More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0740 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0740  methanol corrinoid protein  100 
 
 		 258 aa  519  1e-146  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1063  methanol corrinoid protein  80.23 
 
 		 258 aa  430  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3637  methanol corrinoid protein  80.16 
 
 		 255 aa  410  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0813  methanol corrinoid protein  74.3 
 
 		 256 aa  382  1e-105  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0811  methanol corrinoid protein  62.25 
 
 		 254 aa  325  4.0000000000000003e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3584  methylthiol:coenzyme M methyltransferase  41.89 
 
 		 275 aa  168  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.812541  normal  0.0358178 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0729  homocysteine S-methyltransferase  35.38 
 
 		 781 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  34.34 
 
 		 800 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0680  homocysteine S-methyltransferase  39.77 
 
 		 768 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.412837  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1368  trimethylamine corrinoid protein  36.23 
 
 		 216 aa  128  8.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000000818926  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  38.64 
 
 		 768 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1365  dimethylamine corrinoid protein  38.24 
 
 		 251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000308359  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1503  dimethylamine corrinoid protein  36.76 
 
 		 217 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.153126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0024  methyltransferase cognate corrinoid protein  34.26 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  33.85 
 
 		 804 aa  124  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  34.8 
 
 		 839 aa  124  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  36.27 
 
 		 813 aa  123  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4325  methyltransferase cognate corrinoid protein  36.32 
 
 		 214 aa  122  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1208  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  33.82 
 
 		 210 aa  122  7e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  36.27 
 
 		 811 aa  121  9e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  32.06 
 
 		 804 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2310  trimethylamine corrinoid protein  38.95 
 
 		 216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00299987  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3604  dimethylamine corrinoid protein  35 
 
 		 214 aa  120  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.220504 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2122  putative dimethylamine corrinoid protein  34.91 
 
 		 232 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.154357  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0797  methionine synthase  34.91 
 
 		 232 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.310628  normal  0.286279 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1729  Methionine synthase  35.15 
 
 		 210 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1732  Methionine synthase  35.15 
 
 		 210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0859  homocysteine S-methyltransferase  33.82 
 
 		 804 aa  119  7e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000329444  normal  0.146867 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1947  methionine synthase  34.3 
 
 		 1223 aa  118  7.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0537124  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0729  Methionine synthase  35.61 
 
 		 212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.342972  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0707  methionine synthase  34.91 
 
 		 232 aa  116  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.784551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1073  methionine synthase  34.12 
 
 		 259 aa  117  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.234469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  32.12 
 
 		 804 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2116  corrinoid methyltransferase  34 
 
 		 209 aa  115  8.999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00601394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2941  homocysteine S-methyltransferase  35 
 
 		 801 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2641  cobalamin B12-binding domain protein  33.68 
 
 		 210 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0840  cobalamin B12-binding domain-containing protein  35.55 
 
 		 219 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0840  monomethylamine corrinoid protein  37.31 
 
 		 217 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.960899  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  32.64 
 
 		 807 aa  113  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4872  cobalamin B12-binding domain protein  35.75 
 
 		 210 aa  113  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2958  cobalamin B12-binding domain-containing protein  36.23 
 
 		 216 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.885246  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0847  monomethylamine corrinoid protein  37.31 
 
 		 217 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1470  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  31.9 
 
 		 232 aa  112  7.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1827  cobalamin B12-binding domain-containing protein  34.12 
 
 		 219 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1776  methionine synthase  33.82 
 
 		 232 aa  112  9e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.354351  normal  0.011957 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1501  dimethylamine corrinoid protein  34.43 
 
 		 208 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000126339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  33.66 
 
 		 801 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23490  methionine synthase (B12-dependent)  35.64 
 
 		 820 aa  111  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.136684  hitchhiker  0.0000158862 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  31.37 
 
 		 774 aa  111  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1468  methionine synthase  32.38 
 
