194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0630 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0630  precorrin-8X methylmutase  100 
 
 
245 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.872392  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2355  precorrin-8X methylmutase  65.31 
 
 
249 aa  322  4e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000155393  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1081  precorrin-8X methylmutase  57.84 
 
 
220 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1718  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  61.98 
 
 
217 aa  241  9e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0513  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  58.74 
 
 
226 aa  235  6e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0586805  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3214  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  53.43 
 
 
211 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1225  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  55.22 
 
 
221 aa  216  2e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.547545  normal  0.86502 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0143  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  53 
 
 
209 aa  206  3e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0015  precorrin-8X methylmutase  40.28 
 
 
212 aa  143  2e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1341  precorrin-8X methylmutase  39.34 
 
 
210 aa  141  9e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0621  precorrin-8X methylmutase  40.28 
 
 
210 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.517297  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1303  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  38.78 
 
 
212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1332  precorrin-8X methylmutase  39.81 
 
 
212 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0538013  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1343  precorrin-8X methylmutase  39.34 
 
 
212 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.212659  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3460  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  38.25 
 
 
238 aa  135  5e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1004  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  36.87 
 
 
254 aa  133  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1858  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  39.05 
 
 
281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.240156 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2136  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  36.87 
 
 
224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0350382 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0697  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  39.9 
 
 
205 aa  125  6e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2706  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  36.52 
 
 
207 aa  122  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0197172  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0317  precorrin-8X methylmutase  35.12 
 
 
224 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0480  precorrin isomerase, CbiC-like  35.82 
 
 
225 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0080  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  37.02 
 
 
213 aa  119  3e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.52758 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3654  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  38.64 
 
 
228 aa  119  6e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1898  precorrin-8X methylmutase  38.5 
 
 
208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171358  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2320  precorrin-8X methylmutase  38.42 
 
 
209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.415646  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0567  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  38.12 
 
 
222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0642  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  38.67 
 
 
222 aa  116  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3117  precorrin-8X methylmutase  37.38 
 
 
230 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7175  precorrin-8X methylmutase  37.63 
 
 
210 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894546  normal  0.0915035 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0308  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  39.15 
 
 
207 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2555  precorrin-8X methylmutase  41.24 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3178  precorrin-8X methylmutase  38.19 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.333659  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4876  precorrin-8X methylmutase  38.58 
 
 
208 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3376  precorrin-8X methylmutase  37.24 
 
 
221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.218633 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5060  precorrin-8X methylmutase  35.75 
 
 
211 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341493 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1298  Precorrin-8X methylmutase  39.88 
 
 
207 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00456818 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4416  precorrin-8X methylmutase  38.58 
 
 
208 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2613  Precorrin-8X methylmutase  38.46 
 
 
215 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2817  precorrin-8X methylmutase  37.56 
 
 
210 aa  112  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_004310  BR1287  precorrin-8X methylmutase  38 
 
 
208 aa  111  9e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1349  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  41.61 
 
 
222 aa  111  9e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5593  Precorrin-8X methylmutase  42.95 
 
 
208 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  0.278794 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0152  Precorrin-8X methylmutase  38.04 
 
 
215 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0342  precorrin-8X methylmutase  37.5 
 
 
220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.470855  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6020  precorrin-8X methylmutase  38.14 
 
 
210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00161417  normal  0.19604 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3134  precorrin-8X methylmutase  37.93 
 
 
217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.688258 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17660  precorrin-8X methylmutase  35.51 
 
 
221 aa  110  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0262485  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03744  putative transmembrane protein  36.47 
 
 
534 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1573  precorrin-8X methylmutase  37.23 
 
 
208 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.377269  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2081  precorrin-8X methylmutase  37.57 
 
 
218 aa  110  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1250  precorrin-8X methylmutase  37.5 
 
 
208 aa  110  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3509  precorrin-8X methylmutase  37.31 
 
 
209 aa  109  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400984  normal  0.540092 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1244  precorrin-8X methylmutase  37.23 
 
