118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1065 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1065  putative regulatory protein  100 
 
 		 194 aa  371  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0263  GPR1/FUN34/yaaH family protein  52.17 
 
 		 199 aa  191  6e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0492  GPR1/FUN34/yaaH family protein  51.27 
 
 		 197 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0724  GPR1/FUN34/yaaH  49.46 
 
 		 214 aa  182  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0761  GPR1/FUN34/yaaH family protein  48.39 
 
 		 214 aa  178  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.954499  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0761  GPR1/FUN34/yaaH family protein  47.85 
 
 		 214 aa  177  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.444258  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1126  GPR1/FUN34/yaaH  46.7 
 
 		 203 aa  176  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0815  GPR1/FUN34/YaaH family protein  52.15 
 
 		 205 aa  174  6e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0065  GPR1/FUN34/yaaH family protein  50.27 
 
 		 196 aa  174  8e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3478  GPR1/FUN34/yaaH family protein  49.46 
 
 		 195 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1224  transcriptional regulator  50.25 
 
 		 200 aa  169  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1357  GPR1/FUN34/yaaH family protein  51.61 
 
 		 194 aa  169  3e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.55658  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0577  hypothetical protein  46.41 
 
 		 188 aa  168  5e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.825629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2076  GPR1/FUN34/yaaH family protein  46.67 
 
 		 183 aa  166  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2772  GPR1/FUN34/yaaH family protein  45.96 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.713345  normal  0.632048 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0605  GPR1/FUN34/yaaH family protein  46.77 
 
 		 197 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3467  hypothetical protein  46.96 
 
 		 203 aa  165  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000614268  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0798  hypothetical protein  46.96 
 
 		 203 aa  165  4e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000907373  normal  0.0776345 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3595  hypothetical protein  46.96 
 
 		 203 aa  165  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0906121  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0009  hypothetical protein  45.86 
 
 		 188 aa  165  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.207704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0009  hypothetical protein  45.86 
 
 		 188 aa  165  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.436891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0009  hypothetical protein  45.86 
 
 		 188 aa  165  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.350527  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0009  hypothetical protein  45.86 
 
 		 188 aa  165  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.396236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0552  hypothetical protein  48.69 
 
 		 194 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.85069e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0009  hypothetical protein  45.86 
 
 		 188 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.969771  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0580  hypothetical protein  46.93 
 
 		 190 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436863  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3855  hypothetical protein  46.45 
 
 		 191 aa  161  7e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.770098  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0541  hypothetical protein  44.26 
 
 		 190 aa  160  8.000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.49636  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00010  conserved inner membrane protein associated with acetate transport  43.65 
 
 		 188 aa  159  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3586  GPR1/FUN34/yaaH family protein  43.65 
 
 		 188 aa  159  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0237  Gpr1/Fun34/YaaH family protein  45.3 
 
 		 183 aa  159  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0634  GPR1/FUN34/yaaH  45.64 
 
 		 198 aa  159  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0870411  normal  0.0467455 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0011  hypothetical protein  43.65 
 
 		 188 aa  159  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.708242  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0010  hypothetical protein  43.65 
 
 		 188 aa  159  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3645  hypothetical protein  43.65 
 
 		 188 aa  159  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0009  hypothetical protein  43.65 
 
 		 188 aa  159  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0011  hypothetical protein  43.65 
 
 		 188 aa  159  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00010  hypothetical protein  43.65 
 
 		 188 aa  159  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1050  GPR1/FUN34/yaaH family protein  45.3 
 
 		 203 aa  159  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0890  GPR1/FUN34/yaaH family protein  46.96 
 
 		 199 aa  158  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.400956  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3660  hypothetical protein  44.81 
 
 		 191 aa  158  5e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.444217  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0010  hypothetical protein  43.09 
 
 		 188 aa  157  9e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.728204  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1348  GPR1/FUN34/yaaH family protein  48.39 
 
 		 197 aa  157  1e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00408603 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0999  hypothetical protein  45.3 
 
 		 203 aa  156  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1327  GPR1/FUN34/yaaH family protein  45.36 
 
 		 197 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.39924  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0524  GPR1/FUN34/yaaH family protein  46.2 
 
 		 196 aa  152  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3588  gpr1/fun34/yaaH family protein  44.2 
 
 		 189 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1108  GPR1/FUN34/yaaH family protein  44.75 
 
 		 187 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00215615 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3002  GPR1/FUN34/yaaH family protein  43.65 
 
