More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1150 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 291 aa  583  1e-166  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  68.73 
 
 		 291 aa  421  1e-117  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  59.31 
 
 		 291 aa  348  7e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  55.4 
 
 		 295 aa  338  5e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  58.76 
 
 		 291 aa  337  9.999999999999999e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  56.6 
 
 		 291 aa  332  5e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  56.12 
 
 		 313 aa  329  4e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  54.68 
 
 		 332 aa  320  9.999999999999999e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2744  dihydrodipicolinate synthase  52.6 
 
 		 309 aa  308  6.999999999999999e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  54.61 
 
 		 291 aa  306  2.0000000000000002e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0979  dihydrodipicolinate synthase  52.74 
 
 		 307 aa  303  2.0000000000000002e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0699558  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  54.38 
 
 		 314 aa  303  2.0000000000000002e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  49.66 
 
 		 289 aa  297  1e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  52.05 
 
 		 292 aa  295  7e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  49.49 
 
 		 289 aa  293  2e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0530  dihydrodipicolinate synthase  51.92 
 
 		 297 aa  291  1e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.4261 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  49.32 
 
 		 292 aa  286  2e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  48.46 
 
 		 289 aa  286  4e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  50.51 
 
 		 293 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  50.17 
 
 		 292 aa  282  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  47.93 
 
 		 297 aa  280  2e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  47.6 
 
 		 290 aa  279  4e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  47.6 
 
 		 290 aa  279  4e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  49.65 
 
 		 292 aa  278  5e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  49.15 
 
 		 289 aa  277  1e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  46.92 
 
 		 290 aa  278  1e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3171  dihydrodipicolinate synthase  53.21 
 
 		 308 aa  276  2e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.288667 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  47.26 
 
 		 290 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  49.15 
 
 		 293 aa  273  3e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 		 292 aa  272  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  46.58 
 
 		 290 aa  268  5.9999999999999995e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  48.63 
 
 		 292 aa  267  1e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  47.6 
 
 		 292 aa  267  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  47.26 
 
 		 288 aa  268  1e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  46.29 
 
 		 298 aa  264  1e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  46.42 
 
 		 292 aa  264  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  45.89 
 
 		 292 aa  261  8e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  46.23 
 
 		 292 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  44.71 
 
 		 292 aa  261  1e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  46.78 
 
 		 295 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  46.78 
 
 		 295 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  45.21 
 
 		 292 aa  258  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  44.86 
 
 		 296 aa  258  1e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1139  dihydrodipicolinate synthase  45.05 
 
 		 292 aa  257  1e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3179  dihydrodipicolinate synthase  45.05 
 
 		 292 aa  257  1e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0330313  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4181  dihydrodipicolinate synthase  46.78 
 
 		 295 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  44.03 
 
 		 290 aa  257  2e-67  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1247  dihydrodipicolinate synthase  45.39 
 
 		 293 aa  256  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1362  dihydrodipicolinate synthase  45.39 
 
 		 299 aa  256  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.147738  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3132  dihydrodipicolinate synthase  45.39 
 
 		 299 aa  256  3e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  44.18 
 
 		 290 aa  256  4e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  44.9 
 
 		 297 aa  256  5e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  45.73 
 
 		 292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2974  dihydrodipicolinate synthase  44.37 
 
 		 292 aa  253  4.0000000000000004e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.484069 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  44.18 
 
 		 290 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3509  dihydrodipicolinate synthase  44.03 
 
 		 293 aa  251  7e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  45.89 
 
 		 292 aa  251  8.000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  45.92 
 
 		 292 aa  251  8.000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02370  dihydrodipicolinate synthase  43.69 
 
 		 292 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02332  hypothetical protein  43.69 
 
 		 292 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  43.92 
 
 		 300 aa  251  1e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3700  dihydrodipicolinate synthase  43.69 
 
 		 292 aa  251  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2610  dihydrodipicolinate synthase  43.69 
 
 		 292 aa  251  1e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2760  dihydrodipicolinate synthase  43.69 
 
 		 292 aa  251  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2625  dihydrodipicolinate synthase  43.69 
 
 		 292 aa  251  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2850  dihydrodipicolinate synthase  43.69 
 
 		 292 aa  251  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1191  dihydrodipicolinate synthase  43.34 
 
 		 292 aa  250  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  45.21 
 
 		 291 aa  250  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1198  dihydrodipicolinate synthase  43.34 
 
 		 292 aa  250  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  47.42 
 
 		 292 aa  249  3e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  44.86 
 
 		 297 aa  249  4e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  42.76 
 
 		 292 aa  249  5e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  43.4 
 
 		 290 aa  248  6e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  42.96 
 
 		 300 aa  249  6e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0897  dihydrodipicolinate synthase  46.74 
 
 		 298 aa  248  7e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0827  dihydrodipicolinate synthase  46.74 
 
 		 298 aa  248  7e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.179848  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1204  dihydrodipicolinate synthase  46.39 
 
 		 298 aa  248  8e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.247588  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2682  dihydrodipicolinate synthase  43.34 
 
 		 292 aa  248  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.958571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2748  dihydrodipicolinate synthase  43.34 
 
 		 292 aa  248  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2723  dihydrodipicolinate synthase  43.34 
 
 		 292 aa  248  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2634  dihydrodipicolinate synthase  43.34 
 
 		 292 aa  248  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1552  dihydrodipicolinate synthase  44.95 
 
 		 286 aa  247  1e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224782  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  45.99 
 
 		 291 aa  248  1e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2855  dihydrodipicolinate synthase  43.34 
 
 		 292 aa  247  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.239791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  45.89 
 
 		 293 aa  247  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  43.15 
 
 		 297 aa  246  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  43.84 
 
 		 292 aa  247  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  42.61 
 
 		 300 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  42.61 
 
 		 300 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  42.61 
 
 		 300 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  43 
 
 		 294 aa  246  3e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  42.61 
 
 		 300 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  42.61 
 
 		 300 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  42.61 
 
 		 291 aa  246  3e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  42.61 
 
 		 300 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  45.33 
 
 		 294 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  42.61 
 
 		 300 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  43.3 
 
 		 301 aa  246  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2493  dihydrodipicolinate synthase  45.05 
 
 		 300 aa  246  4e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  42.18 
 
 		 294 aa  245  6.999999999999999e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>