 		 218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.543896  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0075  cobalamin B12-binding domain-containing protein  33.65 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.916725  normal  0.540278 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  31.66 
 
 		 806 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2288  dimethylamine corrinoid protein  39.22 
 
 		 168 aa  110  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.974802  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1442  homocysteine S-methyltransferase  31.82 
 
 		 802 aa  109  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.195548  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1858  homocysteine S-methyltransferase  34.76 
 
 		 803 aa  107  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  30.23 
 
 		 1136 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2612  methionine synthase  31.42 
 
 		 894 aa  107  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.268969 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0772  homocysteine S-methyltransferase  31.9 
 
 		 780 aa  107  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0538889  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0682  homocysteine S-methyltransferase  30.05 
 
 		 793 aa  107  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2550  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  33.02 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29240  B12-dependent methionine synthase  31.8 
 
 		 1278 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0845  monomethylamine corrinoid protein  36.84 
 
 		 217 aa  106  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2115  methionine synthase (B12-dependent)  32.18 
 
 		 841 aa  106  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.356238  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  31.46 
 
 		 804 aa  106  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25850  predicted cobalamin binding protein  32.24 
 
 		 217 aa  105  6e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  34.07 
 
 		 1136 aa  105  7e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3053  B12-dependent methionine synthase  33.79 
 
 		 1251 aa  105  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.453999 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2144  methionine synthase  35.32 
 
 		 1243 aa  105  8e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.212238  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  30.14 
 
 		 1132 aa  105  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4385  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  30.14 
 
 		 1132 aa  105  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4366  methionine synthase  29.68 
 
 		 1132 aa  105  9e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03891  B12-dependent methionine synthase  36.81 
 
 		 1227 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3978  methionine synthase  36.81 
 
 		 1227 aa  104  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4563  B12-dependent methionine synthase  36.81 
 
 		 1227 aa  104  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1661  methionine synthase  33.66 
 
 		 1176 aa  104  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158089  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0842  monomethylamine corrinoid protein  37.87 
 
 		 217 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4472  B12-dependent methionine synthase  36.56 
 
 		 1227 aa  104  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.346478 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4108  methionine synthase  29.68 
 
 		 1132 aa  104  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4255  B12-dependent methionine synthase  36.81 
 
 		 1227 aa  104  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0705471  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4011  B12-dependent methionine synthase  36.81 
 
 		 1227 aa  104  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.960796  normal  0.0169283 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5489  B12-dependent methionine synthase  36.81 
 
 		 1227 aa  104  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03851  hypothetical protein  36.81 
 
 		 1227 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1138  methionine synthase  34.81 
 
 		 1215 aa  104  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.537288  normal  0.145457 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1548  homocysteine S-methyltransferase  30.88 
 
 		 804 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0662443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3081  homocysteine S-methyltransferase  34.62 
 
 		 791 aa  104  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2375  B12-dependent methionine synthase  34.94 
 
 		 1235 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4156  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  29.68 
 
 		 1132 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  29.68 
 
 		 1133 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  29.68 
 
 		 1133 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4274  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  29.68 
 
 		 1132 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  29.68 
 
 		 1132 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1212  methionine synthase  35.59 
 
 		 224 aa  103  3e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.807396  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1982  B12-dependent methionine synthase  34.29 
 
 		 1235 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0368395  normal  0.238169 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4337  cobalamin B12-binding domain-containing protein  31.09 
 
 		 326 aa  102  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.125438  normal  0.389787 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1888  B12-dependent methionine synthase  33.88 
 
 		 1235 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2159  B12-dependent methionine synthase  33.16 
 
 		 1236 aa  103  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.088857 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4401  B12-dependent methionine synthase  35.87 
 
 		 1227 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.90979  normal  0.334358 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4526  B12-dependent methionine synthase  35.87 
 
 		 1227 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.267598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4523  B12-dependent methionine synthase  35.87 
 
 		 1227 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.413038 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4599  B12-dependent methionine synthase  35.87 
 
 		 1227 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.972582  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>