More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0405 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0405  transporter  100 
 
 
403 aa  791    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.474552  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  61.33 
 
 
395 aa  423  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4137  major facilitator superfamily MFS_1  58.57 
 
 
389 aa  395  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  57.85 
 
 
405 aa  390  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  58.22 
 
 
397 aa  374  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  55.21 
 
 
415 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1473  major facilitator transporter  55.27 
 
 
389 aa  370  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3539  major facilitator superfamily MFS_1  56.94 
 
 
415 aa  368  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1108  major facilitator superfamily MFS_1  57.82 
 
 
396 aa  368  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3219  major facilitator superfamily MFS_1  61.24 
 
 
396 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3939  major facilitator superfamily MFS_1  58.76 
 
 
408 aa  345  8e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.798126  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  45.29 
 
 
399 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  45.55 
 
 
400 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  47.03 
 
 
404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  46.98 
 
 
399 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1204  major facilitator family transporter  46.21 
 
 
429 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0572721  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3082  major facilitator family transporter  46.79 
 
 
398 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0490  major facilitator family transporter  46.79 
 
 
398 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252914  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1408  major facilitator family transporter  46.79 
 
 
398 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.74121  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1404  major facilitator family transporter  46.79 
 
 
398 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0662  major facilitator family transporter  46.79 
 
 
398 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.633492  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1536  major facilitator family transporter  46.79 
 
 
429 aa  272  9e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  41.29 
 
 
383 aa  259  4e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6027  major facilitator transporter  46.34 
 
 
403 aa  260  4e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  43.28 
 
 
399 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  39.68 
 
 
394 aa  257  2e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5265  major facilitator superfamily MFS_1  48.21 
 
 
394 aa  257  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  43.01 
 
 
399 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  43.28 
 
 
399 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5193  major facilitator superfamily MFS_1  48.14 
 
 
394 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.380622 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  43.56 
 
 
385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4726  major facilitator transporter  47.85 
 
 
394 aa  252  7e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.445553  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4338  major facilitator transporter  45.93 
 
 
399 aa  250  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0748  major facilitator transporter  46.46 
 
 
399 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251921  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1229  major facilitator transporter  46.46 
 
 
399 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35258  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1203  major facilitator transporter  46.46 
 
 
399 aa  249  7e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.446653  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  43.01 
 
 
393 aa  248  9e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  44.23 
 
 
399 aa  248  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7086  major facilitator transporter  42.32 
 
 
390 aa  248  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1477  major facilitator transporter  43.24 
 
 
391 aa  246  4e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14668  hitchhiker  0.0000166249 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1111  major facilitator transporter  46.07 
 
 
399 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0153  major facilitator superfamily MFS_1  43.54 
 
 
419 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4478  major facilitator transporter  41.96 
 
 
407 aa  245  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.414241  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1112  major facilitator transporter  45.81 
 
 
399 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7258  major facilitator superfamily MFS_1  46.07 
 
 
407 aa  244  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173664  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2837  major facilitator family transporter  46.92 
 
 
398 aa  241  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  44.72 
 
 
403 aa  239  5e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  38.38 
 
 
403 aa  235  9e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2949  major facilitator transporter  45.71 
 
 
405 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.137006  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0185  major facilitator transporter  43.77 
 
 
410 aa  234  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.151586 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4363  major facilitator transporter  43.33 
 
 
403 aa  232  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5392  major facilitator transporter  44.32 
 
 
412 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0287626  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5469  major facilitator transporter  44.32 
 
 
412 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414502  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4800  major facilitator transporter  44.32 
 
 
412 aa  229  8e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  39.43 
 
 
405 aa  226  8e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  39.43 
 
 
405 aa  226  8e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  39.43 
 
 
405 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2920  major facilitator superfamily MFS_1  42.78 
 
 
389 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1297  major facilitator superfamily MFS_1  39.19 
 
 
410 aa  223  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.807255 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  36.96 
 
 
389 aa  222  9e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  36.96 
 
 
389 aa  222  9e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5352  major facilitator transporter  45.73 
 
 
410 aa  222  9e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660653  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4811  major facilitator transporter  45.45 
 
 
410 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439865  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0684  major facilitator family transporter  40 
 
 
400 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.837842  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  40.26 
 
 
406 aa  219  5e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  40.16 
 
 
394 aa  219  6e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0591  major facilitator family transporter  40 
 
 
400 aa  219  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1224  MFS permease  39.38 
 
 
415 aa  219  7e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  39.62 
 
 
394 aa  219  7.999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  40.16 
 
 
394 aa  219  8.999999999999998e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  40.16 
 
 
406 aa  219  8.999999999999998e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  38.21 
 
 
399 aa  219  8.999999999999998e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  40.16 
 
 
394 aa  219  8.999999999999998e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  38.21 
 
 
399 aa  219  8.999999999999998e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  40.16 
 
 
394 aa  219  8.999999999999998e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1982  major facilitator family transporter  40.11 
 
 
400 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21038  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  38.21 
 
 
399 aa  218  1e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2143  major facilitator transporter  44.38 
 
 
402 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  38.26 
 
 
405 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  40.16 
 
 
394 aa  218  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  38.36 
 
 
405 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  38.14 
 
 
405 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  40.7 
 
 
398 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3428  major facilitator family transporter  42.08 
 
 
399 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  44.69 
 
 
399 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  43.54 
 
 
402 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00295222  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2467  transporter, putative  42.08 
 
 
399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3465  MFS transporter  42.35 
 
 
405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3320  putative transporter  42.08 
 
 
399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3465  major facilitator family transporter  42.35 
 
 
399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2509  major facilitator superfamily MFS_1  39.79 
 
 
402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0386  putative transporter  42.08 
 
 
399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1246  putative transporter  42.08 
 
 
399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1738  major facilitator superfamily MFS_1  43.82 
 
 
402 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.567776  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4774  major facilitator superfamily MFS_1  43.93 
 
 
389 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2326  major facilitator transporter  40.16 
 
 
425 aa  213  5.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2534  major facilitator superfamily transporter  46.51 
 
 
417 aa  213  7e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2393  major facilitator superfamily drug efflux transporter  38.39 
 
 
404 aa  212  9e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988182  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1909  major facilitator superfamily MFS_1  40.27 
 
 
408 aa  212  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.765785  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  40.5 
 
 
399 aa  211  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>