More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0889 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0889  HtpX-2 peptidase  100 
 
 
287 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1082  HtpX-2 peptidase  71.23 
 
 
285 aa  380  1e-104  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  57.69 
 
 
282 aa  325  4.0000000000000003e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3243  peptidase M48, Ste24p  60.07 
 
 
282 aa  311  1e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000873344  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  54.06 
 
 
285 aa  311  1e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0750  peptidase M48, Ste24p  55.75 
 
 
286 aa  309  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193162  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  53.98 
 
 
296 aa  304  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1567  M48 family peptidase  58.43 
 
 
286 aa  301  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.601696  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1819  peptidase M48 Ste24p  58.87 
 
 
283 aa  297  1e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0946  peptidase M48 Ste24p  52.61 
 
 
285 aa  297  1e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.401164 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3569  peptidase M48, Ste24p  56.6 
 
 
285 aa  295  6e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000538861  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0890  peptidase M48 Ste24p  55.52 
 
 
296 aa  292  4e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000209809  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2356  M48 family peptidase  54.14 
 
 
285 aa  291  9e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0145  M48 family peptidase  54.14 
 
 
285 aa  291  9e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0349  M48 family peptidase  54.14 
 
 
285 aa  291  9e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0163  M48 family peptidase  54.14 
 
 
285 aa  291  9e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2278  M48 family peptidase  54.14 
 
 
285 aa  291  9e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564612  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0154  M48 family peptidase  54.14 
 
 
285 aa  291  9e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438309  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2802  M48 family peptidase  54.14 
 
 
285 aa  291  9e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1156  HtpX-2 peptidase  58.52 
 
 
287 aa  290  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000134347  normal  0.0135663 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  54.41 
 
 
296 aa  290  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0131  M48 family peptidase  53.79 
 
 
285 aa  290  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3062  M48 family peptidase  53.79 
 
 
285 aa  288  6e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3179  M48 family peptidase  53.79 
 
 
285 aa  288  6e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3280  peptidase M48 Ste24p  58.95 
 
 
280 aa  288  8e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.458589  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3140  M48 family peptidase  53.45 
 
 
285 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911826  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2510  M48 family peptidase  53.45 
 
 
285 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3121  M48 family peptidase  53.45 
 
 
285 aa  287  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0038  M48 family peptidase  53.29 
 
 
285 aa  287  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3124  M48 family peptidase  53.45 
 
 
285 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840919  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0969  peptidase M48 Ste24p  58.6 
 
 
280 aa  286  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.697815 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3406  M48 family peptidase  54.17 
 
 
306 aa  286  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3096  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6475  M48 family peptidase  53.61 
 
 
285 aa  286  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3260  peptidase M48 Ste24p  51.58 
 
 
294 aa  286  4e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.741815 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0856  M48 family peptidase  58.09 
 
 
287 aa  285  5e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000166966  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4413  M48 family peptidase  52.94 
 
 
296 aa  285  5e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.631317 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3417  heat shock protein HtpX  52.45 
 
 
313 aa  285  5e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2282  peptidase M48 Ste24p  57.95 
 
 
284 aa  285  9e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000142182 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0244  M48 family peptidase  53.33 
 
 
280 aa  284  1.0000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0243  M48 family peptidase  53.33 
 
 
280 aa  284  1.0000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0285  M48 family peptidase  53.82 
 
 
283 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  0.0172766 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0312  M48 family peptidase  52.43 
 
 
285 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632212  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3918  heat shock protein HtpX  51.58 
 
 
320 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.03163  normal  0.594481 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4243  heat shock protein HtpX  51.93 
 
 
320 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0074  M48 family peptidase  53.66 
 
 
286 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123585  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0554  peptidase M48 Ste24p  58.91 
 
 
285 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000177743  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1935  peptidase M48 Ste24p  57.24 
 
 
284 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000118842  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0023  M48 family peptidase  52.96 
 
 
280 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3675  M48 family peptidase  53.29 
 
 
286 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1612  peptidase M48 Ste24p  57.68 
 
 
280 aa  282  3.0000000000000004e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.686402  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3352  M48 family peptidase  53.29 
 
 
286 aa  281  8.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3358  peptidase M48 Ste24p  54.9 
 
