More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1067 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0141  hydantoinase  56.95 
 
 
644 aa  771    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.456007 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1067  hydantoinase  100 
 
 
671 aa  1371    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1068  hydantoinase  57.01 
 
 
642 aa  751    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2490  hydantoinase  58.03 
 
 
636 aa  779    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2491  hydantoinase  54.92 
 
 
701 aa  741    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0817  hydantoinase/oxoprolinase  52.57 
 
 
638 aa  721    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.391568  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0899  hydantoinase/oxoprolinase  55.67 
 
 
643 aa  726    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.742994  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0900  hydantoinase/oxoprolinase  57.98 
 
 
641 aa  767    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.409671  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1134  hydantoinase/oxoprolinase  50.82 
 
 
645 aa  685    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.187357  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1967  hydantoinase/oxoprolinase  53.56 
 
 
639 aa  742    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3269  hydantoinase/oxoprolinase  36.43 
 
 
667 aa  331  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471232  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1734  Hydantoinase/oxoprolinase  32.32 
 
 
658 aa  329  1.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2805  hydantoinase/oxoprolinase  33.96 
 
 
668 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.726576 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3293  hydantoinase/oxoprolinase  34.47 
 
 
675 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.220696  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3607  hypothetical protein  34.56 
 
 
675 aa  280  9e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0092  hydantoinase/oxoprolinase family protein  30.9 
 
 
575 aa  244  3e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0187  Hydantoinase/oxoprolinase  29.91 
 
 
553 aa  240  5e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2933  hydantoinase/oxoprolinase  31.1 
 
 
570 aa  227  4e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.714431 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2177  Hydantoinase/oxoprolinase  31.59 
 
 
665 aa  204  4e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22450  N-methylhydantoinase (ATP-hydrolyzing)  35.56 
 
 
579 aa  170  9e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4059  hydantoinase/oxoprolinase  34.46 
 
 
566 aa  168  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0836  Hydantoinase/oxoprolinase  34.51 
 
 
583 aa  160  5e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0997414 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1002  hydantoinase/oxoprolinase  31.04 
 
 
550 aa  160  5e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184636  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2282  hydantoinase/oxoprolinase family protein  34.42 
 
 
550 aa  160  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0222  Hydantoinase/oxoprolinase  34.15 
 
 
557 aa  158  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.134992 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2933  hydantoinase/oxoprolinase  33.23 
 
 
570 aa  152  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0177705 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0990  hydantoinase/oxoprolinase  34.55 
 
 
557 aa  152  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.454811 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3162  hydantoinase/oxoprolinase  31.06 
 
 
572 aa  152  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3586  Hydantoinase/oxoprolinase  31.09 
 
 
519 aa  148  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0167077  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0779  Hydantoinase/oxoprolinase  31.79 
 
 
553 aa  146  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1963  hydantoinase/oxoprolinase  31.09 
 
 
516 aa  145  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2126  Hydantoinase/oxoprolinase  33.73 
 
 
556 aa  145  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.031039  normal  0.0613561 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1547  hydantoinase/oxoprolinase  32.35 
 
 
515 aa  144  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1404  hydantoinase/oxoprolinase  32.42 
 
 
560 aa  143  9.999999999999999e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0652  Hydantoinase/oxoprolinase  32.55 
 
 
516 aa  142  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0481682 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3765  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.55 
 
 
690 aa  134  5e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.32896  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0865  Hydantoinase/oxoprolinase  32.8 
 
 
518 aa  133  7.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.235208  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1851  hydantoinase/oxoprolinase  29.79 
 
 
518 aa  130  8.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.51976  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0176  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.76 
 
 
682 aa  129  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4116  Hydantoinase/oxoprolinase  29.97 
 
 
519 aa  128  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665366  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0999  Hydantoinase/oxoprolinase  31 
 
 
564 aa  127  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0427  hydantoinase/oxoprolinase  28.53 
 
 
519 aa  127  5e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0645976  normal  0.347806 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1886  hydantoinase/oxoprolinase  32.93 
 
 
560 aa  127  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1032  Hydantoinase/oxoprolinase  30.37 
 
 
546 aa  125  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2949  hydantoinase/oxoprolinase  32.72 
 
 
519 aa  126  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9128  hydantoin utilization protein  28.41 
 
