247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0652 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0652  hypothetical protein  100 
 
 
591 aa  1216    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0660  hypothetical protein  84.59 
 
 
568 aa  934    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.61826 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3374  hypothetical protein  70.31 
 
 
476 aa  706    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0508877  normal  0.0110235 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1748  peptidase M28  30.73 
 
 
430 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2164  peptidase M28  31.41 
 
 
512 aa  159  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.502107  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  27.27 
 
 
1103 aa  93.2  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  29.84 
 
 
598 aa  80.9  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  27.45 
 
 
342 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  28.23 
 
 
301 aa  77.8  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  24.74 
 
 
574 aa  76.3  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  26.39 
 
 
318 aa  75.5  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10643  Probable aminopeptidase fused to fibronectin type 3 domain  25.36 
 
 
450 aa  74.7  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  25.42 
 
 
674 aa  74.7  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  26.87 
 
 
309 aa  73.6  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  25.72 
 
 
323 aa  72.8  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0054  peptidase M28  24.92 
 
 
335 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1949  peptidase M28  24.65 
 
 
439 aa  70.1  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4664  peptidase M28  27.07 
 
 
526 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062927  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  28.37 
 
 
539 aa  68.9  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  27.34 
 
 
394 aa  69.3  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1065  peptidase M28  26.57 
 
 
455 aa  69.3  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.377443  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0754  peptidase M28  23.64 
 
 
339 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.050482 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0815  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  27.48 
 
 
357 aa  68.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1044  peptidase M28  27.83 
 
 
306 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0202745 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  26.56 
 
 
346 aa  67  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0052  peptidase M28  25.08 
 
 
308 aa  66.6  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000295021 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3155  peptidase M28  38.24 
 
 
436 aa  66.6  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000680764  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  23.66 
 
 
325 aa  65.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3219  peptidase M28  27.83 
 
 
306 aa  65.5  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.115329  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  30.56 
 
 
391 aa  65.1  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2112  peptidase M28  25.1 
 
 
1247 aa  65.5  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0150866  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0003  peptidase M28  29.52 
 
 
319 aa  65.1  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  25.77 
 
 
315 aa  64.7  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  27 
 
 
407 aa  64.7  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1751  peptidase M28  49.3 
 
 
514 aa  64.3  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.691853  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1679  peptidase M28  24.58 
 
 
459 aa  64.3  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3859  peptidase M28  25.75 
 
 
478 aa  64.3  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1646  peptidase M28  29.72 
 
 
456 aa  63.9  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0104319  normal  0.645217 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2289  peptidase M28  27.19 
 
 
338 aa  63.9  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  29 
 
 
491 aa  63.2  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4005  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  28.04 
 
 
345 aa  63.5  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  23.32 
 
 
319 aa  63.2  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3054  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  27.08 
 
 
345 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.957011  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  31.06 
 
 
466 aa  62.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  27.92 
 
 
550 aa  62.4  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  31.06 
 
 
466 aa  62.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  27.13 
 
 
533 aa  62.4  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  26.91 
 
 
532 aa  61.6  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0935  peptidase M28  26.56 
 
 
345 aa  61.6  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  26.94 
 
 
506 aa  61.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  29.52 
 
 
555 aa  61.6  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.284248 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02603  aminopeptidase in alkaline phosphatase isozyme conversion  26.56 
 
 
345 aa  61.2  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  23.81 
 
 
333 aa  61.2  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3121  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  26.56 
 
 
345 aa  61.2  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2891  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  26.56 
 
 
345 aa  61.2  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02568  hypothetical protein  26.56 
 
 
345 aa  61.2  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0959  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  26.56 
 
 
345 aa  61.2  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.73903 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0578  peptidase M28  26.7 
 
 
373 aa  60.8  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.43286  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  24.73 
 
 
497 aa  60.8  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2879  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  26.56 
 
 
345 aa  60.5  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  27 
 
 
575 aa  60.5  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  29.95 
 
 
539 aa  60.5  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1976  peptidase M28  22.46 
 
 
347 aa  60.1  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.242432  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6133  peptidase M28  23.99 
 
 
461 aa  59.7  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  31.34 
 
 
540 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2907  peptidase M28  28.87 
 
 
463 aa  59.3  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  31.34 
 
 
532 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3998  peptidase M28  27.92 
 
 
440 aa  59.7  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  25.13 
 
 
501 aa  59.3  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  31.34 
 
 
540 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  31.34 
 
 
540 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  46.27 
 
 
466 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2729  hypothetical protein  27.56 
 
 
401 aa  58.9  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2848  peptidase M28  30.2 
 
 
526 aa  58.9  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549527  normal  0.194902 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03479  probable aminopeptidase fused to fibronectin type 3 domain  24.74 
 
 
468 aa  58.5  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1875  peptidase M28  29.77 
 
 
509 aa  58.5  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.967408  normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  46.27 
 
 
466 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3756  peptidase M28  26.67 
 
 
386 aa  58.9  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  46.27 
 
 
466 aa  58.9  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  46.27 
 
 
466 aa  58.5  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  46.27 
 
 
466 aa  58.5  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  27.27 
 
 
503 aa  58.2  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3608  peptidase M28  32.82 
 
 
472 aa  58.5  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  27.02 
 
 
541 aa  58.2  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  27.02 
 
 
541 aa  58.2  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  46.27 
 
 
466 aa  58.5  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0637  peptidase M28  26.11 
 
 
352 aa  58.2  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.40358  normal  0.0226987 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  44.78 
 
 
465 aa  58.2  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2702  M28 family peptidase  23.7 
 
 
325 aa  58.2  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3087  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  27.08 
 
 
348 aa  58.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3126  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  27.08 
 
 
348 aa  58.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.886457  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  30.41 
 
 
550 aa  57.8  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3142  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  27.08 
 
 
348 aa  58.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.634375 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3246  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  27.08 
 
 
348 aa  58.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  25 
 
 
322 aa  58.2  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3061  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  27.08 
 
 
348 aa  58.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3224  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  24.71 
 
 
347 aa  57.8  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  24.69 
 
 
531 aa  57.8  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  27.42 
 
 
541 aa  57.8  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0553  peptidase M28  26.33 
 
 
384 aa  57.4  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>