 
297 aa  281  9e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000541499  hitchhiker  0.000159799 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3563  peptidase M48 Ste24p  55.75 
 
 
285 aa  281  1e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  52.11 
 
 
279 aa  280  1e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0189  heat shock protein HtpX  51.25 
 
 
307 aa  280  2e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.160092  normal  0.264945 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0233  peptidase M48 Ste24p  55.94 
 
 
281 aa  275  5e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.471539 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1982  peptidase M48, Ste24p  51.93 
 
 
294 aa  275  7e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.333894  normal  0.247951 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0879  peptidase M48 Ste24p  54.77 
 
 
295 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0144  HtpX-2 peptidase  55.79 
 
 
281 aa  273  2.0000000000000002e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.824625 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0626  heat shock protein HtpX  51.58 
 
 
284 aa  272  5.000000000000001e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3563  M48 family peptidase  54.51 
 
 
286 aa  272  5.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1145  peptidase M48, Ste24p  56.67 
 
 
285 aa  271  6e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000113626  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3202  HtpX-2 peptidase  54.74 
 
 
318 aa  271  7e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1051  HtpX-2 peptidase  54.04 
 
 
283 aa  271  8.000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000114749  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1776  M48 family peptidase  50.69 
 
 
288 aa  271  1e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1327  peptidase M48 Ste24p  52.31 
 
 
287 aa  270  2e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.533301  hitchhiker  0.000000000342604 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4635  heat shock protein HtpX  50.36 
 
 
316 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0185  M48 family peptidase  50.88 
 
 
279 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166167 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0242  heat shock protein  58.04 
 
 
279 aa  267  1e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3192  heat shock protein HtpX  52.1 
 
 
319 aa  268  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.349199  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1274  peptidase M48, Ste24p  51.93 
 
 
279 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0034  heat shock protein HtpX  52.3 
 
 
317 aa  265  5e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1232  heat shock protein HtpX  50.18 
 
 
299 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1813  heat shock protein HtpX  51.23 
 
 
325 aa  264  1e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1746  heat shock protein HtpX  51.23 
 
 
325 aa  264  1e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0093  M48 family peptidase  51.41 
 
 
279 aa  264  1e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.500994  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1090  heat shock protein HtpX  51.23 
 
 
321 aa  264  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119741  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0774  heat shock protein HtpX  51.07 
 
 
315 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0071  heat shock protein HtpX  48.4 
 
 
343 aa  263  3e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000193104  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1239  heat shock protein HtpX  51.39 
 
 
285 aa  261  8e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4296  protease heat shock protein  50.35 
 
 
342 aa  261  8e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0511  heat shock protein HtpX  49.82 
 
 
285 aa  261  1e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1397  heat shock protein HtpX  49.47 
 
 
285 aa  260  2e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.809815  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0554  heat shock protein HtpX  49.47 
 
 
300 aa  260  2e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2206  heat shock protein HtpX  49.47 
 
 
300 aa  260  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.116706  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3579  heat shock protein HtpX  48.94 
 
 
293 aa  259  3e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.421936  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6075  heat shock protein HtpX  47.86 
 
 
290 aa  256  3e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0406  peptidase M48, Ste24p  50.18 
 
 
306 aa  255  5e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0474  peptidase M48 Ste24p  50.18 
 
 
289 aa  254  8e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0557  heat shock protein HtpX  47.54 
 
 
290 aa  254  9e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2054  peptidase M48 Ste24p  54.47 
 
 
286 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2923  heat shock protein HtpX  49.13 
 
 
298 aa  254  2.0000000000000002e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0855  heat shock protein HtpX  50.76 
 
 
324 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2772  peptidase M48 Ste24p  50.87 
 
 
309 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10573  heat shock protein HtpX  49.65 
 
 
286 aa  250  2e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0237  heat shock protein HtpX  50.53 
 
 
307 aa  250  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2930  peptidase M48 Ste24p  49.45 
 
 
307 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3512  heat shock protein HtpX  52.08 
 
 
309 aa  249  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.465022  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1791  peptidase M48 Ste24p  49.65 
 
 
308 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.851942 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1082  peptidase M48 Ste24p  51.41 
 
 
287 aa  248  1e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>