261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1090 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1090  bacteriochlorophyll synthase 43 kDa subunit  100 
 
 		 385 aa  790    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0939  FAD dependent oxidoreductase  58.7 
 
 		 385 aa  482  1e-135  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0379493  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0513  FAD dependent oxidoreductase  38.54 
 
 		 385 aa  260  3e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.349245  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  31.06 
 
 		 390 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  29.55 
 
 		 390 aa  152  1e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  29.73 
 
 		 406 aa  152  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  30.05 
 
 		 390 aa  149  6e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  30.92 
 
 		 408 aa  138  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  27.56 
 
 		 391 aa  139  1e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  28.46 
 
 		 390 aa  137  2e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  29.14 
 
 		 407 aa  126  8.000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  28.17 
 
 		 391 aa  126  8.000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  26.8 
 
 		 395 aa  122  7e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  27.82 
 
 		 387 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  29.71 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  27.97 
 
 		 399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  28.96 
 
 		 402 aa  103  6e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  26.42 
 
 		 386 aa  102  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  29.88 
 
 		 396 aa  102  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  25.74 
 
 		 399 aa  97.8  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  26.93 
 
 		 375 aa  97.4  3e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  27.71 
 
 		 365 aa  97.1  5e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  29.59 
 
 		 398 aa  91.3  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  24.02 
 
 		 393 aa  90.5  4e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  25.49 
 
 		 381 aa  89.4  9e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  24.65 
 
 		 382 aa  86.7  6e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2942  hypothetical protein  25.56 
 
 		 416 aa  86.7  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.33678  normal  0.0128685 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  24.1 
 
 		 396 aa  86.3  8e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  26.54 
 
 		 402 aa  86.3  8e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  26.87 
 
 		 398 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  24.1 
 
 		 379 aa  83.6  0.000000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0431  PUA domain-containing protein  25.53 
 
 		 397 aa  82.4  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0005  geranylgeranyl reductase  25.52 
 
 		 360 aa  78.2  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_677  hypothetical protein  21.91 
 
 		 379 aa  77.4  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.545095  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4604  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  24.73 
 
 		 432 aa  75.5  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2507  FAD dependent oxidoreductase  24.05 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0083  putative oxidoreductase FixC  22.6 
 
 		 428 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.715205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0087  putative oxidoreductase FixC  22.32 
 
 		 428 aa  74.3  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0086  putative oxidoreductase FixC  22.32 
 
 		 428 aa  73.2  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0083  putative oxidoreductase FixC  22.32 
 
 		 428 aa  73.2  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0084  putative oxidoreductase FixC  22.32 
 
 		 428 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00047  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  23.82 
 
 		 428 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3556  FAD dependent oxidoreductase  23.82 
 
 		 428 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3612  putative oxidoreductase FixC  23.82 
 
 		 428 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0214955 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0049  putative oxidoreductase FixC  23.82 
 
 		 428 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00046  hypothetical protein  23.82 
 
 		 428 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0047  putative oxidoreductase FixC  23.23 
 
 		 428 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2774  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  25.69 
 
 		 430 aa  70.9  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.372841  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1653  FAD-binding monooxygenase  24.76 
 
 		 404 aa  70.5  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  24.57 
 
 		 391 aa  70.1  0.00000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  22.96 
 
 		 386 aa  69.7  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0045  putative oxidoreductase FixC  22.95 
 
 		 428 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.820288  normal  0.96055 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0047  putative oxidoreductase FixC  23.27 
 
 		 428 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0472  geranylgeranyl reductase  22.8 
 
 		 385 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.730289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  25.82 
 
 		 370 aa  67.8  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2206  FAD dependent oxidoreductase  22.34 
 
 		 410 aa  67  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.685598 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3460  geranylgeranyl reductase  25.3 
 
 		 362 aa  66.2  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1822  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  22.28 
 
 		 431 aa  66.2  0.0000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154  normal  0.170222 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3927  FAD dependent oxidoreductase  25.06 
 
 		 431 aa  66.2  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  21.98 
 
 		 392 aa  66.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1401  geranylgeranyl reductase  24.56 
 
 		 376 aa  65.9  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0636  glucose-inhibited division protein A  29.89 
 
 		 395 aa  65.1  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.779451  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0479  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  22.69 
 
 		 425 aa  65.1  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000230935  decreased coverage  0.000263259 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3185  monooxygenase FAD-binding protein  32.34 
 
 		 375 aa  64.3  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.388588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3106  FAD dependent oxidoreductase  22.65 
 
 		 472 aa  64.3  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000790545 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0810  geranylgeranyl reductase  21.98 
 
 		 384 aa  64.7  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236364  normal  0.332437 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1955  hypothetical protein  25.14 
 
 		 405 aa  64.7  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1496  geranylgeranyl reductase  23.96 
 
 		 361 aa  64.7  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.963353  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  24.88 
 
 		 394 aa  63.5  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  24.88 
 
 		 394 aa  63.5  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0574  FAD dependent oxidoreductase  23.89 
 
 		 429 aa  63.5  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1042  geranylgeranyl reductase  23.86 
 
 		 388 aa  63.5  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  25.07 
 
 		 435 aa  63.2  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1397  hypothetical protein  24.31 
 
 		 429 aa  63.2  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.222986  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  25.48 
 
 		 363 aa  62.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0313  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  23.27 
 
 		 430 aa  62  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.800751  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3091  FAD dependent oxidoreductase  23.68 
 
 		 410 aa  62  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.275239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  25.75 
 
 		 375 aa  61.6  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1405  monooxygenase FAD-binding  26.26 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.144812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1854  geranylgeranyl reductase  24.92 
 
 		 408 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0189229 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0114  FAD dependent oxidoreductase  26.29 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00154267  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3081  FAD dependent oxidoreductase  23.8 
 
 		 413 aa  60.8  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1220  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  23.54 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  24.18 
 
 		 457 aa  60.1  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  24.8 
 
 		 423 aa  60.1  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  22.48 
 
 		 421 aa  60.1  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  24.8 
 
 		 424 aa  59.3  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  22.74 
 
 		 400 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  23.58 
 
 		 379 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  24.86 
 
 		 425 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3528  geranylgeranyl reductase  24.94 
 
 		 394 aa  59.3  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.673829 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  25.87 
 
 		 387 aa  58.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  23.54 
 
 		 431 aa  58.2  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1496  hypothetical protein  21.8 
 
 		 429 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.403861 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  23.2 
 
 		 431 aa  57.8  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  24.07 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  24 
 
 		 423 aa  57  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1902  hypothetical protein  21.73 
 
 		 429 aa  56.6  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0590  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.74 
 
 		 407 aa  56.6  0.0000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00186747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>