More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0505 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  100 
 
 
574 aa  1164    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1188  glycosyl transferase family 2  43.57 
 
 
606 aa  440  9.999999999999999e-123  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.017563  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3029  glycosyl transferase family 2  42.17 
 
 
613 aa  436  1e-121  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.586376  normal  0.0326144 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0520  glycosyl transferase family 2  57.33 
 
 
238 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1598  glycosyl transferase family protein  51.75 
 
 
237 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0724  glycosyl transferase family protein  56 
 
 
239 aa  241  2e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0205855  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0693  glycosyl transferase family protein  49.78 
 
 
238 aa  236  9e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0904184  normal  0.159851 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1493  hypothetical protein  51.54 
 
 
238 aa  229  1e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.055606 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  26.01 
 
 
586 aa  171  3e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1494  hypothetical protein  34.88 
 
 
333 aa  169  2e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.060435 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0723  hypothetical protein  34.6 
 
 
326 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275507  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3989  glycosyl transferase family protein  36.94 
 
 
238 aa  159  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.246532  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1599  hypothetical protein  34.86 
 
 
319 aa  157  6e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2627  glycosyl transferase family 2  38.29 
 
 
412 aa  155  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.97683 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1939  glycosyl transferase family 2  40.08 
 
 
415 aa  153  7e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4696  GtrA family protein  37.29 
 
 
435 aa  151  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0902  GtrA family protein  37 
 
 
428 aa  147  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258028  normal  0.0796887 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1721  glycosyl transferase family 2  38.86 
 
 
424 aa  147  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2133  glycosyl transferase family protein  38.59 
 
 
410 aa  144  6e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00135556  hitchhiker  0.0086677 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0521  hypothetical protein  32.51 
 
 
325 aa  144  6e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6500  glycosyl transferase family protein  38.3 
 
 
496 aa  142  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.346473  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0318  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 
460 aa  142  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.163788  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2280  glycosyl transferase family protein  38.63 
 
 
409 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.851942  decreased coverage  0.00376489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6395  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  36.49 
 
 
402 aa  140  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0941641 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4426  glycosyl transferase family protein  37.33 
 
 
437 aa  139  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739527  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2268  glycosyl transferase family protein  36.44 
 
 
411 aa  139  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371965  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0439  GtrA family protein  37.21 
 
 
425 aa  138  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4506  glycosyl transferase family 2  37.79 
 
 
378 aa  138  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4090  glycosyl transferase family 2  36.84 
 
 
441 aa  138  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157958  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0828  glycosyl transferase family 2  38.91 
 
 
422 aa  137  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0194792  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5252  glycosyl transferase family 2  35.9 
 
 
416 aa  137  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1923  glycosyl transferase family 2  36.36 
 
 
266 aa  136  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0692  hypothetical protein  35.05 
 
 
326 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101924  normal  0.0824925 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3923  glycosyl transferase family protein  36.4 
 
 
421 aa  134  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.496701  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3997  glycosyl transferase family protein  36.4 
 
 
421 aa  134  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254168  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3938  glycosyl transferase family protein  36.4 
 
 
421 aa  134  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.24037 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0651  glycosyl transferase family protein  37.29 
 
 
333 aa  133  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3686  glycosyl transferase family 2  37.56 
 
 
326 aa  126  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.82646  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2367  family 2 glycosyl transferase  32.08 
 
 
389 aa  122  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00481537 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1049  glycosyl transferase family 2  31.72 
 
 
256 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0104  glycosyl transferase family 2  32.92 
 
 
255 aa  120  9e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2237  glycosyl transferase family protein  34.67 
 
 
267 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3213  glycosyl transferase family 2  31.28 
 
 
256 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.595641 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1758  glycosyltransferase  33.19 
 
 
259 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0505  glycosyl transferase family protein  29.87 
 
 
262 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1414  glycosyl transferase family protein  34.8 
 
 
276 aa  110  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402537 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0963  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
238 aa  110  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57548  UDP-glucose:dolichyl-phosphate glucosyltransferase  33.63 
 
