More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0815 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  100 
 
 
918 aa  1887    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  48.23 
 
 
754 aa  503  1e-141  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  50.87 
 
 
1182 aa  476  1e-132  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  46.26 
 
 
704 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  53.81 
 
 
657 aa  414  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  39.49 
 
 
1289 aa  303  1e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  45.91 
 
 
945 aa  301  4e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  38.48 
 
 
886 aa  300  8e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  45.37 
 
 
1248 aa  297  7e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0816  hypothetical protein  75.81 
 
 
230 aa  291  4e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  42.89 
 
 
676 aa  288  5e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  60.08 
 
 
800 aa  277  8e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  52.65 
 
 
819 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7977  signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 
1039 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  55.56 
 
 
1047 aa  258  3e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  36.9 
 
 
1210 aa  258  4e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2956  multi-sensor signal transduction histidine kinase  64.8 
 
 
780 aa  254  5.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.900663 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  53.7 
 
 
936 aa  251  5e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  36.3 
 
 
746 aa  251  5e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 
547 aa  248  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  43.56 
 
 
449 aa  244  6e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  33.14 
 
 
892 aa  237  8e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 
1676 aa  236  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  39.38 
 
 
834 aa  233  1e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  44.12 
 
 
682 aa  230  8e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3250  sensory transduction histidine kinase  43.92 
 
 
1019 aa  222  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.145129 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  31.4 
 
 
783 aa  215  3.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  37.54 
 
 
492 aa  210  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 
1093 aa  209  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 
1093 aa  207  6e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  31.4 
 
 
744 aa  206  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 
551 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  46.15 
 
 
991 aa  197  8.000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 
1051 aa  196  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  40.81 
 
 
727 aa  195  3e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  44.35 
 
 
964 aa  191  7e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 
932 aa  190  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 
681 aa  189  3e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 
572 aa  189  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 
488 aa  187  7e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 
771 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  31 
 
 
3706 aa  184  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 
788 aa  182  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2895  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.84 
 
 
705 aa  181  5.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 
613 aa  180  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 
526 aa  179  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  47.29 
 
 
1714 aa  179  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  38.11 
 
 
1239 aa  179  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  38.44 
 
 
462 aa  178  5e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  39.01 
 
 
980 aa  177  9e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 
945 aa  174  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 
1253 aa  174  6.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 
1654 aa  172  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.69 
 
 
1124 aa  171  8e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  37.79 
 
 
1668 aa  170  9e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  41.04 
 
 
767 aa  167  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  37.33 
 
 
1663 aa  167  8e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 
815 aa  167  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  40.24 
 
 
839 aa  165  5.0000000000000005e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  40.89 
 
 
347 aa  164  8.000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 
1177 aa  162  4e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  26.5 
 
 
913 aa  161  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 
1390 aa  161  6e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 
912 aa  160  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 
1560 aa  159  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  39.04 
 
 
732 aa  159  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  39.3 
 
 
723 aa  159  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0767  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  28.86 
 
 
1278 aa  159  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.74653 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 
215 aa  155  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 
764 aa  154  5e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 
1246 aa  155  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
674 aa  154  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 
631 aa  153  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 
1051 aa  150  8e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 
941 aa  150  9e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 
878 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  25.61 
 
 
907 aa  148  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.91 
 
 
759 aa  148  6e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77937  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 
1183 aa  147  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 
382 aa  147  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 
472 aa  145  3e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
439 aa  145  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 
813 aa  144  7e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 
1227 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  27.19 
 
 
1202 aa  142  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1756  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.11 
 
 
844 aa  141  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 
856 aa  141  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  35 
 
 
771 aa  141  7e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3428  signal transduction histidine kinase  41.79 
 
 
693 aa  141  7e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435354  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 
746 aa  140  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 
532 aa  140  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 
585 aa  140  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1685  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.11 
 
 
844 aa  140  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.99 
 
 
1516 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  41.09 
 
 
1093 aa  138  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 
790 aa  138  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11268  histidine kinase sensor protein  37.76 
 
 
624 aa  136  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 
735 aa  137  9.999999999999999e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.175362  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 
909 aa  135  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
872 aa  135  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>