More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1170 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1170  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  100 
 
 
413 aa  828    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0455  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  64.41 
 
 
428 aa  530  1e-149  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0647  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  59.52 
 
 
429 aa  499  1e-140  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101947  normal  0.0867495 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0744  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  60.48 
 
 
429 aa  487  1e-136  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2121  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  61.11 
 
 
428 aa  486  1e-136  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0707  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  58.7 
 
 
428 aa  468  9.999999999999999e-131  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.172064 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1453  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  56.01 
 
 
427 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.395706 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0457  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase  52.9 
 
 
426 aa  438  9.999999999999999e-123  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0582  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  49.64 
 
 
437 aa  427  1e-118  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.062003  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1403  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  49.88 
 
 
438 aa  427  1e-118  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.175956  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0321  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  49.88 
 
 
438 aa  423  1e-117  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0516  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  49.64 
 
 
438 aa  420  1e-116  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35671  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3708  hexulose-6-phosphate synthase  37.76 
 
 
207 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1849  3-hexulose-6-phosphate synthase  39.56 
 
 
212 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0607  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.46 
 
 
210 aa  130  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0250  hexulose-6-phosphate synthase  41.67 
 
 
228 aa  130  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000013709  normal  0.0274377 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2736  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.55 
 
 
210 aa  130  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0593  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.46 
 
 
210 aa  130  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2812  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.55 
 
 
210 aa  130  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0216  hexulose-6-phosphate synthase, putative  36.81 
 
 
210 aa  128  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2738  hexulose-6-phosphate synthase/SIS domain-containing protein  36.04 
 
 
389 aa  127  5e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2302  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.64 
 
 
225 aa  126  7e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1123  dimethylmenaquinone methyltransferase  39.06 
 
 
192 aa  125  1e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2273  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.9 
 
 
240 aa  123  6e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1654  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.33 
 
 
209 aa  120  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000168104  normal  0.271517 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3043  hexulose-6-phosphate synthase  36.46 
 
 
215 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.146405  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3049  hexulose-6-phosphate synthase  36.46 
 
 
215 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1184  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.69 
 
 
225 aa  117  3e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0998927  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2929  3-hexulose-6-phosphate synthase  38.55 
 
 
211 aa  117  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000015488 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3212  3-hexulose-6-phosphate synthase  34.04 
 
 
211 aa  117  5e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5671  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.33 
 
 
211 aa  116  8.999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.587401 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1871  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.13 
 
 
217 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.563194  normal  0.356021 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6359  hypothetical protein  34.01 
 
 
223 aa  109  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  38.29 
 
 
224 aa  108  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2726  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.72 
 
 
233 aa  107  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305233  normal  0.0255457 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0823  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.69 
 
 
229 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6071  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.18 
 
 
209 aa  105  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4018  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.15 
 
 
232 aa  105  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0935  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  36.02 
 
 
392 aa  103  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0033619  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1994  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  36.84 
 
 
396 aa  103  6e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0718  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.17 
 
 
232 aa  102  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.287716 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7816  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.53 
 
 
213 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05389  hypothetical protein  34.55 
 
 
224 aa  102  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.969658 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5004  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.77 
 
 
219 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.205814  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2429  putative dimethylmenaquinone methyltransferase  33.69 
 
 
235 aa  101  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3165  hypothetical protein  33.51 
 
 
225 aa  101  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25915  normal  0.552325 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0227  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.02 
 
 
227 aa  100  4e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  decreased coverage  0.0096121 
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  30.29 
 
 
216 aa  100  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2021  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.19 
 
 
207 aa  100  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0889  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.95 
 
 
223 aa  99.8  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2380  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.83 
 
 
225 aa  99.8  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9411  demethylmenaquinone methyltransferase  32.47 
 
 
224 aa  99.8  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1928  dimethylmenaquinone methyltransferase  38.06 
 
 
205 aa  99  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.787476  hitchhiker  0.00228762 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2666  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.15 
 
 
207 aa  98.6  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2610  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  27.21 
 
 
615 aa  97.8  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1085  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  37.16 
 
 
393 aa  98.2  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.136979  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3204  hypothetical protein  31.16 
 
 
237 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295684  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04570  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.66 
 
 
231 aa  97.4  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4928  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.36 
 
 
219 aa  97.4  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17069  normal  0.0179831 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8625  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.82 
 
 
236 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.422142  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0996  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  32.63 
 
 
403 aa  97.4  4e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.566431 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2031  hypothetical protein  35.29 
 
 
229 aa  96.7  6e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.731044 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3078  hypothetical protein  33.17 
 
 
215 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.177547  normal  0.0349255 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3633  hypothetical protein  35.56 
 
 
231 aa  95.5  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.715784 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1382  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.37 
 
 
231 aa  95.5  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2737  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  26.84 
 
 
615 aa  95.1  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0479  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.97 
 
 
234 aa  95.5  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145449  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0614  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  38.98 
 
 
391 aa  94.7  3e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.46 
 
 
239 aa  94  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5742  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase/oxaloacetate decarboxylase  37.7 
 
 
235 aa  94  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228064  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4023  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.52 
 
 
198 aa  93.6  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0575059 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2315  hypothetical protein  35.18 
 
 
222 aa  94  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.612121  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0708  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.55 
 
 
222 aa  93.6  6e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.942951  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5818  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.84 
 
 
205 aa  93.2  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.95078  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1131  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.64 
 
 
450 aa  93.2  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5904  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.18 
 
 
237 aa  92.8  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.314397 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6118  hypothetical protein  39.68 
 
 
222 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4138  hypothetical protein  34.02 
 
 
224 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6375  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.93 
 
 
224 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.830889  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00687  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.28 
 
 
207 aa  92.4  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2988  hypothetical protein  32.98 
 
 
212 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8321  hypothetical protein  32.99 
 
 
224 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242879  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7077  hypothetical protein  31.96 
 
 
224 aa  91.3  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4544  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.28 
 
 
224 aa  90.9  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0521479 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0095  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.13 
 
 
209 aa  90.5  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3549  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.14 
 
 
208 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0526582 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3877  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.54 
 
 
224 aa  89.7  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0198  hypothetical protein  33.49 
 
 
237 aa  90.1  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2119  hypothetical protein  34.68 
 
 
239 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1628  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  34.25 
 
 
393 aa  89.4  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3330  Dimethylmenaquinone methyltransferase  38.37 
 
 
187 aa  89.4  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00629512  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5386  hypothetical protein  30.32 
 
 
244 aa  89  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.85637 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  32.62 
 
 
233 aa  88.6  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2296  hypothetical protein  32.87 
 
 
238 aa  88.2  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000995564  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1367  hypothetical protein  32.11 
 
 
212 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.797673 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0590  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.93 
 
 
206 aa  88.6  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246427  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0600  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.06 
 
 
212 aa  88.2  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4165  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.95 
 
 
196 aa  88.2  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777049  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2698  hypothetical protein  36.84 
 
 
227 aa  87.8  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.275881  normal  0.549392 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3988  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.39 
 
 
231 aa  87.4  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34613  normal  0.0761518 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>