 
325 aa  109  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.547807  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2693  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 
273 aa  104  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1701  glycosyl transferase family protein  32.21 
 
 
276 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0805319 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3994  glycosyl transferase family 2  28.82 
 
 
267 aa  102  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.117924  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  32.24 
 
 
298 aa  101  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2199  glycosyl transferase family 2  29.82 
 
 
289 aa  101  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0107343 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2595  glycosyl transferase family protein  31.56 
 
 
256 aa  100  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00230887  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1870  glycosyl transferase family protein  32.46 
 
 
237 aa  100  7e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5302  glycosyl transferase family protein  34.19 
 
 
380 aa  100  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157801  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1164  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
320 aa  99.4  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.164128  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1807  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.3 
 
 
248 aa  98.6  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0429  glycosyl transferase  30.11 
 
 
328 aa  97.8  4e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.541189  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0242  hypothetical protein  29.33 
 
 
253 aa  98.2  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000022045  hitchhiker  0.00000000126838 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5816  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.57 
 
 
247 aa  97.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1908  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.87 
 
 
780 aa  97.1  8e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2530  glycosyl transferase family protein  30.7 
 
 
231 aa  96.7  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
414 aa  96.7  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3137  glycosyl transferase family 2  31.11 
 
 
261 aa  95.5  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3591  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.51 
 
 
252 aa  95.5  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.221254  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3761  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 
251 aa  94.7  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000031938  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  29.06 
 
 
420 aa  95.1  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1123  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 
251 aa  94.7  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0761  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 
272 aa  95.1  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1878  glycosyl transferase family 2  26.09 
 
 
597 aa  95.1  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1442  glycosyl transferase family protein  29.22 
 
 
312 aa  94.4  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0076  glycosyl transferase family 2  30.38 
 
 
271 aa  92.4  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.737127 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2228  glycosyl transferase family protein  29.73 
 
 
229 aa  92.4  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000017115 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07715  dolichyl-phosphate beta-glucosyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08210)  30.94 
 
 
405 aa  92  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8176  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.17 
 
 
809 aa  92  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0506  glycosyl transferase  27.51 
 
 
332 aa  91.7  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641026  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87591  dolichol-P-mannose synthesis  27.23 
 
 
239 aa  91.7  3e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00511018 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0160  hypothetical protein  47.73 
 
 
391 aa  91.7  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16431  glycosyl transferase family protein  28.83 
 
 
321 aa  91.7  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.713365  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  27.34 
 
 
394 aa  89.7  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2145  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 
236 aa  89.7  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1980  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 
323 aa  89.4  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3118  glycosyl transferase family protein  30.17 
 
 
235 aa  89  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000616031  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0976  glycosyl transferase family 2  27.84 
 
 
430 aa  88.2  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1767  glycosyl transferase family 2  29.2 
 
 
331 aa  88.6  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0202  glycosyl transferase family protein  29.26 
 
 
257 aa  88.6  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.275779  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2184  glycosyl transferase family protein  27.56 
 
 
273 aa  88.6  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3870  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 
257 aa  88.2  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2281  glycosyl transferase family 2  32.39 
 
 
337 aa  87  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0390263  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 
411 aa  86.7  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3900  glycosyl transferase family protein  29.26 
 
 
254 aa  86.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0648  glycosyl transferase family protein  31.66 
 
 
340 aa  85.1  0.000000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0763  glycosyl transferase family 2  34.25 
 
 
250 aa  85.5  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.855183  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1880  glycosyl transferase family 2  28.19 
 
 
325 aa  85.1  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00309208 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2350  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.96 
 
 
248 aa  85.1  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4066  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
257 aa  85.1  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.766809  normal  0.229172 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0073  glycosyl transferase family 2  29.92 
 
 
232 aa  85.1  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2667  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.57 
 
 
257 aa  85.1  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2588  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.26 
 
 
245 aa  84.7  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0786175 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>