More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0790 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  100 
 
 		 371 aa  747    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  28.68 
 
 		 397 aa  151  2e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  29.37 
 
 		 397 aa  144  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  30.86 
 
 		 413 aa  137  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  29.29 
 
 		 397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  29.52 
 
 		 397 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  25.38 
 
 		 397 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  25.06 
 
 		 397 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  25.58 
 
 		 397 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  30.02 
 
 		 404 aa  124  4e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  30.28 
 
 		 381 aa  122  7e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  31.54 
 
 		 414 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1784  hypothetical protein  27.46 
 
 		 397 aa  120  3e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.288295  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  29.85 
 
 		 391 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  24.43 
 
 		 397 aa  119  7e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  29.12 
 
 		 405 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  27.25 
 
 		 414 aa  117  3e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  26.88 
 
 		 414 aa  117  3e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2974  hypothetical protein  33.1 
 
 		 411 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0037  export ABC transporter permease protein  28.54 
 
 		 397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  25.63 
 
 		 387 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  29.9 
 
 		 403 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  29.3 
 
 		 409 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2148  hypothetical protein  27.65 
 
 		 408 aa  114  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327906 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  26.76 
 
 		 415 aa  114  3e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  27.36 
 
 		 414 aa  113  6e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  33.11 
 
 		 405 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  24.4 
 
 		 387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0699  hypothetical protein  26.62 
 
 		 404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0151116  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  28.01 
 
 		 406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  28.81 
 
 		 409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  27.9 
 
 		 404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  27.9 
 
 		 404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1894  protein of unknown function DUF214  27.32 
 
 		 385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  28.79 
 
 		 390 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.88 
 
 		 413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  28.81 
 
 		 409 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  28.75 
 
 		 401 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  30.13 
 
 		 643 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  28.22 
 
 		 397 aa  110  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  25.77 
 
 		 386 aa  110  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0679  hypothetical protein  26.03 
 
 		 397 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1519  protein of unknown function DUF214  27.46 
 
 		 379 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  28.47 
 
 		 407 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  27.61 
 
 		 658 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1336  hypothetical protein  26.75 
 
 		 395 aa  108  1e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4105  protein of unknown function DUF214  26.37 
 
 		 403 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0276302 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  26.65 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  26.11 
 
 		 420 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0119  hypothetical protein  25.39 
 
 		 397 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.395515 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  26.11 
 
 		 420 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2195  hypothetical protein  24.69 
 
 		 389 aa  107  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0742  protein of unknown function DUF214  29.01 
 
 		 387 aa  106  5e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0302807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  30.47 
 
 		 406 aa  106  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  29.63 
 
 		 409 aa  106  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  25.32 
 
 		 386 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  30.8 
 
 		 405 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  31.5 
 
 		 400 aa  105  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  27.09 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  29.95 
 
 		 405 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  29.58 
 
 		 405 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  28.54 
 
 		 408 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  27.7 
 
 		 404 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1669  hypothetical protein  27.32 
 
 		 420 aa  104  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  29.61 
 
 		 392 aa  104  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  26.05 
 
 		 401 aa  104  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  28.43 
 
 		 402 aa  104  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  26.23 
 
 		 411 aa  103  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003048  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  25.51 
 
 		 400 aa  103  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4297  hypothetical protein  26.59 
 
 		 420 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  29.31 
 
 		 411 aa  103  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  28.5 
 
 		 406 aa  103  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  24.7 
 
 		 399 aa  102  9e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  25.76 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2626  protein of unknown function DUF214  25.7 
 
 		 467 aa  102  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01130  putative ABC transporter  26.44 
 
 		 414 aa  102  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.95272  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  25.86 
 
 		 420 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  24.63 
 
 		 400 aa  101  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2041  ABC transporter, ATPase subunit  27.6 
 
 		 645 aa  101  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.568421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  27.98 
 
 		 412 aa  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  29.24 
 
 		 394 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  28.29 
 
 		 400 aa  101  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1506  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.63 
 
 		 412 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.746473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  36.69 
 
 		 443 aa  101  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  26.42 
 
 		 400 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  32.9 
 
 		 409 aa  101  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  28.43 
 
 		 413 aa  100  3e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  28.3 
 
 		 653 aa  100  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  27.41 
 
 		 412 aa  100  5e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  27.45 
 
 		 409 aa  100  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0519  hypothetical protein  22.77 
 
 		 367 aa  99.8  6e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00443458  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  25.5 
 
 		 386 aa  100  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4095  hypothetical protein  27.18 
 
 		 406 aa  99.8  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.591324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1640  hypothetical protein  26.48 
 
 		 408 aa  99.4  8e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  27.39 
 
 		 402 aa  99.4  8e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0086  hypothetical protein  27.34 
 
 		 438 aa  99.4  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3479  protein of unknown function DUF214  26.83 
 
 		 399 aa  99.4  9e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1676  hypothetical protein  27.74 
 
 		 412 aa  99  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.503245  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2216  hypothetical protein  26.07 
 
 		 388 aa  99  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0998  protein of unknown function DUF214  31.4 
 
 		 410 aa  99  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122855 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>