More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0710 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  100 
 
 
381 aa  720    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  46.94 
 
 
286 aa  222  8e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  38.94 
 
 
449 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  37.74 
 
 
448 aa  187  3e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  40.69 
 
 
332 aa  186  7e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  41.67 
 
 
333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  47.73 
 
 
225 aa  182  7e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  38.37 
 
 
319 aa  182  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  42.41 
 
 
309 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  40.2 
 
 
336 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  40.2 
 
 
336 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  41.06 
 
 
311 aa  179  9e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  40.14 
 
 
521 aa  171  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  39.86 
 
 
340 aa  169  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  40.45 
 
 
320 aa  169  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  37.24 
 
 
576 aa  169  9e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  30.5 
 
 
862 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  35.03 
 
 
440 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  39.08 
 
 
351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  32.3 
 
 
389 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  38.46 
 
 
401 aa  162  9e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  47.86 
 
 
234 aa  162  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  37.57 
 
 
401 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  41.11 
 
 
517 aa  160  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  37.13 
 
 
343 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  37.13 
 
 
343 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 
446 aa  158  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  36.39 
 
 
483 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  43.12 
 
 
489 aa  151  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  35.79 
 
 
401 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  32.75 
 
 
493 aa  150  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  35.79 
 
 
401 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  42.86 
 
 
264 aa  149  1.0000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  42.42 
 
 
493 aa  149  1.0000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  38.54 
 
 
567 aa  147  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  30.95 
 
 
1191 aa  147  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  40.4 
 
 
262 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  39.85 
 
 
268 aa  146  6e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  40.24 
 
 
262 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  39.22 
 
 
386 aa  145  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  40.78 
 
 
295 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  39.06 
 
 
294 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  31.63 
 
 
872 aa  139  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  32.95 
 
 
450 aa  138  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  37.33 
 
 
309 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  36.79 
 
 
515 aa  137  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  36.9 
 
 
285 aa  136  5e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0862  pentapeptide repeat-containing protein  31.71 
 
 
872 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0163712  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  32.34 
 
 
844 aa  136  7.000000000000001e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1083  pentapeptide repeat-containing protein  22.85 
 
 
607 aa  136  8e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.581758  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0542  hypothetical protein  31.97 
 
 
880 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1681  pentapeptide repeat-containing protein  31.97 
 
 
880 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0723  pentapeptide repeat-containing protein  31.97 
 
 
880 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0612  pentapeptide repeat-containing protein  31.97 
 
 
880 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.65281  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  37.22 
 
 
267 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2131  pentapeptide repeat-containing protein  31.66 
 
 
880 aa  133  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2033  pentapeptide repeat-containing protein  31.66 
 
 
877 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  30.7 
 
 
447 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  43.66 
 
 
216 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  37.8 
 
 
776 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  32.13 
 
 
363 aa  130  5.0000000000000004e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  33.71 
 
 
408 aa  129  7.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0870  pentapeptide repeat-containing protein  23.97 
 
 
635 aa  129  8.000000000000001e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  42.57 
 
 
214 aa  129  9.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  38.11 
 
 
291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3090  hypothetical protein  42.58 
 
 
362 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0391882  normal  0.0374194 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  38.27 
 
 
291 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  30.87 
 
 
846 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  35 
 
 
870 aa  128  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  29.39 
 
 
348 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1211  pentapeptide repeat-containing protein  30.69 
 
 
419 aa  125  8.000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.645913 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  35.74 
 
 
734 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  30.41 
 
 
412 aa  125  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  45.3 
 
 
213 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  27.83 
 
 
349 aa  124  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  31.04 
 
 
447 aa  124  3e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1585  pentapeptide repeat-containing protein  39.73 
 
 
237 aa  124  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000106738  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  41.71 
 
 
745 aa  124  4e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2867  pentapeptide repeat protein  31.8 
 
 
881 aa  123  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113451  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  35.9 
 
 
441 aa  124  4e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  31.97 
 
 
420 aa  123  7e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3764  pentapeptide repeat protein  41.44 
 
 
218 aa  122  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  44.15 
 
 
168 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  40.61 
 
 
266 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  28.75 
 
 
949 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  40.43 
 
 
189 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  40.5 
 
 
225 aa  119  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  32.41 
 
 
412 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  29.39 
 
 
825 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  29.39 
 
 
825 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  29.39 
 
 
825 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  29.39 
 
 
825 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  35.21 
 
 
300 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  35.08 
 
 
710 aa  117  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  40.85 
 
 
278 aa  117  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  40.49 
 
 
227 aa  116  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3757  pentapeptide repeat protein  38.68 
 
 
233 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  28.57 
 
 
825 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  26.97 
 
 
866 aa  116  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3704  pentapeptide repeat protein  38.68 
 
 
233 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>