More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0809 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  100 
 
 		 735 aa  1462    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  72.85 
 
 		 1094 aa  585  1e-166  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  65.09 
 
 		 752 aa  514  1e-144  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  76.47 
 
 		 675 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  71.92 
 
 		 679 aa  480  1e-134  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  74.26 
 
 		 713 aa  474  1e-132  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  74.64 
 
 		 658 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  71.64 
 
 		 669 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  60 
 
 		 561 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  71.6 
 
 		 859 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  57.73 
 
 		 1682 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  68.77 
 
 		 685 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  49.73 
 
 		 547 aa  451  1e-125  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  57.34 
 
 		 2272 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  54.12 
 
 		 1667 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  54.84 
 
 		 1842 aa  444  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  54.94 
 
 		 1882 aa  439  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  54.5 
 
 		 2036 aa  432  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  40.06 
 
 		 838 aa  426  1e-118  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  52.91 
 
 		 528 aa  419  9.999999999999999e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  50.4 
 
 		 2122 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  85.48 
 
 		 581 aa  415  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  49.36 
 
 		 1282 aa  413  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  53.46 
 
 		 978 aa  414  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  53.69 
 
 		 575 aa  414  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  51.24 
 
 		 1356 aa  410  1e-113  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  51.29 
 
 		 1361 aa  405  1e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  53.99 
 
 		 1300 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  52.75 
 
 		 2000 aa  402  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  51.98 
 
 		 963 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  59.44 
 
 		 1969 aa  386  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  46.17 
 
 		 1862 aa  389  1e-106  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  57.42 
 
 		 1120 aa  372  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  47.32 
 
 		 530 aa  370  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  58.72 
 
 		 1241 aa  368  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  48.62 
 
 		 2554 aa  369  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  43.66 
 
 		 941 aa  361  3e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  73.17 
 
 		 791 aa  359  9.999999999999999e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  74 
 
 		 551 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  47.72 
 
 		 930 aa  337  5.999999999999999e-91  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2569  surface layer protein B  52.29 
 
 		 505 aa  336  7.999999999999999e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  0.0285129 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  40.78 
 
 		 1732 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  42.22 
 
 		 958 aa  326  1e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  66.8 
 
 		 615 aa  318  3e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  45.33 
 
 		 471 aa  314  3.9999999999999997e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  44.56 
 
 		 1667 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  43.02 
 
 		 1236 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  42.34 
 
 		 1528 aa  294  3e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  40.96 
 
 		 777 aa  291  3e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  47.94 
 
 		 460 aa  283  7.000000000000001e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  43.15 
 
 		 1387 aa  280  5e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  49.38 
 
 		 910 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  38.49 
 
 		 1783 aa  271  2e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  53.64 
 
 		 3295 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  43.75 
 
 		 971 aa  253  1e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  43.88 
 
 		 869 aa  251  3e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  45.83 
 
 		 861 aa  249  2e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  43.25 
 
 		 940 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  41.02 
 
 		 1931 aa  239  1e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  38.24 
 
 		 1292 aa  238  4e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  72.84 
 
 		 560 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  39.77 
 
 		 823 aa  229  1e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  72.39 
 
 		 184 aa  229  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  68.29 
 
 		 644 aa  226  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  36.64 
 
 		 1011 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  40.62 
 
 		 840 aa  220  6e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  41.08 
 
 		 719 aa  219  1e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  41.71 
 
 		 443 aa  218  2.9999999999999998e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  39.55 
 
 		 802 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  34.59 
 
 		 952 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  35.54 
 
 		 2176 aa  218  4e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  39.33 
 
 		 870 aa  213  7.999999999999999e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  35.9 
 
 		 1814 aa  211  4e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  46.95 
 
 		 930 aa  208  3e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  43.8 
 
 		 786 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  36.9 
 
 		 845 aa  196  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  34.2 
 
 		 865 aa  195  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  34.35 
 
 		 1531 aa  192  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  43.75 
 
 		 819 aa  192  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  43.27 
 
 		 2552 aa  188  3e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  47.26 
 
 		 1095 aa  185  3e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  56.29 
 
 		 519 aa  182  2.9999999999999997e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  37.5 
 
 		 929 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  43.31 
 
 		 1189 aa  180  7e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  35.41 
 
 		 1987 aa  178  4e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  35.17 
 
 		 1620 aa  176  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  39.56 
 
 		 938 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  35.34 
 
 		 439 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  31.08 
 
 		 1606 aa  174  3.9999999999999995e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  37.09 
 
 		 635 aa  171  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  34.95 
 
 		 1380 aa  167  5e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  37.59 
 
 		 960 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  33.79 
 
 		 1092 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  36.84 
 
 		 1001 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  36.96 
 
 		 1231 aa  165  3e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  33.1 
 
 		 821 aa  163  1e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  45.79 
 
 		 816 aa  160  6e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  40.36 
 
 		 810 aa  159  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  44.57 
 
 		 500 aa  159  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  33.64 
 
 		 1602 aa  158  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>