More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1052 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  100 
 
 
1046 aa  2122  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3007  two component system histidine kinase  38.64 
 
 
729 aa  501  1e-140  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0422303  hitchhiker  0.00299589 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.3 
 
 
1003 aa  400  1e-110  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.284418 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.6 
 
 
1022 aa  387  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.15 
 
 
823 aa  353  7e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.74 
 
 
687 aa  347  5e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.97 
 
 
977 aa  343  1e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.55 
 
 
858 aa  341  5e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.23 
 
 
791 aa  334  5e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.78 
 
 
975 aa  333  8e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2805  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.77 
 
 
927 aa  325  3e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.26 
 
 
974 aa  320  9e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  36.26 
 
 
998 aa  318  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  36.2 
 
 
970 aa  317  8e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.64 
 
 
1362 aa  305  2e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2159  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.62 
 
 
796 aa  306  2e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.758044 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.31 
 
 
1352 aa  303  9e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.24 
 
 
1271 aa  303  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2672  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.39 
 
 
991 aa  303  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.646953  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3764  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.1 
 
 
917 aa  301  4e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.432635  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  36.45 
 
 
1361 aa  300  1e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4784  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.45 
 
 
1141 aa  296  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.74 
 
 
456 aa  291  3e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.23 
 
 
1143 aa  291  5e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.385348 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4734  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.39 
 
 
798 aa  290  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660973 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2143  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.83 
 
 
755 aa  287  9e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.5 
 
 
1145 aa  283  1e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4217  PAS sensor protein  33.56 
 
 
792 aa  281  4e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.423052  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4696  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 
1917 aa  279  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257042  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1555  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.47 
 
 
1172 aa  279  2e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0698206 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4587  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.39 
 
 
803 aa  278  4e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0699795  normal  0.0670662 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3558  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
984 aa  276  1e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.299477 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.77 
 
 
763 aa  275  3e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.13 
 
 
1356 aa  273  1e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5109  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.57 
 
 
2099 aa  272  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0669819 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.76 
 
 
371 aa  271  5e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  32.33 
 
 
910 aa  271  5e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0587  ATP-binding region ATPase domain protein  34.03 
 
 
1161 aa  271  6e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.5 
 
 
1002 aa  270  9e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4240  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.35 
 
 
1064 aa  270  1e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.35 
 
 
1165 aa  268  3e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.985282 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4316  sensor histidine kinase  33.96 
 
 
1695 aa  268  4e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.946527 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5393  GAF sensor hybrid histidine kinase  34 
 
 
2099 aa  268  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480029  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2206  histidine kinase  34.22 
 
 
556 aa  264  5e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1135  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.11 
 
 
1142 aa  264  7e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0522922  normal  0.044499 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5171  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.57 
 
 
1857 aa  264  8e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472035  normal  0.0675906 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2002  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.69 
 
 
1155 aa  263  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00831305 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  34.44 
 
 
1137 aa  263  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3761  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1155 aa  262  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358181  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3719  sensor histidine kinase  34.84 
 
 
1278 aa  261  4e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2080  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein  33.58 
 
 
1158 aa  261  7e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.264996 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.26 
 
 
1326 aa  260  9e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1942  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.27 
 
 
1038 aa  260  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.44 
 
 
1137 aa  259  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4248  ATP-binding region ATPase domain protein  33.4 
 
 
1196 aa  258  3e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1648  histidine kinase  32.88 
 
 
1374 aa  258  3e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.102759  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2646  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.98 
 
 
1163 aa  258  4e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3210  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 
1936 aa  258  4e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596339  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0169  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.7 
 
 
1168 aa  257  9e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2142  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.21 
 
 
1149 aa  256  1e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694825  hitchhiker  0.00121197 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.59 
 
 
1195 aa  256  1e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.63 
 
 
1155 aa  256  1e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  30.85 
 
 
2035 aa  256  1e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6353  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.26 
 
 
1839 aa  257  1e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2587  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 
1158 aa  256  1e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2076  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.57 
 
 
2107 aa  255  3e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.09 
 
 
1267 aa  255  4e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.76 
 
 
1193 aa  254  5e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5566  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.46 
 
 
1203 aa  254  6e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0247633 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1671  histidine kinase  33.84 
 
 
1937 aa  254  7e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3786  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.12 
 
 
1155 aa  254  7e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1989  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.84 
 
 
1937 aa  253  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3493  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.25 
 
 
1782 aa  252  2e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0298684  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3831  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.9 
 
 
1177 aa  251  7e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195944  normal  0.0220401 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2712  sensor histidine kinase/response regulator  32.3 
 
 
1170 aa  250  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340753  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.6 
 
 
933 aa  250  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  3.59369e-05 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.18 
 
 
767 aa  249  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1737  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.3 
 
 
1037 aa  249  2e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476029  normal  0.227269 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2642  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.27 
 
 
1216 aa  248  4e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.974276  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3600  histidine kinase  33.07 
 
 
548 aa  248  5e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.94225  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2119  multisensor signal transduction histidine kinase  45.66 
 
 
582 aa  247  7e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0955  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.61 
 
 
765 aa  246  1e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2112  Cache sensor hybrid histidine kinase  34.25 
 
 
1361 aa  246  1e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0393  histidine kinase  32.37 
 
 
1200 aa  246  1e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.564913 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.88 
 
 
1274 aa  246  2e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2445  response regulator receiver  31.85 
 
 
1172 aa  246  2e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00053345 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1000  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.97 
 
 
1161 aa  246  2e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1136  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.24 
 
 
1896 aa  246  2e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270239  normal  0.51439 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.3 
 
 
827 aa  244  5e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5383  Signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 
784 aa  244  6e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.626951  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.85 
 
 
1287 aa  244  8e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6441  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.53 
 
 
1937 aa  243  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.59 
 
 
1284 aa  241  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1960  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.63 
 
 
1680 aa  241  5e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.0344276 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.36 
 
 
1363 aa  241  8e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  29.62 
 
 
1322 aa  239  1e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.59 
 
 
1340 aa  240  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.83 
 
 
568 aa  238  4e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  31.18 
 
 
1763 aa  238  4e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.5 
 
 
780 aa  238  5e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>