296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0639 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0639  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  100 
 
 
300 aa  619  1e-176  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1517  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  64.51 
 
 
306 aa  402  1e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00419351  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  51.72 
 
 
293 aa  333  2e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0540  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  51.38 
 
 
293 aa  332  4e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1605  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit B  51.38 
 
 
293 aa  332  4e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.590604  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0376  CoB--CoM heterodisulfide reductase  51.03 
 
 
293 aa  328  5.0000000000000004e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0475  CoB--CoM heterodisulfide reductase  52.61 
 
 
300 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1516  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit B  52.26 
 
 
300 aa  323  2e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.479226  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0432  CoB--CoM heterodisulfide reductase  54.01 
 
 
299 aa  322  4e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0403  CoB--CoM heterodisulfide reductase  53.65 
 
 
300 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.148896  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0308  CoB--CoM heterodisulfide reductase  52.61 
 
 
297 aa  315  8e-85  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1837  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  50.17 
 
 
296 aa  306  3e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.213828  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0624  CoB--CoM heterodisulfide reductase  49.15 
 
 
300 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.022325  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2240  CoB/CoM heterodisulfide reductase, subunit B  49.83 
 
 
296 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.145621  normal  0.0183025 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0240  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  47.99 
 
 
308 aa  300  1e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.345806 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0589  CoB--CoM heterodisulfide reductase  49.49 
 
 
307 aa  296  2e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0867729  normal  0.0373464 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26920  heterodisulfide reductase, subunit B  36.39 
 
 
296 aa  196  4.0000000000000005e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0375  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.02 
 
 
291 aa  188  8e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1028  succinate dehydrogenase/fumarate reductase subunit C  36.52 
 
 
293 aa  179  7e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.288715  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0440  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  36.68 
 
 
292 aa  179  7e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0357  CoB--CoM heterodisulfide reductase  33.45 
 
 
284 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0286  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.39 
 
 
282 aa  172  7.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.82153  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1352  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.96 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.472371 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2715  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.63 
 
 
282 aa  163  3e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06200  heterodisulfide reductase, subunit B  32.3 
 
 
297 aa  160  2e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.860836  hitchhiker  0.00110828 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1993  succinate/fumarate oxidoreductase, putative  33.68 
 
 
282 aa  160  2e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0129  succinate/fumarate oxidoreductase, putative  31.82 
 
 
282 aa  160  3e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.394033  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0250  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.28 
 
 
282 aa  157  1e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26914  normal  0.65671 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2342  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.28 
 
 
282 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0564  CoB--CoM heterodisulfide reductase  33.92 
 
 
283 aa  155  8e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0172  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.28 
 
 
290 aa  154  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2526  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.11 
 
 
302 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0310  succinate dehydrogenase subunit C  33.33 
 
 
282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.231375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3648  succinate dehydrogenase subunit C  31.76 
 
 
301 aa  153  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115665  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0175  succinate dehydrogenase subunit C  31.23 
 
 
282 aa  152  8.999999999999999e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1632  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.09 
 
 
301 aa  150  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0810  hypothetical protein  28.12 
 
 
299 aa  149  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000756552 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0675  succinate dehydrogenase subunit C  31.03 
 
 
290 aa  150  4e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0161488  hitchhiker  0.000830307 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1573  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.65 
 
 
281 aa  149  4e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2211  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.67 
 
 
303 aa  149  5e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0339635  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4068  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.54 
 
 
297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0453  succinate dehydrogenase subunit C  30.74 
 
 
301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2945  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.88 
 
 
297 aa  146  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3151  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.88 
 
 
297 aa  145  9e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00144336  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0637  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30 
 
 
303 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0945961 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0395  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.21 
 
 
462 aa  143  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.453445  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1881  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.87 
 
 
295 aa  143  4e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.983489  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1334  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.91 
 
 
286 aa  142  5e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1542  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.87 
 
 
306 aa  141  9.999999999999999e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0167563 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2104  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.13 
 
 
305 aa  137  2e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0862  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.1 
 
 
292 aa  137  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3582  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.66 
 
 
295 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1281  hypothetical protein  31.45 
 
 
285 aa  137  2e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0150  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.66 
 
 
295 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0819  CoB--CoM heterodisulfide reductase  27.21 
 
 
294 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.130606 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0091  heterodisulfide reductase subunit  31.36 
 
 
296 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1954  heterodisulfide reductase, subunit B  28.81 
 
 
314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1701  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.58 
 
 
288 aa  136  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000396629 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1435  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.13 
 
 
278 aa  135  9e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.125924  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2178  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.24 
 
 
303 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000377327 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2550  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, C subunit  29.24 
 
 
303 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187993  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3573  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.79 
 
 
294 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0634  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.33 
 
 
290 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4093  hypothetical protein  30.33 
 
 
296 aa  132  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.883836  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3425  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  30.93 
 
 
296 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0490  succinate dehydrogenase, C subunit  31.1 
 
 
285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0465  succinate dehydrogenase, C subunit  30.74 
 
 
285 aa  129  4.0000000000000003e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0849  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.39 
 
 
294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0688989  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2343  CoB--CoM heterodisulfide reductase  27.46 
 
 
305 aa  126  5e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.50274  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3525  heterodisulfide reductase, B subunit  29.86 
 
 
308 aa  125  7e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1077  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.74 
 
 
320 aa  125  8.000000000000001e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0320251  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0428  succinate dehydrogenase subunit C  27.6 
 
 
295 aa  125  9e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1645  heterodisulfide reductase, B subunit  28 
 
 
303 aa  122  5e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0422083  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0031  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.37 
 
 
317 aa  122  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0030  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.19 
 
 
317 aa  122  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2099  CoB--CoM heterodisulfide reductase  27.42 
 
 
306 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0323  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.68 
 
 
326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.557922 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3676  CoB--CoM heterodisulfide reductase  27.5 
 
 
300 aa  120  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1349  CoB--CoM heterodisulfide reductase  25.52 
 
 
293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.543015 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0827  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.04 
 
 
334 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.247627  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0976  CoB--CoM heterodisulfide reductase  27.06 
 
 
296 aa  119  9e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.161405  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5286  CoB--CoM heterodisulfide reductase  25.94 
 
 
304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1208  succinate dehydrogenase subunit C  28.08 
 
 
299 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17760  heterodisulfide reductase, subunit B  27.43 
 
 
349 aa  114  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1251  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.23 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.684126  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1108  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  28.79 
 
 
502 aa  114  3e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.785263  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1326  hypothetical protein  26.3 
 
 
281 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0197  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.64 
 
 
300 aa  110  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2316  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.64 
 
 
300 aa  110  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1201  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.52 
 
 
508 aa  108  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0710444  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  28.79 
 
 
497 aa  108  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1261  CoB--CoM heterodisulfide reductase  28.68 
 
 
502 aa  106  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1195  hypothetical protein  30.18 
 
 
290 aa  104  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2664  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.14 
 
 
276 aa  104  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0416  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.07 
 
 
302 aa  103  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.373291 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1160  CoB--CoM heterodisulfide reductase  24.07 
 
 
295 aa  97.1  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1028  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  28.04 
 
 
502 aa  94.4  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00356665  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1698  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.89 
 
 
348 aa  93.2  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000111757 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2100  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.35 
 
 
437 aa  81.3  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1805  hypothetical protein  25.6 
 
 
281 aa  78.2  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.852192 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>