More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0627 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0627  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-4 C11-methyltransferase  100 
 
 
242 aa  491  9.999999999999999e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2358  precorrin-4 C11-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  74.69 
 
 
243 aa  363  1e-99  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0510  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  57.45 
 
 
238 aa  267  1e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0146  precorrin-4 C11-methyltransferase  61.21 
 
 
245 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.448492  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1721  Precorrin-4 C(11)-methyltransferase  54.04 
 
 
240 aa  262  4e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1078  hypothetical protein  55.08 
 
 
237 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3211  precorrin-4 C11-methyltransferase  56.6 
 
 
238 aa  248  5e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1228  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  55.51 
 
 
248 aa  240  1e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0962  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.58 
 
 
254 aa  231  6e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.6045  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0994  Precorrin-4 C(11)-methyltransferase  51.26 
 
 
299 aa  229  2e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1342  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.79 
 
 
254 aa  227  2e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3476  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  48.36 
 
 
290 aa  225  6e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1747  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.08 
 
 
254 aa  223  2e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.129763  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1011  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.92 
 
 
254 aa  223  3e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.04114  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.08 
 
 
254 aa  220  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.23833  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1872  Precorrin-4 C(11)-methyltransferase  49.37 
 
 
287 aa  217  1e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1298  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.58 
 
 
261 aa  205  6e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1092  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.74 
 
 
254 aa  205  7e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0614  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.12 
 
 
249 aa  203  2e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00328163  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1716  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.19 
 
 
253 aa  202  4e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1236  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.38 
 
 
251 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2198  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.4 
 
 
257 aa  198  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.333099  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0039  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.89 
 
 
258 aa  198  6e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2205  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.4 
 
 
257 aa  198  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0059  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.46 
 
 
256 aa  197  9e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1430  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.96 
 
 
251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0323621  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2151  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.98 
 
 
257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0163963  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2364  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.98 
 
 
257 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2251  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.98 
 
 
257 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.476505  normal  0.353064 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0313  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.8 
 
 
251 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0483  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.87 
 
 
258 aa  192  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2994  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.52 
 
 
264 aa  191  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1013  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.7 
 
 
253 aa  190  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1376  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.93 
 
 
252 aa  190  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0933  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.26 
 
 
260 aa  189  5e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00452437 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3607  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.49 
 
 
261 aa  188  5.999999999999999e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1265  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.98 
 
 
267 aa  187  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0473  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.44 
 
 
252 aa  186  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3541  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.49 
 
 
261 aa  186  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0702  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.74 
 
 
244 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1578  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.49 
 
 
242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00147705  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1596  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.92 
 
 
242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.727098  normal  0.416998 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1375  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.8 
 
 
257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0286247 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1294  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.8 
 
 
248 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.04031 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1564  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.3 
 
 
242 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253118  normal  0.214845 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1651  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.35 
 
 
242 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1198  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.35 
 
 
242 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1678  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.35 
 
 
242 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0635313  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4829  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.93 
 
 
242 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0449828 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2129  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.62 
 
 
259 aa  178  8e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000738255 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2394  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.49 
 
 
241 aa  177  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3231  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.07 
 
 
258 aa  177  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00900029  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3139  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.44 
 
 
243 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103399  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1955  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.93 
 
 
241 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132176  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1972  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.93 
 
 
241 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2117  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.93 
 
 
241 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.105353  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5365  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.28 
 
 
241 aa  176  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.973627 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1853  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.44 
 
 
247 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2711  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.51 
 
 
248 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1272  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.18 
 
 
251 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0901  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.1 
 
 
241 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324814  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1157  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.1 
 
 
241 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917528  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0259  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.1 
 
 
241 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1598  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.1 
 
 
241 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00151458  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.7 
 
 
250 aa  172  5.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0571  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.7 
 
 
272 aa  172  5.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505536  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0638  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.29 
 
 
271 aa  171  6.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1249  precorrin-4 C11-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  42.19 
 
 
241 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.230063  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3650  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.15 
 
 
252 aa  170  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.796321  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3103  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.91 
 
 
248 aa  169  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0114  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.27 
 
 
262 aa  167  1e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177043  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0050  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.24 
 
 
255 aa  167  2e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2213  precorrin-3 methylase  41.77 
 
 
250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25920  precorrin-3 methylase  42.62 
 
 
250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0297541  normal  0.071417 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1288  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.97 
 
 
626 aa  166  4e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1557  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.39 
 
 
256 aa  165  5e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2087  precorrin-3 methylase  40.08 
 
 
257 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3020  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.1 
 
 
249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.157987 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4589  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.83 
 
 
251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120449  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2609  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.42 
 
 
257 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4477  precorrin-4 C11-methyltransferase  36.97 
 
 
610 aa  163  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00717843  normal  0.120162 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7180  precorrin-4 C11-methyltransferase  36.89 
 
 
252 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.987588  normal  0.0970048 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3154  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.1 
 
 
249 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.134288  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1014  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.18 
 
 
626 aa  162  6e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0301  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.52 
 
 
260 aa  161  7e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0342995  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3384  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.16 
 
 
253 aa  159  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215023  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0211  cobalamin biosynthesis protein CbiG/precorrin-4 C11-methyltransferase  40.35 
 
 
614 aa  158  9e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2501  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.04 
 
 
251 aa  157  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.218572 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6025  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.3 
 
 
252 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0102106  normal  0.375652 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2779  precorrin-4 C11-methyltransferase  39 
 
 
250 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3184  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.42 
 
 
259 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2374  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.33 
 
 
259 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0640  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.26 
 
 
257 aa  156  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.194872  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.08 
 
 
867 aa  155  5.0000000000000005e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1521  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.93 
 
 
261 aa  155  6e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000101409 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3737  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.15 
 
 
275 aa  155  8e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0808  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.5 
 
 
254 aa  154  9e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1229  precorrin-4 C11-methyltransferase  35.42 
 
 
264 aa  154  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0594011 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2357  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.59 
 
 
259 aa  152  4e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.342045  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2446  precorrin-4 C11-methyltransferase  36.13 
 
 
261 aa  152  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130726  normal  0.124304 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>