32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0621 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0621  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 161 aa  324  3e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2112  XRE family transcriptional regulator  53.66 
 
 		 164 aa  165  2e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.79317  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0459  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 165 aa  128  3e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1037  XRE family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 172 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.223775  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1304  helix-turn-helix domain-containing protein  42.24 
 
 		 163 aa  120  6e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1462  helix-turn-helix domain-containing protein  40.72 
 
 		 170 aa  118  3e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.217714  normal  0.212223 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0938  transcriptional regulator, XRE family  39.64 
 
 		 162 aa  113  8.999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.117119  normal  0.710013 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1025  XRE family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 158 aa  99.8  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1032  helix-turn-helix domain-containing protein  36.97 
 
 		 162 aa  99.4  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0360  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 181 aa  99.8  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0919  helix-turn-helix domain-containing protein  37.58 
 
 		 158 aa  95.5  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.960971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1173  XRE family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 177 aa  92.4  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.359549 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1762  XRE family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 159 aa  91.7  4e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1076  XRE family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 161 aa  89.7  1e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2372  transcriptional regulator, XRE family  33.53 
 
 		 173 aa  89.4  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0686  transcriptional regulator, XRE family  34.08 
 
 		 177 aa  89.4  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0112  helix-turn-helix domain-containing protein  33.52 
 
 		 182 aa  89  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.1301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0037  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 161 aa  87.4  8e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0604  transcriptional regulator, XRE family  35.14 
 
 		 183 aa  87  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196411  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1903  transcriptional regulator, XRE family  32.97 
 
 		 182 aa  85.1  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2145  XRE family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 161 aa  84.3  6e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0034  XRE family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00826547 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1419  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 		 178 aa  78.6  0.00000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0951  helix-turn-helix domain-containing protein  38.04 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1247  transcriptional regulator, XRE family  32.5 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.797623  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0707  helix-turn-helix domain-containing protein  28.77 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.866911  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2276  XRE family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5790  XRE family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.902407  hitchhiker  0.00485473 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1892  transcriptional regulator, XRE family  32.26 
 
 		 89 aa  43.9  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.883347  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0072  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 73 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5130  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  32.84 
 
 		 188 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.87177  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2780  transcriptional regulator, XRE family  28 
 
 		 152 aa  40.8  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182016  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>