aa  175  6e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000116085  decreased coverage  0.0000479797 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0245  ribosomal RNA adenine dimethylase  34.43 
 
 		 278 aa  175  9e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14559  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2361  methyltransferase type 12  34.48 
 
 		 291 aa  172  5.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1588  Methyltransferase type 12  36.49 
 
 		 293 aa  162  6e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0308513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0005  Methyltransferase type 11  34.14 
 
 		 293 aa  157  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0234268 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2360  methyltransferase type 12  32.81 
 
 		 319 aa  153  2.9999999999999998e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.328542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1590  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0369722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2275  methyltransferase type 12  33.68 
 
 		 279 aa  144  1e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0040  hypothetical protein  35.14 
 
 		 274 aa  139  6e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.25968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1320  putative methyltransferase  29.57 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1447  hypothetical protein  29.67 
 
 		 280 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.814616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0429  methyltransferase type 12  29.2 
 
 		 275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0150  methyltransferase  28.52 
 
 		 269 aa  118  9e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.520005  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1983  hypothetical protein  31.58 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0326  hypothetical protein  32.14 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1045  hypothetical protein  28.06 
 
 		 277 aa  117  3e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3701  methyltransferase type 12  29.6 
 
 		 279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0046  methyltransferase type 12  27.98 
 
 		 283 aa  114  3e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.165361  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0122  SAM-binding motif-containing protein  29.89 
 
 		 286 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1288  serine protease  30.34 
 
 		 279 aa  106  4e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00462648  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0206  hypothetical protein  30.12 
 
 		 268 aa  106  5e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0297191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1781  SAM (and some other nucleotide) binding motif  27.37 
 
 		 286 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183763  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0812  hypothetical protein  27.45 
 
 		 271 aa  104  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1473  methyltransferase type 12  31.78 
 
 		 270 aa  99  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1216  hypothetical protein  29.15 
 
 		 286 aa  93.6  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.43284  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26420  hypothetical protein  26.87 
 
 		 265 aa  93.6  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0492105  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1982  hypothetical protein  28.63 
 
 		 268 aa  92.8  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0327  putative SAM-dependent methyltransferase  28.26 
 
 		 323 aa  90.9  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0207  hypothetical protein  27.84 
 
 		 287 aa  88.6  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0172227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1672  hypothetical protein  26.09 
 
 		 268 aa  88.2  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.51834  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0599  methyltransferase domain-containing protein  28.31 
 
 		 264 aa  85.1  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.57053  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3103  methyltransferase type 11  26.82 
 
 		 276 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0369  methyltransferase type 12  26.47 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.151072  normal  0.249023 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1224  hypothetical protein  27.43 
 
 		 277 aa  82.4  0.000000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0472515 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1950  putative methyltransferase  27.54 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0292125 
 
 
-
 
NC_002936  DET1495  hypothetical protein  29.83 
 
 		 273 aa  80.5  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000420591  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1271  hypothetical protein  27.82 
 
 		 277 aa  80.1  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000529075  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1285  methyltransferase type 12  29.41 
 
 		 273 aa  79.7  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1550  hypothetical protein  39.52 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0301305  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0235  methyltransferase type 12  29.45 
 
 		 254 aa  79.3  0.00000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1722  hypothetical protein  25.57 
 
 		 279 aa  79  0.00000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0250  hypothetical protein  25.12 
 
 		 273 aa  78.6  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3030  methyltransferase type 12  26.61 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1481  hypothetical protein  30.61 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0281  hypothetical protein  29.49 
 
 		 263 aa  75.5  0.0000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  28.5 
 
 		 288 aa  74.3  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1037  methyltransferase type 12  27.18 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1645  hypothetical protein  33.54 
 
 		 292 aa  70.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0146326 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1916  putative SAM-dependent methyltransferase  28.28 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0817  methyltransferase  34 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2002  hypothetical protein  28.25 
 
 		 289 aa  67  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.419802 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3567  hypothetical protein  27.59 
 
 		 284 aa  65.5  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.109401 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0682  SAM-binding motif-containing protein  24.65 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.206315  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0225  hypothetical protein  25.11 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2505  Methyltransferase type 11  28.14 
 
 		 267 aa  62  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.618552  normal  0.420988 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09260  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  22.91 
 
 		 352 aa  61.6  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.505356  normal  0.0667798 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2351  methyltransferase type 11  27.31 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0117235  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1127  methyltransferase type 12  23.2 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.287777  hitchhiker  0.00000151267 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0961  Methyltransferase type 11  29.93 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0435483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1008  hypothetical protein  26.58 
 
 		 270 aa  57  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.823192 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0091  hypothetical protein  31.31 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0346514  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1797  flagellar basal-body rod protein  30.43 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.119466  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2579  methyltransferase type 11  37.96 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000242226  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0296  methyltransferase type 11  23.81 
 
 		 284 aa  55.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2676  Methyltransferase type 11  35.58 
 
 		 231 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2590  methyltransferase type 11  37.29 
 
 		 260 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01690  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  23.93 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.160618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4629  Methyltransferase type 11  26.83 
 
 		 270 aa  53.1  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0992  Methyltransferase type 11  40.32 
 
 		 255 aa  52.8  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.358942  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0311  hypothetical protein  29.06 
 
 		 237 aa  52.8  0.000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.322092  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3999  Methyltransferase type 11  27.56 
 
 		 274 aa  52.4  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2522  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 280 aa  52  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0795071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  34.88 
 
 		 248 aa  51.6  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1610  Methyltransferase type 11  25.2 
 
 		 274 aa  51.6  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.09 
 
 		 250 aa  52  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0960  methyltransferase  28 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3947  biotin biosynthesis protein BioC  28.39 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1636  dimethyladenosine transferase  31.08 
 
 		 289 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000199976  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  31.16 
 
 		 270 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4141  putative methyltransferase  28.57 
 
 		 273 aa  50.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.34511  normal  0.0273084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0428  methyltransferase type 11  22.14 
 
 		 278 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0438  methyltransferase type 11  22.14 
 
 		 278 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0218483 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0415  methyltransferase type 11  22.14 
 
 		 278 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.670256 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0839  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  35.11 
 
 		 208 aa  50.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.649779  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  36.67 
 
 		 244 aa  50.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2409  hypothetical protein  31.65 
 
 		 217 aa  50.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.452604  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2399  Methyltransferase type 11  26.45 
 
 		 210 aa  50.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.521103  normal  0.920683 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0740  methyltransferase type 11  35.21 
 
 		 249 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5352  methyltransferase type 11  25.83 
 
 		 268 aa  49.7  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1721  hypothetical protein  28.43 
 
 		 239 aa  49.7  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0040  hypothetical protein  28.32 
 
 		 232 aa  49.7  0.00006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>