168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0549 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0549  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  275  2e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1934  hypothetical protein  65.89 
 
 
133 aa  185  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0108502  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1392  hypothetical protein  62.88 
 
 
152 aa  178  2e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0155  hypothetical protein  57.48 
 
 
130 aa  176  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2363  hypothetical protein  57.36 
 
 
130 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2508  protein of unknown function DUF35  58.59 
 
 
132 aa  169  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.347955  normal  0.395372 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0149  hypothetical protein  60.63 
 
 
129 aa  167  3e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1625  hypothetical protein  50 
 
 
130 aa  147  4e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  51.91 
 
 
134 aa  144  4.0000000000000006e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  48.44 
 
 
130 aa  143  8.000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  50.79 
 
 
129 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  47.66 
 
 
130 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0460  hypothetical protein  46.88 
 
 
130 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0490887  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0023  hypothetical protein  49.21 
 
 
130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0766  hypothetical protein  39.23 
 
 
135 aa  103  9e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.48862  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0428  hypothetical protein  41.6 
 
 
131 aa  99  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0261769  normal  0.146814 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0812  hypothetical protein  33.33 
 
 
134 aa  92  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.553396  hitchhiker  0.000113363 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1357  hypothetical protein  36.15 
 
 
132 aa  91.7  3e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1241  hypothetical protein  34.88 
 
 
137 aa  89.4  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0148077  normal  0.0127741 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0794  hypothetical protein  34.62 
 
 
133 aa  89  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0984  hypothetical protein  38.76 
 
 
132 aa  88.6  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1648  hypothetical protein  34.15 
 
 
135 aa  88.2  3e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1145  protein of unknown function DUF35  38.28 
 
 
133 aa  87.8  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0574924  hitchhiker  0.0000746026 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1083  hypothetical protein  34.11 
 
 
134 aa  80.9  0.000000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1609  protein of unknown function DUF35  30.95 
 
 
133 aa  77  0.00000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  35.14 
 
 
133 aa  71.2  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  36.28 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  35.42 
 
 
141 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  36.52 
 
 
137 aa  68.2  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  35.14 
 
 
136 aa  68.2  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  33.64 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  33.01 
 
 
137 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  32.74 
 
 
137 aa  67  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  32.69 
 
 
137 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5278  hypothetical protein  32.79 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  36.75 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  34.95 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  33.04 
 
 
131 aa  66.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3871  hypothetical protein  29.01 
 
 
131 aa  64.7  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  31.82 
 
 
319 aa  64.3  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  30.91 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1925  protein of unknown function DUF35  31.21 
 
 
474 aa  63.9  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0387  hypothetical protein  28.57 
 
 
129 aa  63.5  0.0000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.448785  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5112  hypothetical protein  34.65 
 
 
132 aa  63.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000923569  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4072  hypothetical protein  30.65 
 
 
142 aa  62.8  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  30.36 
 
 
137 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0351  hypothetical protein  32.52 
 
 
141 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000546433  hitchhiker  0.00000644081 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  35.65 
 
 
136 aa  61.6  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2152  hypothetical protein  30.43 
 
 
311 aa  60.8  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3214  hypothetical protein  31.62 
 
 
145 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.907218  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3276  hypothetical protein  31.62 
 
 
145 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3225  hypothetical protein  31.62 
 
 
145 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730825  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0436  protein of unknown function DUF35  29.03 
 
 
128 aa  60.5  0.000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.686015  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  30.63 
 
 
143 aa  60.1  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0458  hypothetical protein  29.9 
 
 
182 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3511  hypothetical protein  33.33 
 
 
131 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  32.41 
 
 
132 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1903  hypothetical protein  33.03 
 
 
132 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.539737  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0836  hypothetical protein  28.87 
 
 
189 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1438  3-hydroxybutyryl-CoA epimerase  27.84 
 
 
576 aa  58.5  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.410853  normal  0.0151032 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  32.43 
 
 
139 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  34.29 
 
 
146 aa  58.2  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4017  hypothetical protein  36.45 
 
 
155 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188869  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  33.33 
 
 
132 aa  57.8  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  31.53 
 
 
148 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0582  hypothetical protein  33.03 
 
 
137 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00877368  normal  0.438267 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4422  protein of unknown function DUF35  30 
 
 
474 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00766931  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0892  hypothetical protein  32.14 
 
 
142 aa  54.7  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.204366  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  28.32 
 
 
140 aa  54.7  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4021  protein of unknown function DUF35  30.94 
 
 
481 aa  54.3  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.605764  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  33.66 
 
 
319 aa  54.3  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  30.93 
 
 
138 aa  53.9  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0397  hypothetical protein  30.68 
 
 
177 aa  53.5  0.0000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0597  protein of unknown function DUF35  37.21 
 
 
490 aa  53.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  32.2 
 
 
130 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2476  protein of unknown function DUF35  35.42 
 
 
134 aa  53.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.73466  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5500  hypothetical protein  31.58 
 
 
132 aa  52.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2623  hypothetical protein  33.68 
 
 
305 aa  53.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140164  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3932  protein of unknown function DUF35  32 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6630  hypothetical protein  34.86 
 
 
120 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0233518  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3973  hypothetical protein  37.08 
 
 
125 aa  52.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.370228 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2675  hypothetical protein  30.34 
 
 
417 aa  52.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0843  hypothetical protein  28.24 
 
 
145 aa  52  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  30.19 
 
 
321 aa  52  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4268  hypothetical protein  29.36 
 
 
140 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2378  hypothetical protein  40.3 
 
 
143 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.301734  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  27.36 
 
 
152 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  30.56 
 
 
541 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  27.36 
 
 
152 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0902  hypothetical protein  29.35 
 
 
140 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  35.56 
 
 
144 aa  50.4  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5539  hypothetical protein  31.46 
 
 
141 aa  50.1  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  26.42 
 
 
152 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1695  hypothetical protein  26.42 
 
 
152 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0530  hypothetical protein  26.42 
 
 
152 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1644  hypothetical protein  26.42 
 
 
152 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.982412  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0553  hypothetical protein  26.42 
 
 
152 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0635  hypothetical protein  26.42 
 
 
152 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525049  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  30.28 
 
 
550 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4194  protein of unknown function DUF35  27.34 
 
 
473 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.492043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>