More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0468 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0468  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  519  1e-146  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0352  Methyltransferase type 11  43.2 
 
 
249 aa  223  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0543  Methyltransferase type 11  43.21 
 
 
247 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2762  Methyltransferase type 11  39.51 
 
 
265 aa  205  5e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  39.92 
 
 
258 aa  194  9e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0334  Methyltransferase type 11  38.11 
 
 
257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000194414  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0342  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 
252 aa  165  8e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04480  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.55 
 
 
263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.110079  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0474  hypothetical protein  35.45 
 
 
252 aa  124  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.47 
 
 
250 aa  119  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  30.98 
 
 
248 aa  113  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.78 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  31.05 
 
 
226 aa  109  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.91 
 
 
250 aa  108  7.000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0198  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.26 
 
 
252 aa  107  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.537911  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  40.16 
 
 
253 aa  106  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.44 
 
 
255 aa  106  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  36 
 
 
253 aa  105  9e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  34.93 
 
 
226 aa  104  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  33.54 
 
 
226 aa  103  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2026  Methyltransferase type 11  26.32 
 
 
261 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508606  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  42.62 
 
 
250 aa  102  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2248  Methyltransferase type 11  25.88 
 
 
261 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.586689  normal  0.376735 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3676  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.46 
 
 
230 aa  100  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0791082 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1222  methyltransferase  27.94 
 
 
272 aa  99  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.328239  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  36.91 
 
 
225 aa  97.8  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4417  methyltransferase type 11  29.07 
 
 
269 aa  97.8  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.587336 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0166  DNA topoisomerase VI subunit A-like protein  33.56 
 
 
257 aa  97.4  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0720  hypothetical protein  31.79 
 
 
234 aa  94.7  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4078  methyltransferase type 11  34.93 
 
 
259 aa  94.7  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  31.58 
 
 
244 aa  93.6  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.5 
 
 
155 aa  93.2  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  35.25 
 
 
262 aa  90.5  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  31.54 
 
 
210 aa  89.4  5e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1279  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.54 
 
 
253 aa  86.3  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1358  methyltransferase type 11  31.79 
 
 
271 aa  86.3  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2984  methyltransferase type 11  33.8 
 
 
227 aa  83.6  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452511  normal  0.396011 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  31.97 
 
 
212 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  37.62 
 
 
327 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  39.39 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  38.46 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  34.4 
 
 
280 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  36.08 
 
 
240 aa  69.3  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  35.34 
 
 
266 aa  69.3  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  37 
 
 
339 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  38 
 
 
349 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  33.62 
 
 
287 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  33.02 
 
 
275 aa  67.8  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  38 
 
 
354 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  38 
 
 
342 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  35.64 
 
 
328 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4556  methyltransferase type 11  31.55 
 
 
253 aa  67  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  36.17 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  38 
 
 
349 aa  65.9  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  38.78 
 
 
301 aa  65.9  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  40.21 
 
 
230 aa  65.9  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  34.31 
 
 
275 aa  65.5  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0345  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  34.34 
 
 
228 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935966  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0349  UbiE/COQ5 methyltransferase  39.64 
 
 
199 aa  65.5  0.0000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4655  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 
310 aa  64.7  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0904903  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  39.6 
 
 
337 aa  64.7  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  38.1 
 
 
261 aa  64.7  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1444  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  35.65 
 
 
219 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0474733  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2195  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  29.25 
 
 
213 aa  64.7  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.34 
 
 
232 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
229 aa  64.7  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1548  methyltransferase type 11  34.65 
 
 
225 aa  64.7  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0895  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.46 
 
 
220 aa  63.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195725 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0552  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 
247 aa  64.3  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  30.88 
 
 
211 aa  64.3  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 
272 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  37.86 
 
 
209 aa  64.3  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  31.09 
 
 
335 aa  63.5  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0461  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  26.53 
 
 
251 aa  63.2  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0492  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.46 
 
 
232 aa  63.5  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.578084 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  32.56 
 
 
225 aa  63.5  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  36 
 
 
341 aa  62.8  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0025  methyltransferase type 11  37.37 
 
 
213 aa  62.8  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2020  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.23 
 
 
236 aa  62.8  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  32.03 
 
 
280 aa  62.4  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.32 
 
 
232 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2360  Methyltransferase type 11  31.15 
 
 
201 aa  62.4  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.175254  hitchhiker  0.000000000902529 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4096  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.26 
 
 
251 aa  62.4  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2739  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, putative  31.15 
 
 
201 aa  62.4  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0350  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 
253 aa  62.4  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.21 
 
 
238 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0008  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  35.51 
 
 
199 aa  62.4  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.257422  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  32.19 
 
 
285 aa  62.4  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  30.37 
 
 
312 aa  62.4  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.21 
 
 
236 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 
337 aa  62.4  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2879  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 
341 aa  62.4  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0310  Methyltransferase type 11  28.47 
 
 
259 aa  62  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5461  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.4 
 
 
243 aa  62  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127944  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  27.66 
 
 
283 aa  62  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  34.86 
 
 
287 aa  61.6  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0301  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.33 
 
 
257 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  29.45 
 
 
411 aa  61.2  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1996  generic methyltransferase  31.31 
 
 
214 aa  61.2  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.181235 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>