265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0601 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0601  putative ABC-2 type transport system permease protein  100 
 
 		 347 aa  679    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  20.77 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  23.06 
 
 		 370 aa  82.8  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  25.99 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3252  ABC-2 type transporter  23.47 
 
 		 375 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2863  ABC transporter, permease protein, putative  24.92 
 
 		 371 aa  77.4  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.633584  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2484  ABC-2 type transporter  24.92 
 
 		 371 aa  77.4  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  21.47 
 
 		 368 aa  75.1  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  22.09 
 
 		 381 aa  72.8  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2903  ABC-2 type transporter  23.97 
 
 		 368 aa  73.2  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.751562  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2815  ABC transporter, permease protein  23.97 
 
 		 368 aa  73.2  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3002  ABC-2 type transporter  22.85 
 
 		 375 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2671  ABC-2 type transporter  24.25 
 
 		 372 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000231405  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  25.72 
 
 		 384 aa  71.6  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  24.85 
 
 		 373 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  23.2 
 
 		 384 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.69 
 
 		 384 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  23.2 
 
 		 384 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  22.28 
 
 		 377 aa  68.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2837  ABC-2 type transporter  21.53 
 
 		 370 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.273381  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0114  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  20.45 
 
 		 357 aa  68.2  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3039  hypothetical protein  23.86 
 
 		 382 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5640  ABC-2 type transporter  24.12 
 
 		 368 aa  67.4  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  24.66 
 
 		 368 aa  67  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  24.41 
 
 		 370 aa  67  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  22.19 
 
 		 382 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3069  ABC-2 type transporter  22.79 
 
 		 373 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.669525  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0131  ABC-2 type transporter  21.62 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.110874  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0910  ABC transporter permease  23.23 
 
 		 368 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  23.44 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  23.23 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0942  ABC-2 type transporter, permease  23.23 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0820172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0963  ABC-2 type transporter permease  23.23 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  23.18 
 
 		 378 aa  64.7  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  22.6 
 
 		 388 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0850  ABC-2 type transporter, permease protein  23.23 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1379  ABC-2 type transporter  20.12 
 
 		 370 aa  63.9  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.463817  hitchhiker  0.000000727606 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  21.32 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0255  ABC-2 type transporter  21.83 
 
 		 373 aa  64.3  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1047  ABC-2 type transporter  21.92 
 
 		 371 aa  63.9  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1017  ABC-2 type transporter  23.99 
 
 		 372 aa  63.9  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1477  ABC-2 type transporter  20.97 
 
 		 371 aa  63.5  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0856  ABC-2 type transporter, permease protein  22.67 
 
 		 368 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_123  ABC transporter, type 2, substrate-binding protein  20.17 
 
 		 357 aa  63.5  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  21.52 
 
 		 377 aa  63.2  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6564  ABC-2 type transporter  28.78 
 
 		 375 aa  63.2  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0919  ABC-2 type transporter  20.38 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1791  ABC-2 transporter component  24.22 
 
 		 376 aa  63.2  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.386865  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8101  ABC-2 type transporter  23.39 
 
 		 368 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4064  ABC-2 type transporter  22.97 
 
 		 371 aa  62.8  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00759  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  23.05 
 
 		 368 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  23.05 
 
 		 368 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0520  ABC-2 type transporter  25.99 
 
 		 349 aa  62.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  23.63 
 
 		 376 aa  62  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0939  ABC-2 type transporter, permease protein  23.05 
 
 		 368 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  23.05 
 
 		 368 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00776  hypothetical protein  23.05 
 
 		 368 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1268  multidrug ABC transporter permease component  24.07 
 
 		 372 aa  62.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0273495  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2851  ABC-2 type transporter  23.05 
 
 		 368 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5459  putative ABC transporter, permease protein  27.46 
 
 		 234 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00659493  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2393  ABC-2 type transporter  19.94 
 
 		 369 aa  62  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4676  ABC-2 type transporter  23.5 
 
 		 379 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  23.16 
 
 		 376 aa  62.4  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  23.05 
 
 		 368 aa  62.8  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  21.66 
 
 		 369 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  23.05 
 
 		 368 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0255  ABC-2 type transporter  19.61 
 
 		 357 aa  62.4  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  22.89 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5132  ABC transporter permease  27.98 
 
 		 234 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4983  ABC transporter, permease  28.43 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.209432  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5525  ABC transporter permease  27.98 
 
 		 234 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  22.12 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  24.27 
 
 		 368 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0504  ABC-2 type transporter  21.04 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0820778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  22.07 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1283  ABC-2 type transporter  22.9 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4965  ABC transporter, permease  27.98 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000124148  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2864  ABC transporter, permease protein, putative  20 
 
 		 369 aa  60.5  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141451  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  24.06 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2485  ABC-2 type transporter  20 
 
 		 369 aa  60.5  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5443  hypothetical protein  22.68 
 
 		 372 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889571 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  22.37 
 
 		 376 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1078  putative ABC transport system, membrane protein  21.97 
 
 		 373 aa  59.3  0.00000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5374  putative ABC transporter, permease protein  27.98 
 
 		 234 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0186467 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5546  ABC-2 type transporter  27.71 
 
 		 235 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000580029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1302  ABC-2 type transporter  23.68 
 
 		 372 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1781  ABC transporter, inner membrane subunit  24.22 
 
 		 365 aa  58.9  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  24.17 
 
 		 378 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  20 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3040  hypothetical protein  21.61 
 
 		 371 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3003  ABC-2 type transporter  23.43 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1790  ABC-2 transporter component  19.65 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  24.83 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2726  ABC-2 type transporter  27.31 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3253  ABC-2 type transporter  24.75 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0790326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  21.02 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0364  ABC-2 type transporter  21.15 
 
 		 394 aa  57.4  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0341  ABC-2 type transporter  21.82 
 
 		 394 aa  57.4  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  22.03 
 
 		 380 aa  57  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  21.05 
 
 		 376 aa  57  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>