38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0869 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0869  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  321  3e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2206  PUA domain-containing protein  59.09 
 
 
156 aa  200  7e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.141986  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1829  PUA domain-containing protein  53.42 
 
 
184 aa  157  4e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0694  PUA domain-containing protein  52.45 
 
 
155 aa  155  2e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0631367  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1348  hypothetical protein  52.74 
 
 
164 aa  152  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.39888  hitchhiker  0.0000845991 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2533  PUA domain containing protein  48.34 
 
 
159 aa  149  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2275  hypothetical protein  46.94 
 
 
152 aa  134  4e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1685  PUA domain-containing protein  50 
 
 
166 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.566422  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0570  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  37.66 
 
 
606 aa  110  8.000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0224275  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0798  PUA domain containing protein  37.97 
 
 
164 aa  107  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0663  PUA domain containing protein  38.46 
 
 
176 aa  99.4  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.830809  normal  0.0773964 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2274  PUA domain-containing protein  38.89 
 
 
172 aa  94.7  4e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.112054  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0878  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  36.24 
 
 
652 aa  89.4  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1482  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  34.69 
 
 
649 aa  88.2  5e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2748  PUA domain containing protein  33.52 
 
 
189 aa  86.3  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.590159  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0226  PUA domain containing protein  36.67 
 
 
153 aa  84.7  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.102678  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1632  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  34.93 
 
 
649 aa  84.3  6e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3182  PUA domain containing protein  35.86 
 
 
161 aa  82.4  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.636517  normal  0.0526175 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0282  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  33.56 
 
 
649 aa  82  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0996  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  31.51 
 
 
649 aa  74.7  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1603  PUA domain-containing protein  33.33 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0035  PUA domain-containing protein  32.61 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00396797 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1077  PUA domain-containing protein  30.43 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0706  PUA domain-containing protein  31.79 
 
 
161 aa  63.9  0.0000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.924109  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2144  PUA domain-containing protein  27.97 
 
 
148 aa  63.2  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0038  PUA domain-containing protein  30.77 
 
 
163 aa  60.8  0.000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1772  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  28.97 
 
 
615 aa  57.4  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0956  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  31.58 
 
 
626 aa  53.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1661  PUA domain-containing protein  32.65 
 
 
566 aa  51.2  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1534  PUA domain-containing protein  24.11 
 
 
157 aa  50.8  0.000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.305531  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2177  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  30.99 
 
 
582 aa  50.8  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.881691  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0714  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  30.99 
 
 
585 aa  48.1  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  24.68 
 
 
634 aa  47.8  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0607  PUA domain-containing protein  40 
 
 
60 aa  46.6  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.398767  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2157  PUA domain containing protein  26.62 
 
 
600 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.516872 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2683  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  30.28 
 
 
608 aa  43.9  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0105473  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3058  putative RNA-binding protein  34.83 
 
 
165 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1314  PUA domain-containing protein  29.37 
 
 
546 aa  41.2  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.188899 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>