59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1146 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1146  CAAX amino terminal protease family protein  100 
 
 
291 aa  568  1e-161  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1134  hypothetical protein  48.72 
 
 
280 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0055  hypothetical protein  45.56 
 
 
396 aa  223  4e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00436559  normal  0.0480998 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2009  abortive infection protein  44.81 
 
 
271 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0143983  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_679  CAAX amino terminal protease  28.9 
 
 
242 aa  80.9  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.112171  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2968  Abortive infection protein  26.92 
 
 
244 aa  79.7  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.337339  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0699  abortive infection protein  28.9 
 
 
246 aa  77.8  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0773  CAAX amino terminal protease family protein  28.44 
 
 
246 aa  71.2  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0393  Abortive infection protein  33.33 
 
 
312 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00491577  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0879  CAAX amino terminal protease family protein  36.9 
 
 
273 aa  55.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00516556  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0752  Abortive infection protein  31.87 
 
 
374 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5184  hypothetical protein  28.38 
 
 
280 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0151548 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2823  Abortive infection protein  34.69 
 
 
297 aa  53.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2417  abortive infection protein  36.36 
 
 
362 aa  52.8  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000014849  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0988  CAAX amino terminal protease family protein  35.71 
 
 
273 aa  52.4  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000602238  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2196  Abortive infection protein  36.08 
 
 
325 aa  52.4  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.260267  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47750  Abortive infection like protein  35.53 
 
 
255 aa  52.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.090706  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  34.72 
 
 
267 aa  52  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3796  abortive infection protein  28.7 
 
 
602 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238364  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2572  Abortive infection protein  27.41 
 
 
251 aa  52  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.610355  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0959  Abortive infection protein  35.48 
 
 
308 aa  50.4  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5653  abortive infection protein  38.64 
 
 
302 aa  49.7  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.122774 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0359  Abortive infection protein  33.71 
 
 
321 aa  49.3  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1209  abortive infection protein  27.08 
 
 
188 aa  49.3  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1482  hypothetical protein  36.63 
 
 
401 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1501  hypothetical protein  40.74 
 
 
401 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1317  Abortive infection protein  35.37 
 
 
251 aa  47.4  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.254651  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5134  Abortive infection protein  31.71 
 
 
280 aa  46.2  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3003  abortive infection protein  30.1 
 
 
301 aa  46.2  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.167369  normal  0.743938 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2598  abortive infection protein  30.86 
 
 
198 aa  46.2  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000681964  hitchhiker  0.000046555 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15071  predicted protein  30.39 
 
 
237 aa  45.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00688834  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1871  hypothetical protein  29.63 
 
 
286 aa  45.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000201815  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2226  CAAX amino terminal protease family protein  33.68 
 
 
299 aa  45.4  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6387  hypothetical protein  31.52 
 
 
280 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.319282 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3006  Abortive infection protein  32.73 
 
 
280 aa  45.4  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.969878  normal  0.541418 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1503  Abortive infection protein  46 
 
 
276 aa  45.4  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.209578  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0659  abortive infection protein  42.11 
 
 
328 aa  45.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1735  abortive infection protein  38.64 
 
 
272 aa  45.4  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07541  membrane-associated protease  39.62 
 
 
435 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.627797 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1507  Abortive infection protein  34.13 
 
 
538 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.950737 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1873  hypothetical protein  28.57 
 
 
288 aa  44.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000278939  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2685  abortive infection protein  30.43 
 
 
252 aa  45.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0320282  normal  0.973505 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0702  membrane associated protease  37.65 
 
 
420 aa  44.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0151  Abortive infection protein  28.97 
 
 
276 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2782  hypothetical protein  28.57 
 
 
309 aa  45.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2118  CAAX amino terminal protease family protein  26.37 
 
 
240 aa  44.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.602781  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1408  abortive infection protein  30.49 
 
 
187 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000101679  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_6079  predicted protein  34.09 
 
 
234 aa  43.9  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.392494  normal  0.133963 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2712  Abortive infection protein  33.66 
 
 
372 aa  44.3  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2192  Abortive infection protein  31.46 
 
 
201 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3435  Abortive infection protein  26.14 
 
 
216 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.103532  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3804  CAAX amino terminal protease family protein  25 
 
 
187 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000276045  hitchhiker  1.95996e-16 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2280  abortive infection protein  35.16 
 
 
269 aa  42.7  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0017  CAAX amino terminal protease family protein  34.12 
 
 
227 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000644496  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2995  Abortive infection protein  30.93 
 
 
321 aa  42.7  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1395  CAAX amino terminal protease family protein  24.39 
 
 
187 aa  42.4  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000488789  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4418  abortive infection protein  27.69 
 
 
292 aa  42.4  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0787436  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1506  CAAX amino terminal protease family protein  24.39 
 
 
187 aa  42.4  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000177137  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2288  Abortive infection protein  34.74 
 
 
241 aa  42.4  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.295028 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>