More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0482 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0482  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 		 447 aa  912    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.700906 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2416  gamma-glutamyl phosphate reductase  72.2 
 
 		 449 aa  676    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00821851  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1371  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.32 
 
 		 443 aa  488  1e-136  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.754028  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3394  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.05 
 
 		 443 aa  477  1e-133  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2209  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.5 
 
 		 445 aa  467  9.999999999999999e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2590  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.37 
 
 		 434 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0262  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.11 
 
 		 431 aa  444  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000913374  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2048  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.03 
 
 		 434 aa  438  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0557  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.4 
 
 		 432 aa  435  1e-121  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000588024  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0057  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.82 
 
 		 438 aa  437  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.944563  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2013  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.62 
 
 		 431 aa  437  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0170243  normal  0.240578 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2022  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.78 
 
 		 434 aa  438  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4304  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.18 
 
 		 433 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.710202  normal  0.487734 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1397  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.3 
 
 		 435 aa  425  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2594  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.28 
 
 		 432 aa  419  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2275  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  48.71 
 
 		 431 aa  417  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0718764  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19350  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  48.97 
 
 		 427 aa  405  1.0000000000000001e-112  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000458015 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06461  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.14 
 
 		 438 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0026  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.14 
 
 		 438 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.938682  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0590  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.95 
 
 		 436 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.291608  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1026  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.73 
 
 		 435 aa  387  1e-106  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.993795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0927  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.56 
 
 		 441 aa  383  1e-105  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06551  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.15 
 
 		 436 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.555624  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2265  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.37 
 
 		 431 aa  384  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.687785 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10601  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.91 
 
 		 434 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.107286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18451  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.87 
 
 		 438 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.96532 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06161  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.72 
 
 		 436 aa  381  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05799  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase (Eurofung)  46.28 
 
 		 456 aa  374  1e-102  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.22549  hitchhiker  0.00000000000409555 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2450  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.04 
 
 		 423 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2585  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.93 
 
 		 423 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000881796 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06461  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.49 
 
 		 436 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.328707  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3412  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.04 
 
 		 458 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3743  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.83 
 
 		 423 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1226  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.04 
 
 		 458 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.04 
 
 		 458 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0367  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.04 
 
 		 458 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2637  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.04 
 
 		 458 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3508  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.41 
 
 		 418 aa  367  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876636  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.79 
 
 		 423 aa  365  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.928975  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.76 
 
 		 418 aa  364  2e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2729  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.79 
 
 		 435 aa  363  4e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0552  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.31 
 
 		 423 aa  363  4e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0578  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.31 
 
 		 423 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.295302  normal  0.735276 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2662  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.27 
 
 		 418 aa  361  1e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00209734  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.34 
 
 		 418 aa  360  2e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0624  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.55 
 
 		 423 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90997  predicted protein  43.66 
 
 		 443 aa  361  2e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1214  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.25 
 
 		 423 aa  360  4e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.818935  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.76 
 
 		 418 aa  358  9.999999999999999e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0610  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.76 
 
 		 423 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0174  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.07 
 
 		 423 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0657  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.07 
 
 		 435 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.291837  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4369  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.04 
 
 		 421 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2129  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.07 
 
 		 434 aa  356  5e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0315956 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4811  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.52 
 
 		 423 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.41418 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4864  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.52 
 
 		 423 aa  356  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.797783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3644  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.4 
 
 		 416 aa  355  7.999999999999999e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0817389  normal  0.521871 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4686  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.76 
 
 		 423 aa  354  1e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.820899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0953  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.13 
 
 		 446 aa  354  2e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135756  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4829  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.83 
 
 		 421 aa  352  8e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3345  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.44 
 
 		 435 aa  352  8e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000234228  normal  0.0212307 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3199  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.06 
 
 		 418 aa  350  3e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000241705  unclonable  2.3922e-23 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0674  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.78 
 
 		 441 aa  350  3e-95  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3802  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.25 
 
 		 421 aa  349  7e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0090  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.3 
 
 		 418 aa  348  8e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12010  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.48 
 
 		 421 aa  348  9e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0482  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.93 
 
 		 429 aa  348  1e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13569  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1541  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  44.69 
 
 		 428 aa  348  1e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0892613  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.16 
 
 		 420 aa  348  1e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1102  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.21 
 
 		 421 aa  348  1e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0826689  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2417  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.69 
 
 		 418 aa  347  3e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00400511  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4131  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.35 
 
 		 418 aa  347  3e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000457014  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3862  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.29 
 
 		 418 aa  347  3e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.332079 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.33 
 
 		 418 aa  347  3e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3778  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.29 
 
 		 418 aa  346  4e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0020576  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06240  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase, putative  41.18 
 
 		 460 aa  345  6e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2980  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.75 
 
 		 426 aa  344  2e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08350  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.25 
 
 		 421 aa  344  2e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3751  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.59 
 
 		 430 aa  344  2e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2831  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.53 
 
 		 426 aa  342  5e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20532  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1520  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.11 
 
 		 414 aa  343  5e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2741  gamma-glutamyl phosphate reductase  43 
 
 		 426 aa  342  7e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2970  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.72 
 
 		 426 aa  342  7e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0188  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.87 
 
 		 419 aa  342  8e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.240991  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.98 
 
 		 418 aa  342  8e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2570  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.51 
 
 		 426 aa  342  9e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.968824 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4974  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.55 
 
 		 423 aa  341  1e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.126752  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4584  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.83 
 
 		 436 aa  341  1e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.792503 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1607  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  44.1 
 
 		 419 aa  340  2e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2276  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.28 
 
 		 427 aa  339  8e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616003  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0514  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.03 
 
 		 421 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2852  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.86 
 
 		 419 aa  337  2.9999999999999997e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204057  hitchhiker  0.000000132471 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1644  gamma-glutamyl phosphate reductase  40.86 
 
 		 419 aa  337  3.9999999999999995e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3377  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.34 
 
 		 423 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4018  hitchhiker  0.00000000120564 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1880  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.82 
 
 		 430 aa  335  1e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0579  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.1 
 
 		 423 aa  333  3e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0235  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.89 
 
 		 429 aa  332  9e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0322  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.57 
 
 		 433 aa  331  2e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0930114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3348  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  43 
 
 		 423 aa  331  2e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4545  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.72 
 
 		 426 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>