 
680 aa  125  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2447  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.64 
 
 
683 aa  124  5e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2141  Hydantoinase/oxoprolinase  30.32 
 
 
519 aa  122  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0444045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3366  N-methylhydantoinase A, beta-subunit (ATP- hydrolyzing)  29.28 
 
 
507 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.712496  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0975  hydantoinase/oxoprolinase  29.43 
 
 
559 aa  122  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1473  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.41 
 
 
687 aa  122  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0095  hydantoinase/oxoprolinase  28.32 
 
 
517 aa  122  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2142  Hydantoinase/oxoprolinase  30.63 
 
 
693 aa  121  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1876  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.12 
 
 
690 aa  120  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07952  conserved hypothetical protein  29.23 
 
 
994 aa  120  9e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77272  normal  0.240542 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2452  Hydantoinase/oxoprolinase  30.5 
 
 
513 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.79439  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2416  putative hydantoinase A  30.3 
 
 
517 aa  119  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5378  hydantoinase  28.7 
 
 
517 aa  119  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0691  hydantoin utilization protein A  29.8 
 
 
689 aa  118  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.167885  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0422  hydantoinase/oxoprolinase  31.14 
 
 
715 aa  117  5e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1995  Hydantoinase/oxoprolinase  30.87 
 
 
522 aa  117  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2513  Hydantoinase/oxoprolinase  29.29 
 
 
734 aa  117  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0312936 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2734  Hydantoinase/oxoprolinase  28.88 
 
 
559 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1696  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.27 
 
 
684 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2860  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.73 
 
 
684 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1825  hydantoinase/oxoprolinase  29.79 
 
 
523 aa  114  4.0000000000000004e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3103  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  28.45 
 
 
660 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.133099  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3641  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.76 
 
 
676 aa  113  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3583  Hydantoinaseoxoprolinase domain protein  28.57 
 
 
463 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4047  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.61 
 
 
676 aa  112  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0166577  decreased coverage  0.00142198 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0161  Hydantoinase/oxoprolinase  29.15 
 
 
715 aa  111  3e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5622  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.41 
 
 
706 aa  112  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.49803 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5243  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.41 
 
 
765 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0452  Hydantoinase/oxoprolinase  27.82 
 
 
693 aa  111  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00475089 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3064  Hydantoinase/oxoprolinase  28.2 
 
 
526 aa  111  5e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1727  Hydantoinase/oxoprolinase  29.87 
 
 
522 aa  110  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.666608  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2018  Hydantoinase/oxoprolinase  27.62 
 
 
707 aa  110  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.128113  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0574  Hydantoinase/oxoprolinase  29.64 
 
 
708 aa  110  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000997997  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1060  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.57 
 
 
684 aa  110  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5342  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.92 
 
 
699 aa  110  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4143  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.15 
 
 
702 aa  109  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2942  5-oxoprolinase  30.41 
 
 
669 aa  109  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5220  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.66 
 
 
680 aa  108  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46382  normal  0.858688 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0985  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.89 
 
 
726 aa  107  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.623858  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3384  Hydantoinase/oxoprolinase  28.28 
 
 
735 aa  107  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.637442  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20111  hydantoinase/oxoprolinase:hydantoinase B/oxoprolinase  27.61 
 
 
1224 aa  106  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20940  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  28.03 
 
 
706 aa  107  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796393  normal  0.0791884 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1125  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.38 
 
 
714 aa  106  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.875999  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00009  hypothetical N-methylhydantoinase (Eurofung)  28.82 
 
 
1362 aa  106  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000169521 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01100  hypothetical 5-oxoprolinase (Eurofung)  28.74 
 
 
1355 aa  105  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0381114 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5966  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.8 
 
 
694 aa  105  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.858122  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3957  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.51 
 
 
674 aa  105  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0079  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.15 
 
 
687 aa  105  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3601  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.93 
 
 
682 aa  104  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4193  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.42 
 
 
765 aa  104  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5632  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.93 
 
 
698 aa  104  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0796839 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6272  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.21 
 
 
687 aa  103  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.106273 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0790  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.5 
 
 
679 aa  103  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.745628 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2177  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.28 
 
 
1206 aa  103  9e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8488  Hydantoinase/oxoprolinase  25.22 
 
 
682 aa  103  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.593385  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>