 		 189 aa  150  8e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0614903  normal  0.240175 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3180  GPR1/FUN34/yaaH family protein  43.65 
 
 		 189 aa  150  8e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3083  GPR1/FUN34/yaaH family protein  43.65 
 
 		 189 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0605595  normal  0.462598 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1014  GPR1/FUN34/yaaH family protein  44.2 
 
 		 187 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.264314  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01082  hypothetical protein  45.3 
 
 		 197 aa  150  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1075  GPR1/FUN34/yaaH family protein  44.2 
 
 		 187 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0691  hypothetical protein  47.8 
 
 		 199 aa  149  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.003925  hitchhiker  0.00210263 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0904  GPR1/FUN34/yaaH family protein  41.99 
 
 		 188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0299  hypothetical protein  44.2 
 
 		 197 aa  145  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0755  GPR1/FUN34/yaaH  43.81 
 
 		 190 aa  144  9e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.830173  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004328  hypothetical protein  43.65 
 
 		 196 aa  143  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3630  GPR1/FUN34/yaaH family protein  42.54 
 
 		 209 aa  143  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2835  GPR1/FUN34/yaaH family protein  45.25 
 
 		 193 aa  138  3.9999999999999997e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.244228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1320  membrane protein  44.38 
 
 		 183 aa  137  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1006  GPR1/FUN34/yaaH family protein  45.3 
 
 		 187 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0753776  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3283  GPR1/FUN34/yaaH family protein  45.3 
 
 		 187 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0944573 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0695  gpr1/fun34/YaaH family protein  44.69 
 
 		 200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1124  GPR1/FUN34/yaaH family protein  38.25 
 
 		 196 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.546055 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2982  GPR1/FUN34/yaaH family protein  39.25 
 
 		 186 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.119024  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0364  GPR1/FUN34/yaaH family protein  43.58 
 
 		 186 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000485253  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1410  hypothetical protein  39.04 
 
 		 204 aa  125  3e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1100  GPR1/FUN34/yaaH family protein  41.85 
 
 		 198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.679326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5595  GPR1/FUN34/yaaH family protein  40 
 
 		 201 aa  111  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1861  hypothetical protein  37.57 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1480  permease  36.17 
 
 		 189 aa  95.1  5e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4506  GPR1/FUN34/yaaH family protein  32.35 
 
 		 202 aa  94  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0014  GPR1/FUN34/yaaH family protein  36.07 
 
 		 183 aa  92.8  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0029  GPR1/FUN34/yaaH family protein  33.33 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2192  GPR1/FUN34/yaaH family protein  30.05 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00032608 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1305  GPR1/FUN34/yaaH family protein  34.39 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0666  GPR1/FUN34/yaaH family protein  34.64 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0435275  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22570  predicted membrane protein  31.05 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.216454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1253  GPR1/FUN34/yaaH family protein  33.33 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.284277  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1352  GPR1/FUN34/yaaH family protein  32.2 
 
 		 186 aa  77.8  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000041614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7849  predicted protein  33.33 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.161215 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02960  conserved hypothetical protein  33.51 
 
 		 257 aa  74.7  0.0000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.392793  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1117  GPR1/FUN34/yaaH family protein  29.57 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0710546  normal  0.454396 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31420  predicted protein  31.53 
 
 		 258 aa  71.6  0.000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.450745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83722  Accumulation of DYads  31.63 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03640  membrane protein, putative  30.57 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0291661  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1287  GPR1/FUN34/yaaH family protein  29.95 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00383069  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35800  predicted protein  33.73 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0228  GPR1/FUN34/yaaH family protein  33.14 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2423  GPR1/FUN34/yaaH family protein  34.09 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000542283  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0212  GPR1/FUN34/yaaH family protein  33.14 
 
 		 209 aa  67.8  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0761648 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3336  hypothetical protein  28.79 
 
 		 206 aa  67  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000909805  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3301  GPR1/FUN34/yaaH family protein  28.79 
 
 		 206 aa  67  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.83805e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3597  hypothetical protein  28.79 
 
 		 206 aa  67  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000113907  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3560  hypothetical protein  28.79 
 
 		 206 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000016345  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3650  hypothetical protein  28.79 
 
 		 206 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014703  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1667  hypothetical protein  28.79 
 
 		 206 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  hitchhiker  6.45658e-23 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3551  hypothetical protein  29.35 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8351e-43 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>