 
208 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0926514  normal  0.29626 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1477  precorrin-8X methylmutase  34.31 
 
 
201 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1269  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  38.15 
 
 
219 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4823  precorrin-8X methylmutase  36.7 
 
 
208 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.183427 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1591  precorrin-8X methylmutase  36.7 
 
 
208 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.257981 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1553  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  37.76 
 
 
215 aa  106  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.160219  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0119  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  34.86 
 
 
332 aa  106  4e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1097  precorrin-8X methylmutase  34.15 
 
 
210 aa  105  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1193  precorrin-8X methylmutase  36.7 
 
 
208 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0208289  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1646  precorrin-8X methylmutase  36.7 
 
 
208 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.996028  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1673  precorrin-8X methylmutase  36.7 
 
 
208 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0355413  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1625  Precorrin-8X methylmutase  35.24 
 
 
221 aa  104  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2399  precorrin-8X methylmutase  38.61 
 
 
208 aa  104  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.154427  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1435  precorrin-8X methylmutase  35.12 
 
 
209 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.170002  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1241  precorrin-8X methylmutase  35.12 
 
 
209 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.189427  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1434  Precorrin-8X methylmutase  39.2 
 
 
210 aa  104  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.656935  normal  0.667092 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2360  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  38.46 
 
 
520 aa  103  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5850  precorrin-8X methylmutase  36.08 
 
 
209 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1382  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  38.55 
 
 
214 aa  104  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1888  precorrin-8X methylmutase  37.63 
 
 
209 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1504  precorrin-8X methylmutase  33.99 
 
 
200 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1712  Precorrin-8X methylmutase  39.2 
 
 
210 aa  102  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.61701  hitchhiker  0.00790463 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2212  precorrin-8X methylmutase  39.05 
 
 
209 aa  102  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0605  precorrin-8X methylmutase  36.7 
 
 
208 aa  102  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.414575  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1437  precorrin-8X methylmutase  39.2 
 
 
210 aa  102  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.226548  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0575  Precorrin-8X methylmutase  33.85 
 
 
206 aa  102  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204948  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4572  precorrin-8X methylmutase  37.19 
 
 
208 aa  102  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0033  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  37.29 
 
 
213 aa  102  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3144  precorrin-8X methylmutase  35.11 
 
 
212 aa  102  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0927  Precorrin-8X methylmutase  39.27 
 
 
204 aa  102  8e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000290763 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1691  precorrin-8X methylmutase  34.42 
 
 
225 aa  101  9e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.188396 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4475  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.76 
 
 
451 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253543  normal  0.0484497 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2380  precorrin-8X methylmutase  37.38 
 
 
209 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2929  precorrin-8X methylmutase  34.98 
 
 
209 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.451647  hitchhiker  0.00280569 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1520  precorrin-8X methylmutase  35.41 
 
 
219 aa  99.8  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548658  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5370  precorrin-8X methylmutase  36.7 
 
 
208 aa  99.8  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218381  normal  0.626073 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1285  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  36.92 
 
 
211 aa  99.8  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.808372  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0965  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  36.21 
 
 
213 aa  99.4  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.519287  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1782  Precorrin-8X methylmutase  34.33 
 
 
208 aa  99.4  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.140584  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3146  precorrin-8X methylmutase  35.82 
 
 
210 aa  99.4  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.757727  normal  0.930234 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0027  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  36.31 
 
 
230 aa  99  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.615155  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2999  precorrin-8X methylmutase  40.11 
 
 
213 aa  98.2  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.540254  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1569  precorrin-8X methylmutase  36.7 
 
 
208 aa  97.8  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0892973 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1949  precorrin-8X methylmutase  36.7 
 
 
208 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0695491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1966  precorrin-8X methylmutase  36.7 
 
 
208 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.000701969  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4618  precorrin-8X methylmutase  34.76 
 
 
208 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2249  precorrin-8X methylmutase  36.9 
 
 
208 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.668584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>